ML347

别名: LDN-193719; LDN193719; LDN 193719;ML-347; ML347; 5-[6-(4-methoxyphenyl)pyrazolo[1,5-a]pyrimidin-3-yl]quinoline; ML-347; 5-(6-(4-methoxyphenyl)pyrazolo[1,5-a]pyrimidin-3-yl)quinoline; LDN 193719; Quinoline, 5-[6-(4-methoxyphenyl)pyrazolo[1,5-a]pyrimidin-3-yl]-; CHEMBL502351; ML 347
目录号: V1371 纯度: ≥98%
ML347(以前称为 ML-347;LDN193719;ML 347;LDN-193719)是一种新型、高效、选择性的 BMP(骨形态发生蛋白)受体抑制剂,具有潜在的抗癌活性。
ML347 CAS号: 1062368-49-3
产品类别: MT Receptor
产品仅用于科学研究,不针对患者销售
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纯度: ≥98%

产品描述
ML347(以前称为 ML-347;LDN193719;ML 347;LDN-193719)是一种新型、高效、选择性的 BMP(骨形态发生蛋白)受体抑制剂,具有潜在的抗癌活性。它抑制 ALK2 的 IC50 为 32 nM,选择性是 ALK3 的 300 倍以上。 ML347 被发现是 BMP I 型受体 ALK2(相对于 ALK3)的选择性抑制剂,并被鉴定为探针分子。在体外激酶测定中,ML347 对 ALK1 和 ALK2 显示出有效的抑制活性,IC50 值分别为 46 和 32 nM。其对 ALK3 的 IC50 值超过 10μM,表明 ML347 对抗 ALK2 的效力高出 300 倍。除此之外,ML347对ALK6和KDR等其他相关激酶没有抑制作用。
生物活性&实验参考方法
靶点
Bone morphogenetic protein (BMP) signaling cascade; ALK1 (IC50 = 46 nM); ACVR1 (IC50 = 32 nM); BMPR1A (IC50 = 10800 nM)
体外研究 (In Vitro)
更有效(和选择性)的化合物7g(ML347)对ALK1和ALK2的IC50分别为46和32 nM;然而,对ALK3的IC50为10800 nM,比ALK3的选择性高出300倍以上。此外,7g对所有其他测试的激酶完全无活性(对ALK6、9830 nM和KDR(VEGFR2)19700 nM的活性较弱)。值得注意的是,它似乎是5-喹啉和4-甲氧基苯基的组合,这导致了选择性分布,因为13m仍然保留了显著的ALK3活性(539 nM)。由于7g对BMP4细胞测定的效力,ALK1和ALK2以及对其他激酶的显著选择性,7g已被宣布为MLPCN中的探针分子,并重新命名为ML347。[1]
通过抑制 ALK1/ALK2,ML347 可以阻止 TGF-β 信号的转导 [2]。
酶活实验
为了使BMP社区进一步了解ML347的效用,研究人员在我们的Tier 1体外药代动力学测定中评估了该分子(表4)。这些研究有助于评估许多物种的代谢稳定性和预测清除率,从而为可能的给药途径提供信息。利用快速平衡透析法,测定了人、大鼠和小鼠血浆中ML347的蛋白结合。三种物种的结果相似,ML347显示出高血浆蛋白结合率(Fu~0.01-0.015)。还评估了ML347在肝微粒体中的内在清除率。该措施将有助于预测同三种物种(CLHEP)的体内清除率。[1]
