ML323

别名: ML-323; ML 323; ML323.
目录号: V1330 纯度: ≥98%
ML323 (ML-323; ML 323) 是一种新型、有效、高选择性的 USP1-UAF1 抑制剂,具有潜在的抗肿瘤活性。
ML323 CAS号: 1572414-83-5
产品类别: DUB
产品仅用于科学研究,不针对患者销售
规格 价格 库存 数量
5mg
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25mg
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纯度: ≥98%

产品描述
ML323 (ML-323; ML 323) 是一种新型、有效、高选择性的 USP1-UAF1 抑制剂,具有潜在的抗肿瘤活性。它抑制 USP1-UAF1,IC50 为 76 nM。 ML323 抑制 USP1-UAF1 去泛素酶复合物,对人 DUB、deSUMOylase、deneddylase 和不相关的蛋白酶具有出色的选择性。 ML323 将去泛素化与 DNA 损伤反应联系起来。 ML323 增强顺铂对非小细胞肺癌和骨肉瘤细胞的细胞毒性。 USP1-UAF1 是 DNA 损伤反应的关键调节因子,也是克服铂类抗癌药物耐药性的靶点。
生物活性&实验参考方法
靶点
USP1-UAF1, in Ub-Rho assay(IC50=76 nM);USP1-UAF1(Ki= 68 nM)
体外研究 (In Vitro)
体外活性:ML323 通过抑制 H596 细胞中的 USP1-UAF1 活性来抑制 PCNA 和 FANCD2 的去泛素化。此外,ML323 通过靶向两种主要的 DNA 损伤反应途径(TLS 和 FA),增强顺铂对 NSCLC H596 细胞和 U2OS 骨肉瘤细胞的细胞毒性。激酶测定:对于 HTS,使用泛素-罗丹明 110 作为底物监测 USP1-UAF1 活性,其中泛素 C 端甘氨酸和罗丹明之间的酰胺键水解导致荧光增加。该测定在 1,536 孔格式中小型化至 4 μL 体积,用于在定量 HTS 模式下筛选大约 402,701 种化合物,每种化合物在四到五个浓度范围内进行测试。该测定显示出稳健的性能,整个屏幕的平均 Z' 因子为 0.8。细胞测定:对于集落形成测定,细胞以每孔 300-500 个细胞的密度接种在六孔板中并生长过夜。然后用指定浓度的单独 ML323、单独顺铂或顺铂和 ML323 组合(1:1 或 1:4)处理细胞。用等体积的DMSO和盐水处理的细胞用作对照。处理 48 小时后,添加新鲜生长培养基,并将细胞再培养 5-10 天,以形成集落。对于 UV 组合处理,用指定浓度的 ML323 或等体积的 DMSO 处理细胞。 48小时后,除去培养基,并以指定剂量在254 nm处照射细胞。添加新鲜的生长培养基,并将细胞再培养 5-10 天,以形成集落。将未经UV照射但用ML323或等体积DMSO处理的细胞作为对照并指定为100%。集落形成后,用甲醇固定细胞并用0.5%结晶紫染色。对由 >50 个细胞组成的集落进行评分。菌落数由一式三份的平板确定。使用 GraphPad Prism 生成剂量反应曲线,并使用 CalcuSyn 进行分析以计算组合指数,该指数是针对添加固定比例的顺铂和 USP1-UAF1 抑制剂后受影响的细胞分数确定的。
体内研究 (In Vivo)
ML323促进病毒在体内的复制。[2]
在腹腔注射LPS之前用ML323预处理小鼠。ML323治疗降低了血清IFN-β水平,但没有显著降低TNF-α的量(图5、G和H),表明ML323在体内具有活性。然后,我们研究了ML323在体内VSV感染背景下对IFN-β表达和病毒复制的调节作用。ML323处理抑制了VSV诱导的腹膜灌洗中IFN-β的产生(图5I),并抑制了腹膜渗出细胞中TBK1蛋白的表达(图5J)。此外,在ML323处理的小鼠的血清中,VSV感染诱导的IFN-β分泌远低于对照小鼠(图5K)。因此,ML323处理的小鼠的肝脏、肺和脾脏中IFN-βmRNA的表达低于对照组(图5L)。根据IFN-β表达的减少,ML323处理的小鼠的肝、肺和脾脏中的VSV复制高于对照组(图5M)。与VSV感染后的对照小鼠相比,在ML323处理的小鼠的肺中观察到免疫细胞的严重浸润(图5N)。总之,这些数据表明,ML323在体外和体内减弱了VSV诱导的IFN-β表达,从而促进了VSV的复制。
酶活实验
ML-323 以 10 μM 单剂量重复测试,用于 DUB 分析。作为底物,Ub-7-amido-4-methylcoumarin (AMC) 用于追踪 DUB 活性。斜率的初始线性部分(信号/分钟)是随时间分析的游离 AMC 荧光信号增加的唯一部分。当酶不含化合物时,其活性为 100%。 ML-323 从 20 μM 开始针对 70 种蛋白酶进行三倍系列稀释,以进行蛋白酶分析。在添加适当的酶底物之前,将化合物与蛋白酶预孵育五到十五分钟。通过分析荧光标记肽的荧光信号,可以确定酶的活性[1]。
细胞实验
使用 CCK-8 溶液,细胞计数试剂盒 (CCK) 测定可确定细胞的活力。在六孔板中,细胞以每孔 300-500 个细胞的密度接种,用于集落形成测定,并在那里生长一整晚。然后,在指定浓度下,用单独的 ML-323、单独的顺铂或顺铂和 ML-323 的组合(1:1 或 1:4)处理细胞。作为对照,使用用相同体积的 DMSO 和盐水处理的细胞。为了实现集落形成,处理 48 小时后添加新鲜的生长培养基,然后将细胞再孵育 5-10 天。使用推荐浓度的 ML-323 或等体积的 DMSO 处理细胞以进行 UV 组合治疗。 48小时后除去培养基,并对细胞施加规定剂量的254 nm辐射。为了形成集落,添加新鲜的生长培养基,并将细胞再培养五到十天。作为对照,未暴露于紫外线但用 ML-323 或等量 DMSO 处理的细胞表示为 100%。集落形成后,用甲醇固定细胞并用 0.5% 结晶紫染色。细胞数超过 50 个的集落会被评分。一式三份的板用于计算菌落数。使用 GraphPad Prism 创建剂量反应曲线,并使用 CalcuSyn 进行分析以确定组合指数,该指数基于添加固定的后受影响细胞的百分比顺铂和 USP1-UAF1 抑制剂的比例[1]。
动物实验
In vivo LPS challenge[3]
C57BL/6J mice (females, 6–8 wk old) were i.p. injected with 10 mg/kg ML323 for 6 h and then i.p. injected with 10 mg/kg LPS for 2 h. Serum levels of IFN-β and TNF-α were measured by ELISA.
Viral pathogenesis in mice[3]
C57BL/6J mice (females, 8 wk old) were i.p. infected with VSV (5 × 107 PFU/mouse). 10 mg/kg ML323 was i.p. administered 6 h before VSV infection. Lungs from control or virus-infected mice were dissected, fixed in 10% (vol/vol) phosphate-buffered formalin, embedded into paraffin, sectioned, stained with hematoxylin and eosin (H&E) solution, and examined by light microscopy for histological changes.
参考文献

