| 规格 | 价格 | |
|---|---|---|
| 100mg | ||
| 500mg |
| 靶点 |
CDK6
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|---|---|
| 体外研究 (In Vitro) |
开发了一个聚焦的PROTAC库劫持癌症治疗靶点CDK6。提出了“匹配/不匹配”的设计原则，以了解这些PROTAC中的退化曲线差异。值得注意的是，通过连接CDK6抑制剂帕博西利和E3连接酶CRBN募集剂泊马度胺，产生了具有特异性和显著CDK6降解潜力的强效PROTAC。PROTAC强烈抑制造血癌症细胞的增殖，包括多发性骨髓瘤和CDK6的复制-扩增/突变形式的强烈降解，表明了未来潜在的临床应用。[1]
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| 酶活实验 |
体外激酶测定表明，CP-10对CDK4或CDK6的激酶抑制活性比PD弱10-25倍，这意味着CP-10与CDK4或CD86的结合亲和力受损（图S4C）。可以排除两者内源性丰度的差异，因为当它们以相同水平表达时，FLAG标记的CDK6的降解百分比高于FLAG标签的CDK4（图S4D）。选择性可以部分解释为CP-10和CDK6形成的复合物比CDK4更稳定，或者对接模拟显示的更“匹配”（图3E）。CDK4具有较少的赖氨酸残基（CDK4中为11个，CDK6中为18个）用于泛素化的事实也可能有助于选择性，这有待进一步探索。尽管如此，CDK6比CDK4的优选降解表明，PROTAC CP-10通过适当的连接子和有利的取向比CDK4更适合CDK6。尽管靶结合亲和力减弱，但可以形成稳定且“匹配”的靶、E3连接酶和PROTAC三元复合物[1]。
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| 参考文献 | |
| 其他信息 |
In summary, a focused library of CDK6-degrader was developed and factors including linker length, spatial orientation and binding affinity were systematically evaluated to help understand the match/mismatch between PROTAC and target and deduce the best strategy for future design or optimization of CDK6 degradation. Remarkably and interestingly, we found out that i) pomalidomidebased PROTACs recruiting CRBN, instead of other tested E3 ligases, resulted in functional degraders; ii) the dual CDK4/CDK6 ligand palbociclib we applied surprisingly resulted in CDK6 selective PROTACs; iii) the representative palbociclib-derived PROTAC CP-10 could inhibit proliferation of several haemetopoietic cancer cells with impressive potency including multiple myeloma; iv) mutated and overexpressed CDK6 can be still degraded by CP-10. These data added to the growing trends of potential clinical benefits of PROTAC techniques and also suggested the specific application of CDK6 degradation in certain cancers.
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| 分子式 |
C27H31N7O2
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|---|---|
| 分子量 |
485.580744981766
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| 精确质量 |
485.253
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| CAS号 |
2366269-23-8
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| PubChem CID |
139600348
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| 外观&性状 |
Typically exists as Light yellow to yellow solids at room temperature
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| LogP |
2.4
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| tPSA |
94.6Ų
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| 氢键供体(HBD)数目 |
1
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| 氢键受体(HBA)数目 |
8
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| 可旋转键数目(RBC) |
6
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| 重原子数目 |
36
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| 分子复杂度/Complexity |
912
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| 定义原子立体中心数目 |
0
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| InChi Key |
SLFZXPQZLOODKL-UHFFFAOYSA-N
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| InChi Code |
InChI=1S/C27H31N7O2/c1-4-11-32-12-14-33(15-13-32)21-9-10-23(28-16-21)30-27-29-17-22-18(2)24(19(3)35)26(36)34(25(22)31-27)20-7-5-6-8-20/h1,9-10,16-17,20H,5-8,11-15H2,2-3H3,(H,28,29,30,31)