这些SAR研究最终发现了一种高选择性的ALK2抑制剂ML347,它对ALK2的选择性是ALK3的300倍以上。ML347在BMP4细胞测定(152 nM)以及ALK1(46 nM)和ALK2(32 nM)的体外激酶测定中是有效的,在许多相关激酶中没有活性。计划在许多体内动物疾病模型(如FOP)中进一步研究这种选择性抑制剂,结果将在适当的时候发表。
细胞实验
免疫荧光[2]
细胞类型: 原代牙上皮细胞在补充有 20% 胎牛血清和 1% 青霉素/链霉素的 Dulbecco 改良 Eagle 培养基 (DMEM)/F12 中培养。
测试浓度: 25 μM
孵育时间: 2 小时
实验结果: 抑制 ALK1 /ALK2然后通过 TGF-β1 阻断 Smad1/5。
本研究旨在探讨TGF-β激活的Smad1/5在牙上皮中的分子机制和生物学功能。采用免疫组织化学方法检测TGF-β信号传导相关基因在小鼠磨牙胚中的表达。培养原代牙上皮细胞,用浓度为0.5或5 ng/mL的TGF-β1处理。分别使用小分子抑制剂SB431542和ML347抑制ALK5和ALK1/2。使用小干扰RNA敲除Smad1/5或Smad2/3。通过EdU法评估细胞的增殖率。TGF-β1和p-Smad1/5在牙上皮芽的基底层高度表达,TGF-β1在上皮芽的内部低表达,而p-Smad2/3高表达。在原代培养的牙上皮细胞中,低浓度的TGF-β1激活Smad2/3,但不激活Smad1/5,而高浓度的TGF-α1能够激活Smad2/3和Smad1/5。SB431542而非ML347能够阻断TGF-β1对Smad2/3的磷酸化。SB431542或ML347均能阻断TGF-β1对Smad1/5的磷酸化。EdU染色显示,高浓度的TGF-β1促进了牙上皮细胞的增殖,这可以通过沉默Smad1/5来逆转,而低浓度的TGF-α1抑制了细胞增殖,这可通过沉默Smad2/3来逆转。总之,TGF-β通过两种途径在调节牙上皮细胞增殖中发挥双重作用。一方面,TGF-β通过ALK5激活典型的Smad2/3信号传导,抑制内部牙上皮细胞的增殖。另一方面,TGF-β通过ALK1/2-ALK5激活非正则Smad1/5信号传导,促进牙上皮芽中基底细胞的增殖。[2]
动物实验
This measure will help predict the in vivo clearance in the same three species (CLHEP). ML347 was unstable to oxidative metabolism – possibly due to the labile methoxy group – and therefore was predicted to display high clearance in human and mouse, and moderate-to-high clearance in the rat. Going forward, the intrinsic clearance is predicting high clearance after oral dosing, a more appropriate dosing paradigm might be intraperitoneal dosing for this compound. Further in vivo experiments, including PK, will be reported in due course.[1]
参考文献

