PF-543

别名: PF543; PF-543 HCl;PF543; PF 543; PF-543 hydrochloride (2R)-1-[[4-[[3-甲基-5-[(苯磺酰基)甲基]苯氧基]甲基]苯基]甲基]-2-吡咯烷甲醇; (2R)-1-[[4-[[3-甲基-5-[(苯基磺酰基)甲基]苯氧基]甲基]苯基]甲基]-2-吡咯烷甲醇
目录号: V1504 纯度: ≥98%
PF-543(也称为 PF543;PF 543;Sphingosine Kinase 1 Inhibitor II)是一种新型细胞渗透性、鞘氨醇竞争性的 SphK1 抑制剂,具有潜在的抗肿瘤活性。
PF-543 CAS号: 1415562-82-1
产品类别: S1P Receptor
产品仅用于科学研究,不针对患者销售
规格 价格 库存 数量
5mg
10mg
25mg
50mg
100mg
250mg
Other Sizes

Other Forms of PF-543:

  • PF-543 Citrate
  • PF-543 HCl
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纯度/质量控制文件

纯度: ≥98%

产品描述
PF-543(也称为 PF543;PF 543;Sphingosine Kinase 1 Inhibitor II)是一种新型细胞渗透性、鞘氨醇竞争性的 SphK1 抑制剂,具有潜在的抗肿瘤活性。它抑制 SphK1,IC50 和 Ki 分别为 2.0 nM 和 3.6 nM,并且对 SphK1 的选择性是 SphK2 同工型的 100 倍以上。
生物活性&实验参考方法
靶点
SphK1
体外研究 (In Vitro)
体外活性:PF543是一种细胞渗透性羟甲基吡咯烷化合物,以可逆和鞘氨醇竞争性的方式抑制SphK-1/SphK1催化的鞘氨醇磷酸化,对S1P受体没有亲和力,并且对SphK2的抑制活性大大降低(抑制6.8%) 10 μM) 或 46 个其他脂质和蛋白激酶 (IC50 >10 μM)。在 SphK1 过表达的 1483 头颈癌细胞中,PF-543 使内源性 S1P 水平降低 10 倍,同时鞘氨醇水平成比例增加。 PF-543 以高亲和力可逆地结合 SphK1(k off t1/2=8.5 分钟),结合常数 (Kd) 为 5 nM。尽管细胞S1P/鞘氨醇比率发生显着变化,PF543对1483、A549、LN229、Jurkat、U937和MCF-7细胞的增殖和存活没有影响。 PF-543 是全血中 S1P 形成的有效抑制剂,表明鞘氨醇激酶的 SphK1 亚型是人类血液中 S1P 的主要来源。激酶测定:开发了一种 384 孔形式的 SphK 酶测定,其基于使用微流体毛细管电泳迁移率变动系统将 FITC-S1P 与未反应的 FITC-鞘氨醇底物分离。简而言之,将 3 nM SphK1–His6 与 1 μM FITC-鞘氨醇、20 μM ATP 和 10 μM 化合物(DMSO 终浓度为 2%)在含有 100 mM Hepes (pH 7.4)、1 mM MgCl2、0.01 的缓冲液中一起孵育。在 384 孔 Matrical MP-101-1-PP 板中加入 % Triton X-100、10% 甘油、100 μM 原钒酸钠和 1 mM DTT 1 小时。通过在 100 mM Hepes 中添加 20 μL 30 mM EDTA 和 0.15% Coating Reagent-3 来淬灭反应混合物 (10 μL),并在 Caliper LabChip 3000 仪器中分析每个反应的一小部分(几纳升)在 -1.5 psi (psi=6.9 kPa) 压力下,下游电压为 -1900 V,吸气时间为 0.2 s。