D 4476

别名: D-4476; 301836-43-1; D4476; CK1 Inhibitor; casein kinase I inhibitor; D 4476; D-4476; Casein Kinase I Inhibitor, 4-(4-(2,3-Dihydrobenzo[1,4]dioxin-6-yl)-5-pyridin-2-yl-1H-imidazol-2-yl)benzamide; D4476; Casein Kinase I Inhibitor; D 4476 4-[4-(2,3-二氢-1,4-苯并二噁英-6-基)-5-(2-吡啶)-1H-咪唑-2-基]-苯甲酰胺; 4-[4-(2,3-二氢-1,4-苯并二氧杂环己-6-基)-5-(2-吡啶基)-1H-咪唑-2-基]苯甲酰胺;D4476
目录号: V0958 纯度: ≥98%
4476(D-4476;D4476;酪蛋白激酶 I 抑制剂)是一种有效的、选择性的、细胞渗透性的 CK1(酪蛋白激酶 1)抑制剂,具有潜在的抗肿瘤活性。
D 4476 CAS号: 301836-43-1
产品类别: Casein Kinase
产品仅用于科学研究,不针对患者销售
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纯度: ≥98%

产品描述
D 4476(D-4476;D4476;酪蛋白激酶 I 抑制剂)是一种有效的、选择性的、细胞渗透性的 CK1(酪蛋白激酶 1)抑制剂,具有潜在的抗肿瘤活性。它抑制粟酒裂殖酵母的 CK1 和 CK1δ,在无细胞测定中 IC50 分别为 200 nM 和 300 nM。它还充当 ALK5 抑制剂,IC50 为 500 nM。 D4476 抑制 FOXO1a 的位点特异性磷酸化和核排斥。 D4476 特异性抑制其 MPD 内的内源性叉头盒转录因子 O1a (FOXO1a) 在 Ser322 和 Ser325 上的磷酸化,而不影响其他位点的磷酸化。
生物活性&实验参考方法
靶点
CK1/casein kinase 1(IC50 = 0.3 μM)
体外研究 (In Vitro)
D4476 是一种细胞内和体外强效、高选择性 CK1 抑制剂。 D4476 选择性防止 H4IIE 肝癌细胞中 MPD 内的内源性叉头盒转录因子 O1a (FOXO1a) 在 Ser322 和 Ser325 上磷酸化,而其他位点不受影响。使用 0.1 mM ATP 和磷酸化肽 TFRPRTSpSNASTIS(对应于 FOXO1a 残基 312-325),CK1δ 被抑制,IC50 值为 0.3 μM。 D4476 是 CK1 的 ATP 竞争性抑制剂,当 ATP 浓度下降时,CK1δ 的 IC50 值逐渐下降即可看出 [1]。
体内研究 (In Vivo)
在临床前GBM模型中,D4476治疗显著抑制了放疗引起的促炎因子的增加,提高了放疗敏感性,从而抑制了肿瘤生长并延长了动物存活时间。这些结果表明,靶向Csnk1a1作为炎性因子的抑制剂发挥抗肿瘤作用,为胶质瘤的治疗提供了一种新策略[3]。
酶活实验
EdU掺入试验[3]
细胞光EdU细胞增殖检测试剂盒用于检测细胞增殖。27将稳定表达shRNA或用不同浓度D4476处理的p3×Flag-Csnk1a1转染的细胞培养在96孔板中。24小时后,将细胞与50μL EdU孵育4小时,用4%多聚甲醛固定15分钟,用0.5%Triton X-100处理20分钟。然后将细胞与1×Apollo反应混合物在黑暗中孵育30分钟,用DAPI染色20分钟。用PBS洗涤三次后,在荧光倒置显微镜下获取细胞图像。
细胞实验
D4476的细胞培养和使用。[1]
如前所述培养并裂解293细胞(Rena等人,2001)。H4IIE肝癌细胞与293细胞一样进行培养和裂解,不同的是使用15cm的培养皿并将其保存在含有1mg ml-1葡萄糖和5%胎牛血清的DMEM中。将CKI-7、IC261和D4476以100mM的浓度溶解在二甲基亚砜(DMSO)中。当直接稀释到水性细胞培养基中时,D4476仅微溶(数据未显示)。为了提高溶解度,我们首先在21°C下将1μl 100 mM D4476稀释在6μl无血清培养基和3μl Fugene 6的混合物中,然后将该溶液逐滴加入培养的细胞中。细胞对D4476的反应不受化合物至少三次冻融循环的影响。在对照实验中,D4476被DMSO替代。
