ML364

别名: ML364; ML 364; ML-364 2-[[(4-甲基苯基)磺酰基]氨基]-N-(4-苯基-2-噻唑基)-4-(三氟甲基)苯甲酰胺; ML-364
目录号: V2858 纯度: ≥98%
ML364 是泛素特异性肽酶 2(USP2,一种去泛素酶)的小分子抑制剂,生化测定中的 IC50 为 1.1 μm。
ML364 CAS号: 1991986-30-1
产品类别: DUB
产品仅用于科学研究,不针对患者销售
规格 价格 库存 数量
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纯度/质量控制文件

纯度: ≥98%

产品描述
ML364 是泛素特异性肽酶 2(USP2,一种去泛素酶)的小分子抑制剂,生化测定中的 IC50 为 1.1 μm。 ML364 用于研究 USP2 及其假定底物细胞周期蛋白 D1 的生物学特性。 ML364 诱导细胞周期蛋白 D1 降解增加,并导致细胞周期停滞,如使用 Mino 和 HCT116 癌细胞系的蛋白质印迹和流式细胞术测定所示。 ML364 在癌细胞系中具有抗增殖作用。与细胞周期蛋白 D1 在 DNA 损伤反应中的作用一致,ML364 也导致同源重组介导的 DNA 修复减少。 ML364 的这些作用支持了 USP2 作为细胞周期、DNA 修复和肿瘤细胞生长调节剂的关键作用,并且 ML364 可用于乳腺癌研究。
生物活性&实验参考方法
靶点
USP2(IC50= 1.1 μM);USP2(Kd= 5.2 μM)
体外研究 (In Vitro)
体外活性:ML364 是泛素特异性肽酶 2(USP2,一种去泛素酶)的小分子抑制剂,生化测定中的 IC50 为 1.1 μm。 ML364 用于研究 USP2 及其假定底物细胞周期蛋白 D1 的生物学特性。 ML364 诱导细胞周期蛋白 D1 降解增加,并导致细胞周期停滞,如使用 Mino 和 HCT116 癌细胞系的蛋白质印迹和流式细胞术测定所示。 ML364 在癌细胞系中具有抗增殖作用。与细胞周期蛋白 D1 在 DNA 损伤反应中的作用一致,ML364 也导致同源重组介导的 DNA 修复减少。 ML364 的这些作用支持了 USP2 作为细胞周期、DNA 修复和肿瘤细胞生长调节剂的关键作用,并且 ML364 可用于乳腺癌研究。激酶测定:使用 Kinomescan (DiscoveRx, Fremont, CA),测试了 102 种激酶被 10 μm ML364 抑制的情况。 MMP1 和 MMP9 数据是使用其标准条件(5 μm 的 FRET 肽)从 Reaction Biology(宾夕法尼亚州马尔文)获得的。使用 Promega(威斯康星州麦迪逊)的 Caspase 6 和 Caspase 3/7 Glo 试剂盒进行 Caspase 6 和 Caspase 7 测定。该试剂盒将半胱氨酸-天冬氨酸蛋白酶(即半胱天冬酶)的活性与荧光素酶偶联。首先,在 10 mm Hepes、pH 7.2、2 mm DTT、10% 甘油中加入 2.5 µl caspase 6(0.5 单位/ml;Enzo Life Sciences,Farmingdale,NY)和 caspase 7(0.5 单位/ml;Enzo Life Sciences)将 0.05% CHAPS 分配到白色 1536 孔板中。在此测定中,底物的厚度为 5 μm,这是制造商提供的底物的 Km。然后,使用针工具分配23nl化合物并在室温下孵育30分钟。最后,添加 2.5 μl caspase Glo 试剂(caspase Glo 6 或 caspase Glo 3/7),并使用 Viewlux 动态监测发光,总共 50 分钟(1 秒曝光)。细胞测定:将HCT116细胞以25,000个细胞/孔的密度接种到透明96孔板(Costar,Corning,Tewksbury,MA)中,并用化合物处理24小时。然后用 4% 多聚甲醛固定细胞 15 分钟,用 PBS、0.1% Triton X-100 透化 30 分钟,并用 2× 封闭缓冲液 (Sigma) 在室温下封闭 2 小时。每个步骤后,使用 BioTek Elx406 微孔板清洗机用 PBS 彻底清洗细胞。为了定量细胞周期蛋白 D1 蛋白水平,将细胞与小鼠抗细胞周期蛋白 D1(DCS6,Cell Signaling,1:500 稀释)在 1× 封闭缓冲液 (Sigma) 中于 4 °C 孵育过夜,然后与 HRP 缀合的抗细胞周期蛋白 D1 一起孵育过夜。小鼠 IgG(Cell Signaling,1:500 稀释)在 1× 封闭缓冲液 (Sigma) 中,室温下 2 小时。每次孵育后,使用 BioTek Elx406 微孔板清洗机用 PBS、0.1% Tween 20 清洗细胞。然后向每个孔中加入100μl TMB Liquid Substrate System for ELISA (Sigma),显色5分钟后,通过添加等体积的1m HCl终止反应。在 Envision Multilabel 读板仪上对 450 nm 处的吸光度进行定量。
酶活实验
使用 Kinomescan (DiscoveRx, Fremont, CA),测试了 102 种激酶被 10 μm ML364 抑制的情况。 MMP1 和 MMP9 数据是使用其标准条件(5 μm 的 FRET 肽)从 Reaction Biology(宾夕法尼亚州马尔文)获得的。使用 Promega(威斯康星州麦迪逊)的 Caspase 6 和 Caspase 3/7 Glo 试剂盒进行 Caspase 6 和 Caspase 7 测定。该试剂盒将半胱氨酸-天冬氨酸蛋白酶(即半胱天冬酶)的活性与荧光素酶偶联。首先,在 10 mm Hepes、pH 7.2、2 mm DTT、10% 甘油中加入 2.5 µl caspase 6(0.5 单位/ml;Enzo Life Sciences,Farmingdale,NY)和 caspase 7(0.5 单位/ml;Enzo Life Sciences)将 0.05% CHAPS 分配到白色 1536 孔板中。在此测定中,底物的厚度为 5 μm,这是制造商提供的底物的 Km。然后,使用针工具分配23nl化合物并在室温下孵育30分钟。最后,添加 2.5 μl caspase Glo 试剂(caspase Glo 6 或 caspase Glo 3/7),并使用 Viewlux 动态监测发光,总共 50 分钟(1 秒曝光)。
细胞实验
HCT116 细胞以 25,000 个细胞/孔的密度接种到透明 96 孔板(Costar,Corning,Tewksbury,MA)中,并用化合物处理 24 小时。然后用 4% 多聚甲醛固定细胞 15 分钟,用 PBS、0.1% Triton X-100 透化 30 分钟,并用 2× 封闭缓冲液 (Sigma) 在室温下封闭 2 小时。每个步骤后,使用 BioTek Elx406 微孔板清洗机用 PBS 彻底清洗细胞。为了定量细胞周期蛋白 D1 蛋白水平,将细胞与小鼠抗细胞周期蛋白 D1(DCS6,Cell Signaling,1:500 稀释)在 1× 封闭缓冲液 (Sigma) 中于 4 °C 孵育过夜,然后与 HRP 缀合的抗细胞周期蛋白 D1 一起孵育过夜。小鼠 IgG(Cell Signaling,1:500 稀释)在 1× 封闭缓冲液 (Sigma) 中,室温下 2 小时。每次孵育后,使用 BioTek Elx406 微孔板清洗机用 PBS、0.1% Tween 20 清洗细胞。然后向每个孔中加入100μl TMB Liquid Substrate System for ELISA (Sigma),显色5分钟后,通过添加等体积的1m HCl终止反应。在 Envision Multilabel 读板仪上对 450 nm 处的吸光度进行定量。
动物实验