磷酸化荧光产物和未磷酸化荧光底物显示为独特的峰,并使用卡尺数据进行定量。细胞测定:在表达高水平 SphK1 且 S1P 产生率异常高的 1483 头颈癌细胞培养物中,PF-543 预处理 1 小时,使内源性 S1P 水平降低 10 倍,同时 S1P 水平成比例增加。鞘氨醇水平。这表明pf-543对SphK1具有显着抑制作用。然而,尽管细胞 S1P/鞘氨醇比率发生了巨大变化,但特异性抑制 SphK1 对 1483 细胞培养物的增殖和存活没有影响。
体内研究 (In Vivo)
还在人全血中离体检测了 PF-543 的抑制活性。制备了具有高SphK1活性的人全血,能够快速将C17-鞘氨醇转化为C17-S1P。 PF-543 处理表明 PF-543 是 SphK1 的有效抑制剂,能够阻断 >90% 的 C17-S1P 形成
酶活实验
SphK 酶测定采用 384 孔格式开发,使用微流体毛细管电泳迁移率变换系统将未反应的 FITC-鞘氨醇底物与 FITC-S1P 分离。总之,将 1 μM FITC-鞘氨醇、20 μM ATP 和 10 μM 化合物(DMSO 最终浓度为 2%)以及 3 nM SphK1–His6 在 384 孔 Matrical MP-101 中孵育 1 小时-1-PP 板,其缓冲液含有 100 mM Hepes (pH 7.4)、1 mM MgCl2、0.01% Triton X-100、10% 甘油、100 μM 原钒酸钠和 1 mM DTT。通过添加 20 μL 30 mM EDTA 和 100 mM Hepes 中的 0.15% Coating Reagent-3 淬灭反应混合物 (10 μL)。然后在 Caliper LabChip 3000 仪器中以 -1900 V 的下游电压、0.2 s 的吸液时间和 -1.5 psi (psi=6.9 kPa) 的压力对每个反应的一小部分(几纳升)进行分析。卡尺数据用于量化作为磷酸化荧光产物和未磷酸化荧光底物出现的不同峰。
细胞实验
在 1483 个表达高水平 SphK1 并以极高速率产生 S1P 的头颈癌细胞培养物中,用 PF-543 预处理一小时,可将内源性 S1P 水平降低十倍,同时按比例增加鞘氨醇水平。观察到 pf-543 对 SphK1 的显着抑制。然而,SphK1 的特异性抑制并不影响 1483 细胞培养物的存活和增殖,尽管细胞 S1P/鞘氨醇比率发生了巨大变化。
动物实验
Dissolved in vehicle (PBS); 0 or 30 mg/kg; injected via the tail vein
Mice: RB-005 or PF-543 (10 or 30 mg/kg) dissolved in vehicle (PBS) are injected intraperitoneally (IV) into two-month-old female C57BL/6 J mice. Following the administration of the drug, tail vein bleeds are used to extract 20 μL of blood at intervals of 15, 30, 1, 1, 4, 6, and 24 hours. Using MS analysis, drug concentration is ascertained.
参考文献