[1]. Synthesis and structure-activity relationships of a novel and selective bone morphogenetic protein receptor (BMP) inhibitor derived from the pyrazolo[1.5-a]pyrimidine scaffold of dorsomorphin: the discovery of ML347 as an ALK2 versus ALK3 selective MLPCN probe. Bioorg Med Chem Lett. 2013 Jun 1;23(11):3248-52.

[2]. Dual roles of TGF-β signaling in the regulation of dental epithelial cell proliferation. J Mol Histol. 2021 Feb;52(1):77-86.

其他信息
The purpose of this study is to investigate the molecular mechanisms and biological function of TGF-β-activated Smad1/5 in dental epithelium. Immunohistochemistry was used to detect the expressions of TGF-β signaling-related gene in mice molar germ. Primary dental epithelial cells were cultured and treated with TGF-β1 at a concentration of 0.5 or 5 ng/mL. Small molecular inhibitors, SB431542 and ML347, was used to inhibite ALK5 and ALK1/2, respectively. Small interfering RNA was used to knock down Smad1/5 or Smad2/3. The proliferation rate of cells was evaluated by EdU assay. In the basal layer of dental epithelial bud TGF-β1 and p-Smad1/5 were highly expressed, and in the interior of the epithelial bud TGF-β1 was lowly expressed, whereas p-Smad2/3 was highly expressed. In primary cultured dental epithelial cells, low concentration of TGF-β1 activated Smad2/3 but not Smad1/5, while high concentration of TGF-β1 was able to activate both Smad2/3 and Smad1/5. SB431542 but not ML347 was able to block the phosphorylation of Smad2/3 by TGF-β1. Either SB431542 or ML347 was able to block the phosphorylation of Smad1/5 by TGF-β1. EdU staining showed that high concentration of TGF-β1 promoted dental epithelial cell proliferation, which was reversed by silencing Smad1/5, whereas low concentration of TGF-β1 inhibited cell proliferation, which was reversed by silencing Smad2/3. In conclusions, TGF-β exhibits dual roles in the regulation of dental epithelial cell proliferation through two pathways. On the one hand, TGF-β activates canonical Smad2/3 signaling through ALK5, inhibiting the proliferation of internal dental epithelial cells. On the other hand, TGF-β activates noncanonical Smad1/5 signaling through ALK1/2-ALK5, promoting the proliferation of basal cells in the dental epithelial bud.[2]
A structure-activity relationship of the 3- and 6-positions of the pyrazolo[1,5-a]pyrimidine scaffold of the known BMP inhibitors dorsomorphin, 1, LDN-193189, 2, and DMH1, 3, led to the identification of a potent and selective compound for ALK2 versus ALK3. The potency contributions of several 3-position substituents were evaluated with subtle structural changes leading to significant changes in potency. From these studies, a novel 5-quinoline molecule was identified and designated an MLPCN probe molecule, ML347, which shows >300-fold selectivity for ALK2 and presents the community with a selective molecular probe for further biological evaluation.[1]
*注: 文献方法仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些方法的准确性
化学信息 & 存储运输条件
分子式
C22H16N4O
分子量
352.39
精确质量
352.132
元素分析
C, 74.98; H, 4.58; N, 15.90; O, 4.54
CAS号
1062368-49-3
相关CAS号
1062368-49-3
PubChem CID
44577753
外观&性状
Light yellow to yellow solid powder
密度
1.3±0.1 g/cm3
熔点
209-210℃
折射率
1.695
LogP
2.63
tPSA
52.31
氢键供体(HBD)数目
0
氢键受体(HBA)数目
4
可旋转键数目(RBC)
3
重原子数目
27
分子复杂度/Complexity
495
定义原子立体中心数目
0
InChi Key
FVRYPYDPKSZGNS-UHFFFAOYSA-N
InChi Code
InChI=1S/C22H16N4O/c1-27-17-9-7-15(8-10-17)16-12-24-22-20(13-25-26(22)14-16)18-4-2-6-21-19(18)5-3-11-23-21/h2-14H,1H3
化学名
5-[6-(4-methoxyphenyl)pyrazolo[1,5-a]pyrimidin-3-yl]quinoline
别名
LDN-193719; LDN193719; LDN 193719;ML-347; ML347; 5-[6-(4-methoxyphenyl)pyrazolo[1,5-a]pyrimidin-3-yl]quinoline; ML-347; 5-(6-(4-methoxyphenyl)pyrazolo[1,5-a]pyrimidin-3-yl)quinoline; LDN 193719; Quinoline, 5-[6-(4-methoxyphenyl)pyrazolo[1,5-a]pyrimidin-3-yl]-; CHEMBL502351; ML 347
HS Tariff Code
2934.99.9001
存储方式

Powder      -20°C    3 years

                     4°C     2 years

In solvent   -80°C    6 months

                  -20°C    1 month

运输条件
Room temperature (This product is stable at ambient temperature for a few days during ordinary shipping and time spent in Customs)
溶解度数据
溶解度 (体外实验)
DMSO: 10 mg/mL (28.4 mM)
Water:<1 mg/mL
Ethanol:<1 mg/mL
溶解度 (体内实验)
注意: 如下所列的是一些常用的体内动物实验溶解配方,主要用于溶解难溶或不溶于水的产品(水溶度<1 mg/mL)。 建议您先取少量样品进行尝试,如该配方可行,再根据实验需求增加样品量。

