PYR-41

别名: PYR41; PYR 41; PYR-41. 4-[4-[(5-硝基-2-呋喃基)亚甲基]-3,5-二氧代-1-吡唑烷基]苯甲酸乙酯;PYR41
目录号: V7655 纯度: ≥98%
PYR-41 是一种泛素激活酶抑制剂(UBE1 抑制剂)。
PYR-41 CAS号: 418805-02-4
产品类别: E1 Activating
产品仅用于科学研究,不针对患者销售
规格 价格 库存 数量
5mg
10mg
25mg
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250mg
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纯度: ≥98%

产品描述
PYR-41 是一种泛素激活酶抑制剂(UBE1 抑制剂)。 PYR-41 阻断泛素化反应,但矛盾的是导致高分子量泛素化蛋白的积累。 PYR-41 还介导特定蛋白激酶(Bcr-Abl、Jak2)的交联,以抑制其信号传导活性。 PYR-41 已在动物研究中证明具有抗肿瘤活性,部分选择性蛋白质交联可能代表影响癌症治疗的信号转导模块和泛素循环调节蛋白的另一种方法。 (Biochem Pharmacol. 2011 年 8 月 15 日;82(4):341-9。)(溶液中的 PYR-41 可能以 E- 和 Z- 异构体的混合物形式存在。根据条件,HPLC 可能会显示两个峰)。
生物活性&实验参考方法
靶点
E1(IC50: < 10 μM)
体外研究 (In Vitro)
PYR-41 不仅可以防止泛素化,还可以提高细胞中的总苏素化程度。 PYR-41 减少细胞因子介导的核因子-κB 激活。此外,PYR-41 还可阻止 IκBα 下游泛素化以及被蛋白酶分解。此外,PYR-41 还能刺激该肿瘤抑制因子的转录活性并防止 p53 被降解[1]。 PYR-41 (50 μM) 促进泛素化蛋白的积累。4 小时后,由于 PYR-41,Z138 细胞的 DUB 活性呈现浓度依赖性(10-50 μM)下降。即使在最低浓度 (10 μM) 的 PYR-41 下也能观察到对 USP5 DUB 活性的有效抑制。 PYR-41 可有效(10-50 μM)抑制多种 DUB 的活性,这些 DUB 已被鉴定为 USP9x、USP5、USP14、UCH37 和 UCH-L3。当 DTT 和 PYR-41 一起给予 Z138 细胞时,泛素化蛋白的积累被完全消除[2]。
酶活实验
将 32P-泛素与兔或小鼠 E1(约 250 ng)在 1× 反应缓冲液(50 mM Tris (pH 7.4)、0.2 mM ATP 和 0.5 mM MgCl2)中室温孵育 15 分钟。在进行孵育和反应之前,在某些实验中,His 标记的小鼠 E1 与 TALON 钴亲和树脂结合。将 1× 反应缓冲液中的珠子与小鼠 E1 和 32P-泛素混合,然后与 E1 反应类似地进行孵育。样品在非还原性 SDS-PAGE 样品缓冲液中加热后,通过 SDS-PAGE 进行解析。 Storm PhosphoImager 可视化具有泛素的硫酯。
参考文献

[1]. Inhibitors of ubiquitin-activating enzyme (E1), a new class of potential cancer therapeutics. Cancer Res. 2007 Oct 1;67(19):9472-81.

[2]. Protein cross-linking as a novel mechanism of action of a ubiquitin-activating enzyme inhibitor with anti-tumor activity. Biochem Pharmacol. 2011 Aug 15;82(4):341-9.