[1]. Modulation of cellular S1P levels with a novel, potent and specific inhibitor of sphingosine kinase-1. Biochem J. 2012 May 15;444(1):79-88.

[2]. Effect of the sphingosine kinase 1 selective inhibitor, PF-543 on arterial and cardiac remodelling in a hypoxic model of pulmonary arterial hypertension. Cell Signal. 2016 Aug;28(8):946-55.

[3]. Induction of autophagy by sphingosine kinase 1 inhibitor PF-543 in head and neck squamous cell carcinoma cells. Cell Death Discov. 2017 Aug 14;3:17047.

其他信息
[(2R)-1-[[4-[[3-(benzenesulfonylmethyl)-5-methylphenoxy]methyl]phenyl]methyl]-2-pyrrolidinyl]methanol is a sulfonamide.
*注: 文献方法仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些方法的准确性
化学信息 & 存储运输条件
分子式
C27H31NO4S
分子量
465.6
精确质量
465.197
元素分析
C, 69.65; H, 6.71; N, 3.01; O, 13.74; S, 6.89
CAS号
1415562-82-1
相关CAS号
PF-543 Citrate; 1415562-83-2; PF-543 hydrochloride; 1706522-79-3
PubChem CID
66577038
外观&性状
White to off-white Waxy semisolid
密度
1.2±0.1 g/cm3
沸点
666.0±55.0 °C at 760 mmHg
闪点
356.6±31.5 °C
蒸汽压
0.0±2.1 mmHg at 25°C
折射率
1.610
LogP
4.16
tPSA
75.22
氢键供体(HBD)数目
1
氢键受体(HBA)数目
5
可旋转键数目(RBC)
9
重原子数目
33
分子复杂度/Complexity
679
定义原子立体中心数目
1
SMILES
CC1=CC(OCC2=CC=C(CN3[C@@H](CO)CCC3)C=C2)=CC(CS(C4=CC=CC=C4)(=O)=O)=C1
InChi Key
NPUXORBZRBIOMQ-RUZDIDTESA-N
InChi Code
InChI=1S/C27H31NO4S/c1-21-14-24(20-33(30,31)27-7-3-2-4-8-27)16-26(15-21)32-19-23-11-9-22(10-12-23)17-28-13-5-6-25(28)18-29/h2-4,7-12,14-16,25,29H,5-6,13,17-20H2,1H3/t25-/m1/s1
化学名
[(2R)-1-[[4-[[3-(benzenesulfonylmethyl)-5-methylphenoxy]methyl]phenyl]methyl]pyrrolidin-2-yl]methanol
别名
PF543; PF-543 HCl;PF543; PF 543; PF-543 hydrochloride
HS Tariff Code
2934.99.9001
存储方式

Powder      -20°C    3 years

                     4°C     2 years

In solvent   -80°C    6 months

                  -20°C    1 month

注意: (1). 本产品在运输和储存过程中需避光。  (2). 请将本产品存放在密封且受保护的环境中(例如氮气保护),避免吸湿/受潮。
运输条件
Room temperature (This product is stable at ambient temperature for a few days during ordinary shipping and time spent in Customs)
溶解度数据
溶解度 (体外实验)
DMSO: 93~100 mg/mL (199.7~214.8 mM)
Water: <1 mg/mL
Ethanol: <1 mg/mL
溶解度 (体内实验)
配方 1 中的溶解度: 5 mg/mL (10.74 mM) in 10% DMSO + 90% (20% SBE-β-CD in Saline) (这些助溶剂从左到右依次添加,逐一添加), 悬浮液;超声助溶。
例如,若需制备1 mL的工作液,可将100 μL 50.0mg/mL澄清的DMSO储备液加入到900μL 20%SBE-β-CD生理盐水中,混匀。
*20% SBE-β-CD 生理盐水溶液的制备(4°C,1 周):将 2 g SBE-β-CD 溶解于 10 mL 生理盐水中,得到澄清溶液。

配方 2 中的溶解度: ≥ 5 mg/mL (10.74 mM) (饱和度未知) in 10% DMSO + 90% Corn Oil (这些助溶剂从左到右依次添加,逐一添加), 澄清溶液。
例如,若需制备1 mL的工作液,可将 100 μL 50.0 mg/mL 澄清 DMSO 储备液加入900 μL 玉米油中,混合均匀。

请根据您的实验动物和给药方式选择适当的溶解配方/方案:
1、请先配制澄清的储备液(如:用DMSO配置50 或 100 mg/mL母液(储备液));
2、取适量母液,按从左到右的顺序依次添加助溶剂,澄清后再加入下一助溶剂。以 下列配方为例说明 (注意此配方只用于说明,并不一定代表此产品 的实际溶解配方):
10% DMSO → 40% PEG300 → 5% Tween-80 → 45% ddH2O (或 saline);
假设最终工作液的体积为 1 mL, 浓度为5 mg/mL: 取 100 μL 50 mg/mL 的澄清 DMSO 储备液加到 400 μL PEG300 中,混合均匀/澄清;向上述体系中加入50 μL Tween-80,混合均匀/澄清;然后继续加入450 μL ddH2O (或 saline)定容至 1 mL;

3、溶剂前显示的百分比是指该溶剂在最终溶液/工作液中的体积所占比例;
4、 如产品在配制过程中出现沉淀/析出,可通过加热(≤50℃)或超声的方式助溶;
5、为保证最佳实验结果,工作液请现配现用!
6、如不确定怎么将母液配置成体内动物实验的工作液,请查看说明书或联系我们;
7、 以上所有助溶剂都可在 Invivochem.cn网站购买。
制备储备液 1 mg 5 mg 10 mg
1 mM 2.1478 mL 10.7388 mL 21.4777 mL
5 mM 0.4296 mL 2.1478 mL 4.2955 mL
10 mM 0.2148 mL 1.0739 mL 2.1478 mL