注射用配方
(IP/IV/IM/SC等)
注射用配方1: DMSO : Tween 80: Saline = 10 : 5 : 85 (如: 100 μL DMSO 50 μL Tween 80 850 μL Saline)
*生理盐水/Saline的制备:将0.9g氯化钠/NaCl溶解在100 mL ddH ₂ O中,得到澄清溶液。
注射用配方 2: DMSO : PEG300Tween 80 : Saline = 10 : 40 : 5 : 45 (如: 100 μL DMSO 400 μL PEG300 50 μL Tween 80 450 μL Saline)
注射用配方 3: DMSO : Corn oil = 10 : 90 (如: 100 μL DMSO 900 μL Corn oil)
示例: 注射用配方 3 (DMSO : Corn oil = 10 : 90) 为例说明, 如果要配制 1 mL 2.5 mg/mL的工作液, 您可以取 100 μL 25 mg/mL 澄清的 DMSO 储备液,加到 900 μL Corn oil/玉米油中, 混合均匀。
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注射用配方 4: DMSO : 20% SBE-β-CD in Saline = 10 : 90 [如:100 μL DMSO 900 μL (20% SBE-β-CD in Saline)]
*20% SBE-β-CD in Saline的制备(4°C,储存1周):将2g SBE-β-CD (磺丁基-β-环糊精) 溶解于10mL生理盐水中,得到澄清溶液。
注射用配方 5: 2-Hydroxypropyl-β-cyclodextrin : Saline = 50 : 50 (如: 500 μL 2-Hydroxypropyl-β-cyclodextrin (羟丙基环胡精) 500 μL Saline)
注射用配方 6: DMSO : PEG300 : Castor oil : Saline = 5 : 10 : 20 : 65 (如: 50 μL DMSO 100 μL PEG300 200 μL Castor oil 650 μL Saline)
注射用配方 7: Ethanol : Cremophor : Saline = 10: 10 : 80 (如: 100 μL Ethanol 100 μL Cremophor 800 μL Saline)
注射用配方 8: 溶解于Cremophor/Ethanol (50 : 50), 然后用生理盐水稀释。
注射用配方 9: EtOH : Corn oil = 10 : 90 (如: 100 μL EtOH 900 μL Corn oil)
注射用配方 10: EtOH : PEG300Tween 80 : Saline = 10 : 40 : 5 : 45 (如: 100 μL EtOH 400 μL PEG300 50 μL Tween 80 450 μL Saline)


口服配方
口服配方 1: 悬浮于0.5% CMC Na (羧甲基纤维素钠)
口服配方 2: 悬浮于0.5% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素)
示例: 口服配方 1 (悬浮于 0.5% CMC Na)为例说明, 如果要配制 100 mL 2.5 mg/mL 的工作液, 您可以先取0.5g CMC Na并将其溶解于100mL ddH2O中,得到0.5%CMC-Na澄清溶液;然后将250 mg待测化合物加到100 mL前述 0.5%CMC Na溶液中,得到悬浮液。
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口服配方 3: 溶解于 PEG400 (聚乙二醇400)
口服配方 4: 悬浮于0.2% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素)
口服配方 5: 溶解于0.25% Tween 80 and 0.5% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素)
口服配方 6: 做成粉末与食物混合


注意: 以上为较为常见方法,仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些配方的准确性。具体溶剂的选择首先应参照文献已报道溶解方法、配方或剂型,对于某些尚未有文献报道溶解方法的化合物,需通过前期实验来确定(建议先取少量样品进行尝试),包括产品的溶解情况、梯度设置、动物的耐受性等。

请根据您的实验动物和给药方式选择适当的溶解配方/方案:
1、请先配制澄清的储备液(如:用DMSO配置50 或 100 mg/mL母液(储备液));
2、取适量母液,按从左到右的顺序依次添加助溶剂,澄清后再加入下一助溶剂。以 下列配方为例说明 (注意此配方只用于说明,并不一定代表此产品 的实际溶解配方):
10% DMSO → 40% PEG300 → 5% Tween-80 → 45% ddH2O (或 saline);
假设最终工作液的体积为 1 mL, 浓度为5 mg/mL: 取 100 μL 50 mg/mL 的澄清 DMSO 储备液加到 400 μL PEG300 中,混合均匀/澄清;向上述体系中加入50 μL Tween-80,混合均匀/澄清;然后继续加入450 μL ddH2O (或 saline)定容至 1 mL;

3、溶剂前显示的百分比是指该溶剂在最终溶液/工作液中的体积所占比例;
4、 如产品在配制过程中出现沉淀/析出,可通过加热(≤50℃)或超声的方式助溶;
5、为保证最佳实验结果,工作液请现配现用!
6、如不确定怎么将母液配置成体内动物实验的工作液,请查看说明书或联系我们;
7、 以上所有助溶剂都可在 Invivochem.cn网站购买。
制备储备液 1 mg 5 mg 10 mg
1 mM 2.8378 mL 14.1888 mL 28.3776 mL
5 mM 0.5676 mL 2.8378 mL 5.6755 mL
10 mM 0.2838 mL 1.4189 mL 2.8378 mL