使用D4476进行药物治疗。[2]
为了抑制Csnk1a1,使用了小分子D4476。将D4476加入到在补充有10ng/ml mIL-3的培养基中的96孔板(每孔5000个细胞)中培养的白血病细胞中。通过向细胞培养物中加入2.5µM、5µM、10µM、20µM和40µM D4476进行D4476剂量滴定,最终DMSO百分比为0.4%。同样,将D4476加入到在补充了mTpo和mScf的SFEM培养基中培养的LSK细胞中。使用流式细胞术用CountBright绝对计数珠评估处理96小时后的细胞数量。
集落形成试验[2]
将U87和LN229细胞接种到6孔板中。每个孔有500个细胞,每组有三个重复孔。实验组用指定浓度(0、5和10μM)的D4476治疗,联合4 Gy的放疗。24小时后,用新鲜的无药物培养基进一步培养10-14天。然后,用PBS洗涤细胞,用甲醇固定,用0.1%结晶紫溶液染色。洗涤后,在显微镜下对细胞进行成像和计数。
细胞周期和凋亡分析[2]
U87和LN229细胞用特定浓度的D4476处理,shRNA细胞与放疗联合培养24小时。然后,在4°C下以1000 rpm离心5分钟,用70%冷甲醇固定过夜。用PBS洗涤两次后,用含有50μg/mL碘化丙啶(PI)和25μg/mL核糖核酸酶(RNase)的染色溶液对细胞进行染色30分钟。使用流式细胞术和集成流式细胞仪软件分析细胞周期。 为了评估凋亡,收集处理过的细胞,用预冷的PBS洗涤两次,并重新悬浮在预冷的结合缓冲液中。接下来,将约5μL Annexin V-FITC和5μL PI加入细胞悬浮液中,在黑暗中冰上孵育10分钟。使用流式细胞术检测细胞凋亡。
动物实验
In vivo studies[3]
Animal experiments were approved by the Ethics Committee of Xuzhou Medical University. In this study, 5- to 6-week-old male BALB/c athymic nude mice were used. GCS2 cells (5 × 105 cells per mouse) were injected intracranially into the right striatum of these mice with a small animal stereotactic apparatus.29 Five days later, nude mice bearing tumour cells were randomly divided into four groups (14 mice in each group), including the control, D4476 (50 mg/kg; intraperitoneally administered every other day), radiotherapy (2 Gy every other day, total 10 Gy) and D4476 + radiotherapy (D4476 at 50 mg/kg combined with radiotherapy at 2 Gy, every other day) groups. Seven mice in each group were randomly selected and killed after 25 days of treatment. Tumours were extracted for H&E staining and mRNA extraction. The remaining seven mice in each group were used for survival analysis.
参考文献