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| 化学名 |
6-acetyl-8-cyclopentyl-5-methyl-2-[[5-(4-prop-2-ynylpiperazin-1-yl)pyridin-2-yl]amino]pyrido[2,3-d]pyrimidin-7-one
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| 别名 |
Palbociclib-propargyl; 2366269-23-8; PROTAC CDK6 ligand 1; AKOS040743750; MS-29025;
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| HS Tariff Code |
2934.99.9001
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| 存储方式 |
Powder -20°C 3 years 4°C 2 years In solvent -80°C 6 months -20°C 1 month 注意： 请将本产品存放在密封且受保护的环境中（例如氮气保护），避免吸湿/受潮。 |
| 运输条件 |
Room temperature (This product is stable at ambient temperature for a few days during ordinary shipping and time spent in Customs)
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| 溶解度 (体外实验) |
May dissolve in DMSO (in most cases), if not, try other solvents such as H2O, Ethanol, or DMF with a minute amount of products to avoid loss of samples
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|---|---|
| 溶解度 (体内实验) |
注意: 如下所列的是一些常用的体内动物实验溶解配方，主要用于溶解难溶或不溶于水的产品（水溶度<1 mg/mL）。 建议您先取少量样品进行尝试，如该配方可行，再根据实验需求增加样品量。
注射用配方
注射用配方1: DMSO : Tween 80： Saline = 10 : 5 : 85 (如： 100 μL DMSO → 50 μL Tween 80 → 850 μL Saline)(IP/IV/IM/SC等) *生理盐水/Saline的制备：将0.9g氯化钠/NaCl溶解在100 mL ddH ₂ O中，得到澄清溶液。 注射用配方 2: DMSO : PEG300 ：Tween 80 : Saline = 10 : 40 : 5 : 45 (如： 100 μL DMSO → 400 μL PEG300 → 50 μL Tween 80 → 450 μL Saline) 注射用配方 3: DMSO : Corn oil = 10 : 90 (如： 100 μL DMSO → 900 μL Corn oil) 示例: 以注射用配方 3 (DMSO : Corn oil = 10 : 90) 为例说明, 如果要配制 1 mL 2.5 mg/mL的工作液, 您可以取 100 μL 25 mg/mL 澄清的 DMSO 储备液，加到 900 μL Corn oil/玉米油中, 混合均匀。 View More
注射用配方 4: DMSO : 20% SBE-β-CD in Saline = 10 : 90 [如：100 μL DMSO → 900 μL (20% SBE-β-CD in Saline)] 口服配方
口服配方 1: 悬浮于0.5% CMC Na (羧甲基纤维素钠) 口服配方 2: 悬浮于0.5% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素) 示例: 以口服配方 1 (悬浮于 0.5% CMC Na)为例说明, 如果要配制 100 mL 2.5 mg/mL 的工作液, 您可以先取0.5g CMC Na并将其溶解于100mL ddH2O中，得到0.5%CMC-Na澄清溶液；然后将250 mg待测化合物加到100 mL前述 0.5%CMC Na溶液中，得到悬浮液。 View More
口服配方 3: 溶解于 PEG400 (聚乙二醇400) 请根据您的实验动物和给药方式选择适当的溶解配方/方案： 1、请先配制澄清的储备液(如：用DMSO配置50 或 100 mg/mL母液(储备液)); 2、取适量母液，按从左到右的顺序依次添加助溶剂，澄清后再加入下一助溶剂。以 下列配方为例说明 (注意此配方只用于说明，并不一定代表此产品 的实际溶解配方): 10% DMSO → 40% PEG300 → 5% Tween-80 → 45% ddH2O (或 saline); 假设最终工作液的体积为 1 mL, 浓度为5 mg/mL: 取 100 μL 50 mg/mL 的澄清 DMSO 储备液加到 400 μL PEG300 中，混合均匀/澄清；向上述体系中加入50 μL Tween-80，混合均匀/澄清；然后继续加入450 μL ddH2O (或 saline)定容至 1 mL； 3、溶剂前显示的百分比是指该溶剂在最终溶液/工作液中的体积所占比例; 4、 如产品在配制过程中出现沉淀/析出，可通过加热(≤50℃)或超声的方式助溶; 5、为保证最佳实验结果，工作液请现配现用！ 6、如不确定怎么将母液配置成体内动物实验的工作液，请查看说明书或联系我们; 7、 以上所有助溶剂都可在 Invivochem.cn网站购买。 |
| 制备储备液 | 1 mg | 5 mg | 10 mg | |
| 1 mM | 2.0594 mL | 10.2970 mL | 20.5939 mL | |
| 5 mM | 0.4119 mL | 2.0594 mL | 4.1188 mL | |
| 10 mM | 0.2059 mL | 1.0297 mL | 2.0594 mL |
1、根据实验需要选择合适的溶剂配制储备液 (母液)：对于大多数产品，InvivoChem推荐用DMSO配置母液 (比如：5、10、20mM或者10、20、50 mg/mL浓度），个别水溶性高的产品可直接溶于水。产品在DMSO 、水或其他溶剂中的具体溶解度详见上”溶解度 (体外)”部分;
2、如果您找不到您想要的溶解度信息，或者很难将产品溶解在溶液中，请联系我们;
3、建议使用下列计算器进行相关计算（摩尔浓度计算器、稀释计算器、分子量计算器、重组计算器等）;
4、母液配好之后，将其分装到常规用量，并储存在-20°C或-80°C，尽量减少反复冻融循环。
计算结果:
工作液浓度： mg/mL；
DMSO母液配制方法： mg 药物溶于 μL DMSO溶液（母液浓度 mg/mL)。如该浓度超过该批次药物DMSO溶解度，请首先与我们联系。
体内配方配制方法：取 μL DMSO母液，加入 μL PEG300，混匀澄清后加入μL Tween 80，混匀澄清后加入 μL ddH2O，混匀澄清。
(1) 请确保溶液澄清之后，再加入下一种溶剂 (助溶剂) 。可利用涡旋、超声或水浴加热等方法助溶；
(2) 一定要按顺序加入溶剂 (助溶剂) 。
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