其他信息
PYR-41 is an ethyl ester resulting from the formal condensation of the carboxy group of 4-{4-[(5-nitrofuran-2-yl)methylidene]-3,5-dioxopyrazolidin-1-yl}benzoic acid with ethanol. It is an irreversible and cell-permeable inhibitor of ubiquitin-activating enzyme E1. It has a role as an EC 6.2.1.45 (E1 ubiquitin-activating enzyme) inhibitor and an antineoplastic agent. It is an ethyl ester, a member of furans, a C-nitro compound, a member of pyrazolidines and a benzoate ester.
*注: 文献方法仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些方法的准确性
化学信息 & 存储运输条件
分子式
C17H13N3O7
分子量
371.30102
精确质量
371.075
元素分析
C, 54.99; H, 3.53; N, 11.32; O, 30.16
CAS号
418805-02-4
相关CAS号
418805-02-4
PubChem CID
5335621
外观&性状
Brown solid powder
密度
1.5±0.1 g/cm3
折射率
1.652
LogP
2.87
tPSA
134.67
氢键供体(HBD)数目
1
氢键受体(HBA)数目
7
可旋转键数目(RBC)
5
重原子数目
27
分子复杂度/Complexity
664
定义原子立体中心数目
0
SMILES
O1C(=C([H])C([H])=C1/C(/[H])=C1/C(N([H])N(C/1=O)C1C([H])=C([H])C(C(=O)OC([H])([H])C([H])([H])[H])=C([H])C=1[H])=O)[N+](=O)[O-]
InChi Key
ARGIPZKQJGFSGQ-LCYFTJDESA-N
InChi Code
InChI=1S/C17H13N3O7/c1-2-26-17(23)10-3-5-11(6-4-10)19-16(22)13(15(21)18-19)9-12-7-8-14(27-12)20(24)25/h3-9H,2H2,1H3,(H,18,21)/b13-9-
化学名
ethyl 4-(4-((5-nitrofuran-2-yl)methylene)-3,5-dioxopyrazolidin-1-yl)benzoate
别名
PYR41; PYR 41; PYR-41.
HS Tariff Code
2934.99.9001
存储方式

Powder      -20°C    3 years

                     4°C     2 years

In solvent   -80°C    6 months

                  -20°C    1 month

运输条件
Room temperature (This product is stable at ambient temperature for a few days during ordinary shipping and time spent in Customs)
溶解度数据
溶解度 (体外实验)
DMSO : 46~74 mg/mL ( 123.89~199.29 mM )
溶解度 (体内实验)
配方 1 中的溶解度: ≥ 2.5 mg/mL (6.73 mM) (饱和度未知) in 10% DMSO + 40% PEG300 + 5% Tween80 + 45% Saline (这些助溶剂从左到右依次添加,逐一添加), 澄清溶液。
例如,若需制备1 mL的工作液,可将100 μL 25.0 mg/mL澄清DMSO储备液加入到400 μL PEG300中,混匀;然后向上述溶液中加入50 μL Tween-80,混匀;加入450 μL生理盐水定容至1 mL。
*生理盐水的制备:将 0.9 g 氯化钠溶解在 100 mL ddH₂O中,得到澄清溶液。

配方 2 中的溶解度: 2% DMSO + 30% PEG300 + 5% Tween80 + 63% ddH2O: 2mg/ml

请根据您的实验动物和给药方式选择适当的溶解配方/方案:
1、请先配制澄清的储备液(如:用DMSO配置50 或 100 mg/mL母液(储备液));
2、取适量母液,按从左到右的顺序依次添加助溶剂,澄清后再加入下一助溶剂。以 下列配方为例说明 (注意此配方只用于说明,并不一定代表此产品 的实际溶解配方):
10% DMSO → 40% PEG300 → 5% Tween-80 → 45% ddH2O (或 saline);
假设最终工作液的体积为 1 mL, 浓度为5 mg/mL: 取 100 μL 50 mg/mL 的澄清 DMSO 储备液加到 400 μL PEG300 中,混合均匀/澄清;向上述体系中加入50 μL Tween-80,混合均匀/澄清;然后继续加入450 μL ddH2O (或 saline)定容至 1 mL;

3、溶剂前显示的百分比是指该溶剂在最终溶液/工作液中的体积所占比例;
4、 如产品在配制过程中出现沉淀/析出,可通过加热(≤50℃)或超声的方式助溶;
5、为保证最佳实验结果,工作液请现配现用!
6、如不确定怎么将母液配置成体内动物实验的工作液,请查看说明书或联系我们;
7、 以上所有助溶剂都可在 Invivochem.cn网站购买。
制备储备液 1 mg 5 mg 10 mg
1 mM 2.6932 mL 13.4662 mL 26.9324 mL
5 mM 0.5386 mL 2.6932 mL 5.3865 mL
10 mM 0.2693 mL 1.3466 mL 2.6932 mL