参考文献
2016 Nov 18;291(47):24628-24640;http://www.freepatentsonline.com/WO2016134026A1.html
*注: 文献方法仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些方法的准确性
化学信息 & 存储运输条件
分子式
C24H18F3N3O3S2
分子量
517.54
精确质量
517.074
元素分析
C, 55.70; H, 3.51; F, 11.01; N, 8.12; O, 9.27; S, 12.39
CAS号
1991986-30-1
相关CAS号
1991986-30-1
PubChem CID
70789348
外观&性状
Light yellow to yellow solid powder
LogP
6.1
tPSA
125
氢键供体(HBD)数目
2
氢键受体(HBA)数目
9
可旋转键数目(RBC)
6
重原子数目
35
分子复杂度/Complexity
822
定义原子立体中心数目
0
SMILES
S(C1C([H])=C([H])C(C([H])([H])[H])=C([H])C=1[H])(N([H])C1C([H])=C(C(F)(F)F)C([H])=C([H])C=1C(N([H])C1=NC(=C([H])S1)C1C([H])=C([H])C([H])=C([H])C=1[H])=O)(=O)=O
InChi Key
QZUGMNXETPARLI-UHFFFAOYSA-N
InChi Code
InChI=1S/C24H18F3N3O3S2/c1-15-7-10-18(11-8-15)35(32,33)30-20-13-17(24(25,26)27)9-12-19(20)22(31)29-23-28-21(14-34-23)16-5-3-2-4-6-16/h2-14,30H,1H3,(H,28,29,31)
化学名
2-[(4-Methylphenyl)sulfonylamino]-N-(4-phenyl-1,3-thiazol-2-yl)-4-(trifluoromethyl)benzamide
别名
ML364; ML 364; ML-364
HS Tariff Code
2934.99.9001
存储方式