[1]. A selective USP1-UAF1 inhibitor links deubiquitination to DNA damage responses. Nat Chem Biol. 2014 Apr;10(4):298-304.

[2]. Discovery of ML323 as a Novel Inhibitor of the USP1/UAF1 Deubiquitinase Complex. National Center for Biotechnology Information; 2010-2012 Oct 23.

[3]. J Exp Med. 2017 Dec 4; 214(12): 3553–3563.
其他信息
Optimal activation of TANK-binding kinase 1 (TBK1) is crucial for initiation of innate antiviral immunity and maintenance of immune homeostasis. Although several E3 ubiquitin ligases have been reported to regulate TBK1 activation by mediating its polyubiquitination, the functions of deubiquitinase on TBK1 activity remain largely unclear. Here, we identified a deubiquitinase complex, which is formed by ubiquitin specific peptidase 1 (USP1) and USP1-associated factor 1 (UAF1), as a viral infection-induced physiological enhancer of TBK1 expression. USP1-UAF1 complex enhanced TLR3/4 and RIG-I-induced IFN regulatory factor 3 (IRF3) activation and subsequent IFN-β secretion. Mechanistically, USP1 and UAF1 bound to TBK1, removed its K48-linked polyubiquitination, and then reversed the degradation process of TBK1. Furthermore, we found that ML323, a specific USP1-UAF1 inhibitor, attenuated IFN-β expression and enhanced viral replication both in vitro and in vivo. Therefore, our results outline a novel mechanism for the control of TBK1 activity and suggest USP1-UAF1 complex as a potential target for the prevention of viral diseases.[3]
*注: 文献方法仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些方法的准确性
化学信息 & 存储运输条件
分子式
C23H24N6
分子量
384.480
精确质量
384.206
元素分析
C, 71.85; H, 6.29; N, 21.86
CAS号
1572414-83-5
相关CAS号
1572414-83-5
PubChem CID
60167849
外观&性状
White solid powder
密度
1.2±0.1 g/cm3
沸点
515.4±60.0 °C at 760 mmHg
闪点
265.5±32.9 °C
蒸汽压
0.0±1.3 mmHg at 25°C
折射率
1.651
LogP
4.61
tPSA
68.52
氢键供体(HBD)数目
1
氢键受体(HBA)数目
5
可旋转键数目(RBC)
6
重原子数目
29
分子复杂度/Complexity
492
定义原子立体中心数目
0
SMILES
N([H])(C([H])([H])C1C([H])=C([H])C(=C([H])C=1[H])N1C([H])=C([H])N=N1)C1C(C([H])([H])[H])=C([H])N=C(C2=C([H])C([H])=C([H])C([H])=C2C([H])(C([H])([H])[H])C([H])([H])[H])N=1
InChi Key
VUIRVWPJNKZOSS-UHFFFAOYSA-N
InChi Code
InChI=1S/C23H24N6/c1-16(2)20-6-4-5-7-21(20)23-24-14-17(3)22(27-23)25-15-18-8-10-19(11-9-18)29-13-12-26-28-29/h4-14,16H,15H2,1-3H3,(H,24,25,27)
化学名
N-(4-(1H-1,2,3-triazol-1-yl)benzyl)-2-(2-isopropylphenyl)-5-methylpyrimidin-4-amine
别名
ML-323; ML 323; ML323.
HS Tariff Code
2934.99.9001
存储方式