[1]. D4476, a cell-permeant inhibitor of CK1, suppresses the site-specific phosphorylation and nuclear exclusion of FOXO1a. EMBO Rep. 2004 Jan;5(1):60-5.

[2]. Csnk1a1 inhibition has p53-dependent therapeutic efficacy?in?acute myeloid leukemia. J Exp Med.?2014 Apr 7;211(4):605-12.

[3]. Csnk1a1 inhibition modulates the inflammatory secretome and enhances response to radiotherapy in glioma. J Cell Mol Med . 2021 Aug;25(15):7395-7406.

其他信息
4-[4-(2,3-dihydro-1,4-benzodioxin-6-yl)-5-(2-pyridinyl)-1H-imidazol-2-yl]benzamide is a member of imidazoles.
The protein kinase CK1 phosphorylates serine residues that are located close to another phosphoserine in the consensus pSer-Xaa-Xaa-Ser. This specificity generates regions in its target proteins containing two or more neighbouring phosphoserine residues, termed here multisite phosphorylation domains (MPDs). In this paper, we demonstrate that D4476 is a potent and rather selective inhibitor of CK1 in vitro and in cells. In H4IIE hepatoma cells, D4476 specifically inhibits the phosphorylation of endogenous forkhead box transcription factor O1a (FOXO1a) on Ser322 and Ser325 within its MPD, without affecting the phosphorylation of other sites. Our results indicate that these residues are targeted by CK1 in vivo and that the CK1-mediated phosphorylation of the MPD is required for accelerated nuclear exclusion of FOXO1a in response to IGF-1 and insulin. D4476 is much more potent and specific than IC261 or CKI-7, and is therefore the most useful CK1 inhibitor currently available for identifying physiological substrates of CK1.[1]
Despite extensive insights into the underlying genetics and biology of acute myeloid leukemia (AML), overall survival remains poor and new therapies are needed. We found that casein kinase 1 α (Csnk1a1), a serine-threonine kinase, is essential for AML cell survival in vivo. Normal hematopoietic stem and progenitor cells (HSPCs) were relatively less affected by shRNA-mediated knockdown of Csnk1a1. To identify downstream mediators of Csnk1a1 critical for leukemia cells, we performed an in vivo pooled shRNA screen and gene expression profiling. We found that Csnk1a1 knockdown results in decreased Rps6 phosphorylation, increased p53 activity, and myeloid differentiation. Consistent with these observations, p53-null leukemias were insensitive to Csnk1a1 knockdown. We further evaluated whether D4476, a casein kinase 1 inhibitor, would exhibit selective antileukemic effects. Treatment of leukemia stem cells (LSCs) with D4476 showed highly selective killing of LSCs over normal HSPCs. In summary, these findings demonstrate that Csnk1a1 inhibition causes reduced Rps6 phosphorylation and activation of p53, resulting in selective elimination of leukemia cells, revealing Csnk1a1 as a potential therapeutic target for the treatment of AML.[2]
Glioblastoma multiforme (GBM), a fatal brain tumour with no available targeted therapies, has a poor prognosis. At present, radiotherapy is one of the main methods to treat glioma, but it leads to an obvious increase in inflammatory factors in the tumour microenvironment, especially IL-6 and CXCL1, which plays a role in tumour to resistance radiotherapy and tumorigenesis. Casein kinase 1 alpha 1 (CK1α) (encoded on chromosome 5q by Csnk1a1) is considered an attractive target for Tp53 wild-type acute myeloid leukaemia (AML) treatment. In this study, we evaluated the anti-tumour effect of Csnk1a1 suppression in GBM cells in vitro and in vivo. We found that down-regulation of Csnk1a1 or inhibition by D4476, a Csnk1a1 inhibitor, reduced GBM cell proliferation efficiently in both Tp53 wild-type and Tp53-mutant GBM cells. On the contrary, overexpression of Csnk1a1 promoted cell proliferation and colony formation. Csnk1a1 inhibition improved the sensitivity to radiotherapy. Furthermore, down-regulation of Csnk1a1 reduced the production and secretion of pro-inflammatory factors. In the preclinical GBM model, treatment with D4476 significantly inhibited the increase in pro-inflammatory factors caused by radiotherapy and improved radiotherapy sensitivity, thus inhibiting tumour growth and prolonging animal survival time. These results suggest targeting Csnk1a1 exert an anti-tumour role as an inhibitor of inflammatory factors, providing a new strategy for the treatment of glioma.[3]
*注: 文献方法仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些方法的准确性
化学信息 & 存储运输条件
分子式
C23H18N4O3
分子量
398.41
精确质量
398.137
元素分析
C, 69.34; H, 4.55; N, 14.06; O, 12.05
CAS号
301836-43-1
相关CAS号
301836-43-1
PubChem CID
6419753
外观&性状
White to yellow solid powder
密度
1.3±0.1 g/cm3
沸点
675.0±55.0 °C at 760 mmHg
闪点
362.0±31.5 °C
蒸汽压
0.0±2.1 mmHg at 25°C
折射率
1.663
LogP
3.84
tPSA
103.12
氢键供体(HBD)数目
2
氢键受体(HBA)数目
5
可旋转键数目(RBC)
4
重原子数目
30
分子复杂度/Complexity
597
定义原子立体中心数目
0
InChi Key
DPDZHVCKYBCJHW-UHFFFAOYSA-N
InChi Code
InChI=1S/C23H18N4O3/c24-22(28)14-4-6-15(7-5-14)23-26-20(21(27-23)17-3-1-2-10-25-17)16-8-9-18-19(13-16)30-12-11-29-18/h1-10,13H,11-12H2,(H2,24,28)(H,26,27)
化学名
4-[4-(2,3-dihydro-1,4-benzodioxin-6-yl)-5-pyridin-2-yl-1H-imidazol-2-yl]benzamide
别名
D-4476; 301836-43-1; D4476; CK1 Inhibitor; casein kinase I inhibitor; D 4476; D-4476; Casein Kinase I Inhibitor, 4-(4-(2,3-Dihydrobenzo[1,4]dioxin-6-yl)-5-pyridin-2-yl-1H-imidazol-2-yl)benzamide; D4476; Casein Kinase I Inhibitor; D 4476
HS Tariff Code
2934.99.9001
存储方式