1、根据实验需要选择合适的溶剂配制储备液 (母液):对于大多数产品,InvivoChem推荐用DMSO配置母液 (比如:5、10、20mM或者10、20、50 mg/mL浓度),个别水溶性高的产品可直接溶于水。产品在DMSO 、水或其他溶剂中的具体溶解度详见上”溶解度 (体外)”部分;

2、如果您找不到您想要的溶解度信息,或者很难将产品溶解在溶液中,请联系我们;

3、建议使用下列计算器进行相关计算(摩尔浓度计算器、稀释计算器、分子量计算器、重组计算器等);

4、母液配好之后,将其分装到常规用量,并储存在-20°C或-80°C,尽量减少反复冻融循环。

计算器

摩尔浓度计算器可计算特定溶液所需的质量、体积/浓度,具体如下:

  • 计算制备已知体积和浓度的溶液所需的化合物的质量
  • 计算将已知质量的化合物溶解到所需浓度所需的溶液体积
  • 计算特定体积中已知质量的化合物产生的溶液的浓度
使用摩尔浓度计算器计算摩尔浓度的示例如下所示:
假如化合物的分子量为350.26 g/mol,在5mL DMSO中制备10mM储备液所需的化合物的质量是多少?
  • 在分子量(MW)框中输入350.26
  • 在“浓度”框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在“体积”框中输入5,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案17.513 mg出现在“质量”框中。以类似的方式,您可以计算体积和浓度。

稀释计算器可计算如何稀释已知浓度的储备液。例如,可以输入C1、C2和V2来计算V1,具体如下:

制备25毫升25μM溶液需要多少体积的10 mM储备溶液?
使用方程式C1V1=C2V2,其中C1=10mM,C2=25μM,V2=25 ml,V1未知:
  • 在C1框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在C2框中输入25,然后选择正确的单位(μM)
  • 在V2框中输入25,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案62.5μL(0.1 ml)出现在V1框中
g/mol

分子量计算器可计算化合物的分子量 (摩尔质量)和元素组成,具体如下:

注:化学分子式大小写敏感:C12H18N3O4  c12h18n3o4
计算化合物摩尔质量(分子量)的说明:
  • 要计算化合物的分子量 (摩尔质量),请输入化学/分子式,然后单击“计算”按钮。
分子质量、分子量、摩尔质量和摩尔量的定义:
  • 分子质量(或分子量)是一种物质的一个分子的质量,用统一的原子质量单位(u)表示。(1u等于碳-12中一个原子质量的1/12)
  • 摩尔质量(摩尔重量)是一摩尔物质的质量,以g/mol表示。
/

配液计算器可计算将特定质量的产品配成特定浓度所需的溶剂体积 (配液体积)

  • 输入试剂的质量、所需的配液浓度以及正确的单位
  • 单击“计算”按钮
  • 答案显示在体积框中
动物体内实验配方计算器(澄清溶液)
第一步:请输入基本实验信息(考虑到实验过程中的损耗,建议多配一只动物的药量)
第二步:请输入动物体内配方组成(配方适用于不溶/难溶于水的化合物),不同的产品和批次配方组成不同,如对配方有疑问,可先联系我们提供正确的体内实验配方。此外,请注意这只是一个配方计算器,而不是特定产品的确切配方。
+
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计算结果:

工作液浓度 mg/mL;

DMSO母液配制方法 mg 药物溶于 μL DMSO溶液(母液浓度 mg/mL)。如该浓度超过该批次药物DMSO溶解度,请首先与我们联系。

体内配方配制方法μL DMSO母液,加入 μL PEG300,混匀澄清后加入μL Tween 80,混匀澄清后加入 μL ddH2O,混匀澄清。

(1) 请确保溶液澄清之后,再加入下一种溶剂 (助溶剂) 。可利用涡旋、超声或水浴加热等方法助溶;
            (2) 一定要按顺序加入溶剂 (助溶剂) 。

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