Powder      -20°C    3 years

                     4°C     2 years

In solvent   -80°C    6 months

                  -20°C    1 month

运输条件
Room temperature (This product is stable at ambient temperature for a few days during ordinary shipping and time spent in Customs)
溶解度数据
溶解度 (体外实验)
DMSO : 49~76 mg/mL ( 127.44~197.66 mM )
Ethanol : ~38 mg/mL
溶解度 (体内实验)
配方 1 中的溶解度: ≥ 2.5 mg/mL (6.50 mM) (饱和度未知) in 10% DMSO + 40% PEG300 + 5% Tween80 + 45% Saline (这些助溶剂从左到右依次添加,逐一添加), 澄清溶液。
例如,若需制备1 mL的工作液,可将100 μL 25.0 mg/mL澄清DMSO储备液加入到400 μL PEG300中,混匀;然后向上述溶液中加入50 μL Tween-80,混匀;加入450 μL生理盐水定容至1 mL。
*生理盐水的制备:将 0.9 g 氯化钠溶解在 100 mL ddH₂O中,得到澄清溶液。

配方 2 中的溶解度: ≥ 2.5 mg/mL (6.50 mM) (饱和度未知) in 10% DMSO + 90% (20% SBE-β-CD in Saline) (这些助溶剂从左到右依次添加,逐一添加), 澄清溶液。
例如,若需制备1 mL的工作液,可将 100 μL 25.0 mg/mL澄清DMSO储备液加入900 μL 20% SBE-β-CD生理盐水溶液中,混匀。
*20% SBE-β-CD 生理盐水溶液的制备(4°C,1 周):将 2 g SBE-β-CD 溶解于 10 mL 生理盐水中,得到澄清溶液。

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配方 3 中的溶解度: ≥ 2.5 mg/mL (6.50 mM) (饱和度未知) in 10% DMSO + 90% Corn Oil (这些助溶剂从左到右依次添加,逐一添加), 澄清溶液。
例如,若需制备1 mL的工作液,可将 100 μL 25.0 mg/mL 澄清 DMSO 储备液加入到 900 μL 玉米油中并混合均匀。


请根据您的实验动物和给药方式选择适当的溶解配方/方案:
1、请先配制澄清的储备液(如:用DMSO配置50 或 100 mg/mL母液(储备液));
2、取适量母液,按从左到右的顺序依次添加助溶剂,澄清后再加入下一助溶剂。以 下列配方为例说明 (注意此配方只用于说明,并不一定代表此产品 的实际溶解配方):
10% DMSO → 40% PEG300 → 5% Tween-80 → 45% ddH2O (或 saline);
假设最终工作液的体积为 1 mL, 浓度为5 mg/mL: 取 100 μL 50 mg/mL 的澄清 DMSO 储备液加到 400 μL PEG300 中,混合均匀/澄清;向上述体系中加入50 μL Tween-80,混合均匀/澄清;然后继续加入450 μL ddH2O (或 saline)定容至 1 mL;

3、溶剂前显示的百分比是指该溶剂在最终溶液/工作液中的体积所占比例;
4、 如产品在配制过程中出现沉淀/析出,可通过加热(≤50℃)或超声的方式助溶;
5、为保证最佳实验结果,工作液请现配现用!
6、如不确定怎么将母液配置成体内动物实验的工作液,请查看说明书或联系我们;
7、 以上所有助溶剂都可在 Invivochem.cn网站购买。
制备储备液 1 mg 5 mg 10 mg
1 mM 2.6009 mL 13.0046 mL 26.0092 mL
5 mM 0.5202 mL 2.6009 mL 5.2018 mL
10 mM 0.2601 mL 1.3005 mL 2.6009 mL