Powder      -20°C    3 years

                     4°C     2 years

In solvent   -80°C    6 months

                  -20°C    1 month

运输条件
Room temperature (This product is stable at ambient temperature for a few days during ordinary shipping and time spent in Customs)
溶解度数据
溶解度 (体外实验)
DMSO: 79 mg/mL (198.3 mM)
Water:<1 mg/mL
Ethanol:<1 mg/mL
溶解度 (体内实验)
配方 1 中的溶解度: ≥ 2.5 mg/mL (6.27 mM) (饱和度未知) in 10% DMSO + 40% PEG300 + 5% Tween80 + 45% Saline (这些助溶剂从左到右依次添加,逐一添加), 澄清溶液。
例如,若需制备1 mL的工作液,可将100 μL 25.0 mg/mL澄清DMSO储备液加入到400 μL PEG300中,混匀;然后向上述溶液中加入50 μL Tween-80,混匀;加入450 μL生理盐水定容至1 mL。
*生理盐水的制备:将 0.9 g 氯化钠溶解在 100 mL ddH₂O中,得到澄清溶液。

配方 2 中的溶解度: ≥ 2.5 mg/mL (6.27 mM) (饱和度未知) in 10% DMSO + 90% (20% SBE-β-CD in Saline) (这些助溶剂从左到右依次添加,逐一添加), 澄清溶液。
例如,若需制备1 mL的工作液,可将 100 μL 25.0 mg/mL澄清DMSO储备液加入900 μL 20% SBE-β-CD生理盐水溶液中,混匀。
*20% SBE-β-CD 生理盐水溶液的制备(4°C,1 周):将 2 g SBE-β-CD 溶解于 10 mL 生理盐水中,得到澄清溶液。

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配方 3 中的溶解度: ≥ 2.5 mg/mL (6.27 mM) (饱和度未知) in 10% DMSO + 90% Corn Oil (这些助溶剂从左到右依次添加,逐一添加), 澄清溶液。
例如,若需制备1 mL的工作液,可将 100 μL 25.0 mg/mL 澄清 DMSO 储备液加入到 900 μL 玉米油中并混合均匀。


请根据您的实验动物和给药方式选择适当的溶解配方/方案:
1、请先配制澄清的储备液(如:用DMSO配置50 或 100 mg/mL母液(储备液));
2、取适量母液,按从左到右的顺序依次添加助溶剂,澄清后再加入下一助溶剂。以 下列配方为例说明 (注意此配方只用于说明,并不一定代表此产品 的实际溶解配方):
10% DMSO → 40% PEG300 → 5% Tween-80 → 45% ddH2O (或 saline);
假设最终工作液的体积为 1 mL, 浓度为5 mg/mL: 取 100 μL 50 mg/mL 的澄清 DMSO 储备液加到 400 μL PEG300 中,混合均匀/澄清;向上述体系中加入50 μL Tween-80,混合均匀/澄清;然后继续加入450 μL ddH2O (或 saline)定容至 1 mL;

3、溶剂前显示的百分比是指该溶剂在最终溶液/工作液中的体积所占比例;
4、 如产品在配制过程中出现沉淀/析出,可通过加热(≤50℃)或超声的方式助溶;
5、为保证最佳实验结果,工作液请现配现用!
6、如不确定怎么将母液配置成体内动物实验的工作液,请查看说明书或联系我们;
7、 以上所有助溶剂都可在 Invivochem.cn网站购买。
制备储备液 1 mg 5 mg 10 mg
1 mM 2.5100 mL 12.5499 mL 25.0998 mL
5 mM 0.5020 mL 2.5100 mL 5.0200 mL
10 mM 0.2510 mL 1.2550 mL 2.5100 mL

1、根据实验需要选择合适的溶剂配制储备液 (母液):对于大多数产品,InvivoChem推荐用DMSO配置母液 (比如:5、10、20mM或者10、20、50 mg/mL浓度),个别水溶性高的产品可直接溶于水。产品在DMSO 、水或其他溶剂中的具体溶解度详见上”溶解度 (体外)”部分;