1、根据实验需要选择合适的溶剂配制储备液 (母液):对于大多数产品,InvivoChem推荐用DMSO配置母液 (比如:5、10、20mM或者10、20、50 mg/mL浓度),个别水溶性高的产品可直接溶于水。产品在DMSO 、水或其他溶剂中的具体溶解度详见上”溶解度 (体外)”部分;

2、如果您找不到您想要的溶解度信息,或者很难将产品溶解在溶液中,请联系我们;

3、建议使用下列计算器进行相关计算(摩尔浓度计算器、稀释计算器、分子量计算器、重组计算器等);

4、母液配好之后,将其分装到常规用量,并储存在-20°C或-80°C,尽量减少反复冻融循环。

计算器

摩尔浓度计算器可计算特定溶液所需的质量、体积/浓度,具体如下:

  • 计算制备已知体积和浓度的溶液所需的化合物的质量
  • 计算将已知质量的化合物溶解到所需浓度所需的溶液体积
  • 计算特定体积中已知质量的化合物产生的溶液的浓度
使用摩尔浓度计算器计算摩尔浓度的示例如下所示:
假如化合物的分子量为350.26 g/mol,在5mL DMSO中制备10mM储备液所需的化合物的质量是多少?
  • 在分子量(MW)框中输入350.26
  • 在“浓度”框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在“体积”框中输入5,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案17.513 mg出现在“质量”框中。以类似的方式,您可以计算体积和浓度。

稀释计算器可计算如何稀释已知浓度的储备液。例如,可以输入C1、C2和V2来计算V1,具体如下:

制备25毫升25μM溶液需要多少体积的10 mM储备溶液?
使用方程式C1V1=C2V2,其中C1=10mM,C2=25μM,V2=25 ml,V1未知:
  • 在C1框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在C2框中输入25,然后选择正确的单位(μM)
  • 在V2框中输入25,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案62.5μL(0.1 ml)出现在V1框中
g/mol

分子量计算器可计算化合物的分子量 (摩尔质量)和元素组成,具体如下:

注:化学分子式大小写敏感:C12H18N3O4  c12h18n3o4
计算化合物摩尔质量(分子量)的说明:
  • 要计算化合物的分子量 (摩尔质量),请输入化学/分子式,然后单击“计算”按钮。
分子质量、分子量、摩尔质量和摩尔量的定义:
  • 分子质量(或分子量)是一种物质的一个分子的质量,用统一的原子质量单位(u)表示。(1u等于碳-12中一个原子质量的1/12)
  • 摩尔质量(摩尔重量)是一摩尔物质的质量,以g/mol表示。
/

配液计算器可计算将特定质量的产品配成特定浓度所需的溶剂体积 (配液体积)

  • 输入试剂的质量、所需的配液浓度以及正确的单位
  • 单击“计算”按钮
  • 答案显示在体积框中
动物体内实验配方计算器(澄清溶液)
第一步:请输入基本实验信息(考虑到实验过程中的损耗,建议多配一只动物的药量)
第二步:请输入动物体内配方组成(配方适用于不溶/难溶于水的化合物),不同的产品和批次配方组成不同,如对配方有疑问,可先联系我们提供正确的体内实验配方。此外,请注意这只是一个配方计算器,而不是特定产品的确切配方。
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计算结果:

工作液浓度 mg/mL;

DMSO母液配制方法 mg 药物溶于 μL DMSO溶液(母液浓度 mg/mL)。如该浓度超过该批次药物DMSO溶解度,请首先与我们联系。

体内配方配制方法μL DMSO母液,加入 μL PEG300,混匀澄清后加入μL Tween 80,混匀澄清后加入 μL ddH2O,混匀澄清。

(1) 请确保溶液澄清之后,再加入下一种溶剂 (助溶剂) 。可利用涡旋、超声或水浴加热等方法助溶;
            (2) 一定要按顺序加入溶剂 (助溶剂) 。

生物数据图片
  • ML347

    Structures of previously disclosed BMP inhibitors, Dorsomorphin (DM),1, LDN-193189,2, and DMH1,3.2013 Jun 1;23(11):3248-52.

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