Powder      -20°C    3 years

                     4°C     2 years

In solvent   -80°C    6 months

                  -20°C    1 month

运输条件
Room temperature (This product is stable at ambient temperature for a few days during ordinary shipping and time spent in Customs)
溶解度数据
溶解度 (体外实验)
DMSO : 33~60 mg/mL ( 63.76~115.93 mM )
Ethanol : ~15 mg/mL
溶解度 (体内实验)
配方 1 中的溶解度: ≥ 2.5 mg/mL (4.83 mM) (饱和度未知) in 10% DMSO + 40% PEG300 + 5% Tween80 + 45% Saline (这些助溶剂从左到右依次添加,逐一添加), 澄清溶液。
例如,若需制备1 mL的工作液,可将100 μL 25.0 mg/mL澄清DMSO储备液加入到400 μL PEG300中,混匀;然后向上述溶液中加入50 μL Tween-80,混匀;加入450 μL生理盐水定容至1 mL。
*生理盐水的制备:将 0.9 g 氯化钠溶解在 100 mL ddH₂O中,得到澄清溶液。

配方 2 中的溶解度: ≥ 2.5 mg/mL (4.83 mM) (饱和度未知) in 10% DMSO + 90% Corn Oil (这些助溶剂从左到右依次添加,逐一添加), 澄清溶液。
例如,若需制备1 mL的工作液,可将 100 μL 25.0 mg/mL 澄清 DMSO 储备液添加到 900 μL 玉米油中并混合均匀。

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配方 3 中的溶解度: 5% DMSO + Corn oil: 3mg/ml


配方 4 中的溶解度: 20 mg/mL (38.64 mM) in 0.5% CMC-Na/saline water (这些助溶剂从左到右依次添加,逐一添加), 悬浊液; 超声助溶。
*生理盐水的制备:将 0.9 g 氯化钠溶解在 100 mL ddH₂O中,得到澄清溶液。

请根据您的实验动物和给药方式选择适当的溶解配方/方案:
1、请先配制澄清的储备液(如:用DMSO配置50 或 100 mg/mL母液(储备液));
2、取适量母液,按从左到右的顺序依次添加助溶剂,澄清后再加入下一助溶剂。以 下列配方为例说明 (注意此配方只用于说明,并不一定代表此产品 的实际溶解配方):
10% DMSO → 40% PEG300 → 5% Tween-80 → 45% ddH2O (或 saline);
假设最终工作液的体积为 1 mL, 浓度为5 mg/mL: 取 100 μL 50 mg/mL 的澄清 DMSO 储备液加到 400 μL PEG300 中,混合均匀/澄清;向上述体系中加入50 μL Tween-80,混合均匀/澄清;然后继续加入450 μL ddH2O (或 saline)定容至 1 mL;

3、溶剂前显示的百分比是指该溶剂在最终溶液/工作液中的体积所占比例;
4、 如产品在配制过程中出现沉淀/析出,可通过加热(≤50℃)或超声的方式助溶;
5、为保证最佳实验结果,工作液请现配现用!
6、如不确定怎么将母液配置成体内动物实验的工作液,请查看说明书或联系我们;
7、 以上所有助溶剂都可在 Invivochem.cn网站购买。
制备储备液 1 mg 5 mg 10 mg
1 mM 1.9322 mL 9.6611 mL 19.3222 mL
5 mM 0.3864 mL 1.9322 mL 3.8644 mL
10 mM 0.1932 mL 0.9661 mL 1.9322 mL

1、根据实验需要选择合适的溶剂配制储备液 (母液):对于大多数产品,InvivoChem推荐用DMSO配置母液 (比如:5、10、20mM或者10、20、50 mg/mL浓度),个别水溶性高的产品可直接溶于水。产品在DMSO 、水或其他溶剂中的具体溶解度详见上”溶解度 (体外)”部分;

2、如果您找不到您想要的溶解度信息,或者很难将产品溶解在溶液中,请联系我们;

3、建议使用下列计算器进行相关计算(摩尔浓度计算器、稀释计算器、分子量计算器、重组计算器等);

4、母液配好之后,将其分装到常规用量,并储存在-20°C或-80°C,尽量减少反复冻融循环。

计算器

摩尔浓度计算器可计算特定溶液所需的质量、体积/浓度,具体如下:

  • 计算制备已知体积和浓度的溶液所需的化合物的质量
  • 计算将已知质量的化合物溶解到所需浓度所需的溶液体积
  • 计算特定体积中已知质量的化合物产生的溶液的浓度
使用摩尔浓度计算器计算摩尔浓度的示例如下所示:
假如化合物的分子量为350.26 g/mol,在5mL DMSO中制备10mM储备液所需的化合物的质量是多少?
  • 在分子量(MW)框中输入350.26
  • 在“浓度”框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在“体积”框中输入5,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案17.513 mg出现在“质量”框中。以类似的方式,您可以计算体积和浓度。

稀释计算器可计算如何稀释已知浓度的储备液。例如,可以输入C1、C2和V2来计算V1,具体如下:

制备25毫升25μM溶液需要多少体积的10 mM储备溶液?
使用方程式C1V1=C2V2,其中C1=10mM,C2=25μM,V2=25 ml,V1未知:
  • 在C1框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在C2框中输入25,然后选择正确的单位(μM)
  • 在V2框中输入25,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案62.5μL(0.1 ml)出现在V1框中
g/mol

分子量计算器可计算化合物的分子量 (摩尔质量)和元素组成,具体如下:

注:化学分子式大小写敏感:C12H18N3O4  c12h18n3o4
计算化合物摩尔质量(分子量)的说明:
  • 要计算化合物的分子量 (摩尔质量),请输入化学/分子式,然后单击“计算”按钮。
分子质量、分子量、摩尔质量和摩尔量的定义:
  • 分子质量(或分子量)是一种物质的一个分子的质量,用统一的原子质量单位(u)表示。(1u等于碳-12中一个原子质量的1/12)
  • 摩尔质量(摩尔重量)是一摩尔物质的质量,以g/mol表示。
/

配液计算器可计算将特定质量的产品配成特定浓度所需的溶剂体积 (配液体积)

  • 输入试剂的质量、所需的配液浓度以及正确的单位
  • 单击“计算”按钮
  • 答案显示在体积框中
动物体内实验配方计算器(澄清溶液)
第一步:请输入基本实验信息(考虑到实验过程中的损耗,建议多配一只动物的药量)
第二步:请输入动物体内配方组成(配方适用于不溶/难溶于水的化合物),不同的产品和批次配方组成不同,如对配方有疑问,可先联系我们提供正确的体内实验配方。此外,请注意这只是一个配方计算器,而不是特定产品的确切配方。
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计算结果:

工作液浓度 mg/mL;

DMSO母液配制方法 mg 药物溶于 μL DMSO溶液(母液浓度 mg/mL)。如该浓度超过该批次药物DMSO溶解度,请首先与我们联系。

体内配方配制方法μL DMSO母液,加入 μL PEG300,混匀澄清后加入μL Tween 80,混匀澄清后加入 μL ddH2O,混匀澄清。

(1) 请确保溶液澄清之后,再加入下一种溶剂 (助溶剂) 。可利用涡旋、超声或水浴加热等方法助溶;
            (2) 一定要按顺序加入溶剂 (助溶剂) 。

生物数据图片
  • ML364


    ML364 induces cell cycle arrest and inhibits cell growth in HCT116 and Mino cells.2016 Nov 18;291(47):24628-24640. Epub 2016 Sep 28.

  • ML364


    Kinomescan visualization for ML364 (10 μm) tested for binding to 102 kinases.2016 Nov 18;291(47):24628-24640. Epub 2016 Sep 28.

  • ML364


    ML364 reduces cyclin D1 protein levels in a time-, dose-, and proteasome-dependent manner in HCT116 cells and Mino cells.2016 Nov 18;291(47):24628-24640. Epub 2016 Sep 28.

  • ML364


    ML364 binds to USP2 and inhibits its activity, although a related chemical analog 2 does not.2016 Nov 18;291(47):24628-24640. Epub 2016 Sep 28.

  • ML364


    ML364 directly targets cyclin D1 for degradation.2016 Nov 18;291(47):24628-24640. Epub 2016 Sep 28.


    ML364

    Inhibition of USP2 activity by ML364 causes a decrease in HR-mediated DNA repair.2016 Nov 18;291(47):24628-24640. Epub 2016 Sep 28.

  • ML364


    ML364 exposure decreases cell viability and promotes cyclin D1 degradation in cancer cell lines.2016 Nov 18;291(47):24628-24640. Epub 2016 Sep 28.


    ML364

    Schematic showing the impact of ML364 on USP2, which leads to accelerated cyclin D1 degradation and subsequent G0/G1cell cycle arrest.2016 Nov 18;291(47): 24628-24640. Epub 2016 Sep 28.

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