1、根据实验需要选择合适的溶剂配制储备液 (母液):对于大多数产品,InvivoChem推荐用DMSO配置母液 (比如:5、10、20mM或者10、20、50 mg/mL浓度),个别水溶性高的产品可直接溶于水。产品在DMSO 、水或其他溶剂中的具体溶解度详见上”溶解度 (体外)”部分;

2、如果您找不到您想要的溶解度信息,或者很难将产品溶解在溶液中,请联系我们;

3、建议使用下列计算器进行相关计算(摩尔浓度计算器、稀释计算器、分子量计算器、重组计算器等);

4、母液配好之后,将其分装到常规用量,并储存在-20°C或-80°C,尽量减少反复冻融循环。

计算器

摩尔浓度计算器可计算特定溶液所需的质量、体积/浓度,具体如下:

  • 计算制备已知体积和浓度的溶液所需的化合物的质量
  • 计算将已知质量的化合物溶解到所需浓度所需的溶液体积
  • 计算特定体积中已知质量的化合物产生的溶液的浓度
使用摩尔浓度计算器计算摩尔浓度的示例如下所示:
假如化合物的分子量为350.26 g/mol,在5mL DMSO中制备10mM储备液所需的化合物的质量是多少?
  • 在分子量(MW)框中输入350.26
  • 在“浓度”框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在“体积”框中输入5,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案17.513 mg出现在“质量”框中。以类似的方式,您可以计算体积和浓度。

稀释计算器可计算如何稀释已知浓度的储备液。例如,可以输入C1、C2和V2来计算V1,具体如下:

制备25毫升25μM溶液需要多少体积的10 mM储备溶液?
使用方程式C1V1=C2V2,其中C1=10mM,C2=25μM,V2=25 ml,V1未知:
  • 在C1框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在C2框中输入25,然后选择正确的单位(μM)
  • 在V2框中输入25,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案62.5μL(0.1 ml)出现在V1框中
g/mol

分子量计算器可计算化合物的分子量 (摩尔质量)和元素组成,具体如下:

注:化学分子式大小写敏感:C12H18N3O4  c12h18n3o4
计算化合物摩尔质量(分子量)的说明:
  • 要计算化合物的分子量 (摩尔质量),请输入化学/分子式,然后单击“计算”按钮。
分子质量、分子量、摩尔质量和摩尔量的定义:
  • 分子质量(或分子量)是一种物质的一个分子的质量,用统一的原子质量单位(u)表示。(1u等于碳-12中一个原子质量的1/12)
  • 摩尔质量(摩尔重量)是一摩尔物质的质量,以g/mol表示。
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配液计算器可计算将特定质量的产品配成特定浓度所需的溶剂体积 (配液体积)

  • 输入试剂的质量、所需的配液浓度以及正确的单位
  • 单击“计算”按钮
  • 答案显示在体积框中
动物体内实验配方计算器(澄清溶液)
第一步:请输入基本实验信息(考虑到实验过程中的损耗,建议多配一只动物的药量)
第二步:请输入动物体内配方组成(配方适用于不溶/难溶于水的化合物),不同的产品和批次配方组成不同,如对配方有疑问,可先联系我们提供正确的体内实验配方。此外,请注意这只是一个配方计算器,而不是特定产品的确切配方。
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计算结果:

工作液浓度 mg/mL;

DMSO母液配制方法 mg 药物溶于 μL DMSO溶液(母液浓度 mg/mL)。如该浓度超过该批次药物DMSO溶解度,请首先与我们联系。

体内配方配制方法μL DMSO母液,加入 μL PEG300,混匀澄清后加入μL Tween 80,混匀澄清后加入 μL ddH2O,混匀澄清。

(1) 请确保溶液澄清之后,再加入下一种溶剂 (助溶剂) 。可利用涡旋、超声或水浴加热等方法助溶;
            (2) 一定要按顺序加入溶剂 (助溶剂) 。

生物数据图片
  • ML323 is a potent USP1-UAF1 inhibitor through a mixed inhibition mechanism. [1].A selective USP1-UAF1 inhibitor links deubiquitination to DNA damage responses. Nat Chem Biol. 2014 Apr;10(4):298-304.
  • Selective inhibition of USP1 by ML323 revealed by DUB profiling. [1].A selective USP1-UAF1 inhibitor links deubiquitination to DNA damage responses. Nat Chem Biol. 2014 Apr;10(4):298-304.
  • The effect of inhibiting USP1-UAF1 by ML323 in the TLS and FA pathways.[1].A selective USP1-UAF1 inhibitor links deubiquitination to DNA damage responses. Nat Chem Biol. 2014 Apr;10(4):298-304.
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