1、根据实验需要选择合适的溶剂配制储备液 (母液):对于大多数产品,InvivoChem推荐用DMSO配置母液 (比如:5、10、20mM或者10、20、50 mg/mL浓度),个别水溶性高的产品可直接溶于水。产品在DMSO 、水或其他溶剂中的具体溶解度详见上”溶解度 (体外)”部分;

2、如果您找不到您想要的溶解度信息,或者很难将产品溶解在溶液中,请联系我们;

3、建议使用下列计算器进行相关计算(摩尔浓度计算器、稀释计算器、分子量计算器、重组计算器等);

4、母液配好之后,将其分装到常规用量,并储存在-20°C或-80°C,尽量减少反复冻融循环。

计算器

摩尔浓度计算器可计算特定溶液所需的质量、体积/浓度,具体如下:

  • 计算制备已知体积和浓度的溶液所需的化合物的质量
  • 计算将已知质量的化合物溶解到所需浓度所需的溶液体积
  • 计算特定体积中已知质量的化合物产生的溶液的浓度
使用摩尔浓度计算器计算摩尔浓度的示例如下所示:
假如化合物的分子量为350.26 g/mol,在5mL DMSO中制备10mM储备液所需的化合物的质量是多少?
  • 在分子量(MW)框中输入350.26
  • 在“浓度”框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在“体积”框中输入5,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案17.513 mg出现在“质量”框中。以类似的方式,您可以计算体积和浓度。

稀释计算器可计算如何稀释已知浓度的储备液。例如,可以输入C1、C2和V2来计算V1,具体如下:

制备25毫升25μM溶液需要多少体积的10 mM储备溶液?
使用方程式C1V1=C2V2,其中C1=10mM,C2=25μM,V2=25 ml,V1未知:
  • 在C1框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在C2框中输入25,然后选择正确的单位(μM)
  • 在V2框中输入25,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案62.5μL(0.1 ml)出现在V1框中
g/mol

分子量计算器可计算化合物的分子量 (摩尔质量)和元素组成,具体如下:

注:化学分子式大小写敏感:C12H18N3O4  c12h18n3o4
计算化合物摩尔质量(分子量)的说明:
  • 要计算化合物的分子量 (摩尔质量),请输入化学/分子式,然后单击“计算”按钮。
分子质量、分子量、摩尔质量和摩尔量的定义:
  • 分子质量(或分子量)是一种物质的一个分子的质量,用统一的原子质量单位(u)表示。(1u等于碳-12中一个原子质量的1/12)
  • 摩尔质量(摩尔重量)是一摩尔物质的质量,以g/mol表示。
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配液计算器可计算将特定质量的产品配成特定浓度所需的溶剂体积 (配液体积)

  • 输入试剂的质量、所需的配液浓度以及正确的单位
  • 单击“计算”按钮
  • 答案显示在体积框中
动物体内实验配方计算器(澄清溶液)
第一步:请输入基本实验信息(考虑到实验过程中的损耗,建议多配一只动物的药量)
第二步:请输入动物体内配方组成(配方适用于不溶/难溶于水的化合物),不同的产品和批次配方组成不同,如对配方有疑问,可先联系我们提供正确的体内实验配方。此外,请注意这只是一个配方计算器,而不是特定产品的确切配方。
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计算结果:

工作液浓度 mg/mL;

DMSO母液配制方法 mg 药物溶于 μL DMSO溶液(母液浓度 mg/mL)。如该浓度超过该批次药物DMSO溶解度,请首先与我们联系。

体内配方配制方法μL DMSO母液,加入 μL PEG300,混匀澄清后加入μL Tween 80,混匀澄清后加入 μL ddH2O,混匀澄清。

(1) 请确保溶液澄清之后,再加入下一种溶剂 (助溶剂) 。可利用涡旋、超声或水浴加热等方法助溶;
            (2) 一定要按顺序加入溶剂 (助溶剂) 。

生物数据图片
  • PYR-41 inhibits the ubiquitin E1. A, His6-tagged mouse E1 was immobilized on TALON beads and treated with PYR-41 for 15 min, as indicated. [1].Cancer Res. 2007 Oct 1;67(19):9472-81.
  • PYR-41 inhibits ubiquitin-mediated proteasomal degradation in vitro. [1].Cancer Res. 2007 Oct 1;67(19):9472-81.
  • PYR-41 is active in cells and enhances accumulation of sumoylated proteins. [1].Cancer Res. 2007 Oct 1;67(19):9472-81.
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