2、如果您找不到您想要的溶解度信息,或者很难将产品溶解在溶液中,请联系我们;

3、建议使用下列计算器进行相关计算(摩尔浓度计算器、稀释计算器、分子量计算器、重组计算器等);

4、母液配好之后,将其分装到常规用量,并储存在-20°C或-80°C,尽量减少反复冻融循环。

计算器

摩尔浓度计算器可计算特定溶液所需的质量、体积/浓度,具体如下:

  • 计算制备已知体积和浓度的溶液所需的化合物的质量
  • 计算将已知质量的化合物溶解到所需浓度所需的溶液体积
  • 计算特定体积中已知质量的化合物产生的溶液的浓度
使用摩尔浓度计算器计算摩尔浓度的示例如下所示:
假如化合物的分子量为350.26 g/mol,在5mL DMSO中制备10mM储备液所需的化合物的质量是多少?
  • 在分子量(MW)框中输入350.26
  • 在“浓度”框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在“体积”框中输入5,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案17.513 mg出现在“质量”框中。以类似的方式,您可以计算体积和浓度。

稀释计算器可计算如何稀释已知浓度的储备液。例如,可以输入C1、C2和V2来计算V1,具体如下:

制备25毫升25μM溶液需要多少体积的10 mM储备溶液?
使用方程式C1V1=C2V2,其中C1=10mM,C2=25μM,V2=25 ml,V1未知:
  • 在C1框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在C2框中输入25,然后选择正确的单位(μM)
  • 在V2框中输入25,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案62.5μL(0.1 ml)出现在V1框中
g/mol

分子量计算器可计算化合物的分子量 (摩尔质量)和元素组成,具体如下:

注:化学分子式大小写敏感:C12H18N3O4  c12h18n3o4
计算化合物摩尔质量(分子量)的说明:
  • 要计算化合物的分子量 (摩尔质量),请输入化学/分子式,然后单击“计算”按钮。
分子质量、分子量、摩尔质量和摩尔量的定义:
  • 分子质量(或分子量)是一种物质的一个分子的质量,用统一的原子质量单位(u)表示。(1u等于碳-12中一个原子质量的1/12)
  • 摩尔质量(摩尔重量)是一摩尔物质的质量,以g/mol表示。
/

配液计算器可计算将特定质量的产品配成特定浓度所需的溶剂体积 (配液体积)

  • 输入试剂的质量、所需的配液浓度以及正确的单位
  • 单击“计算”按钮
  • 答案显示在体积框中
动物体内实验配方计算器(澄清溶液)
第一步:请输入基本实验信息(考虑到实验过程中的损耗,建议多配一只动物的药量)
第二步:请输入动物体内配方组成(配方适用于不溶/难溶于水的化合物),不同的产品和批次配方组成不同,如对配方有疑问,可先联系我们提供正确的体内实验配方。此外,请注意这只是一个配方计算器,而不是特定产品的确切配方。
+
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计算结果:

工作液浓度 mg/mL;

DMSO母液配制方法 mg 药物溶于 μL DMSO溶液(母液浓度 mg/mL)。如该浓度超过该批次药物DMSO溶解度,请首先与我们联系。

体内配方配制方法μL DMSO母液,加入 μL PEG300,混匀澄清后加入μL Tween 80,混匀澄清后加入 μL ddH2O,混匀澄清。

(1) 请确保溶液澄清之后,再加入下一种溶剂 (助溶剂) 。可利用涡旋、超声或水浴加热等方法助溶;
            (2) 一定要按顺序加入溶剂 (助溶剂) 。

临床试验信息
NCT Number Recruitment interventions Conditions Sponsor/Collaborators Start Date Phases
NCT00833417 Completed Has Results Drug: Vismodegib 150 mg Basal Cell Carcinoma Genentech, Inc. February 2009 Phase 2
生物数据图片
  • D 4476

    D4476 specifically inhibits the phosphorylation at Ser322 and Ser325 specifically in H4IIE cells. EMBO Rep. 2004 Jan;5(1):60-5.
  • D 4476

    D4476 inhibits IGF-1 and serum-stimulated nuclear exclusion of FOXO1a in living cells. EMBO Rep. 2004 Jan;5(1):60-5.
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