规格 | 价格 | 库存 | 数量 |
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5mg |
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10mg |
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25mg |
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50mg |
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100mg |
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250mg |
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500mg |
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Other Sizes |
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靶点 |
S1P3 ( EC50: between 72 and 132 nM )
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体外研究 (In Vitro) |
体外活性:CYM-5541(也称为 ML249)是 S1P3(1-磷酸鞘氨醇)受体的有效、选择性变构激动剂,EC50 范围为 72 至 132 nM。 S1P 是一种溶血磷脂信号分子,通过激活 S1P 的 G 蛋白偶联受体(即 S1P(1) 至 S1P(5))来调节重要的生物功能,包括淋巴细胞运输和血管发育。 CYM-5541 用于识别变构位点,其中 Phe263 因其亲和力和功效而成为关键的看门残基。该配体缺乏极性部分,并且新型变构疏水口袋允许 CYM-5541 在高度相似的 S1P 受体家族中具有 S1P(3) 选择性。激酶测定:p44/42 MAPK 磷酸化的 ELISA:使用 PathScan Phospho-p44/42 MAPK (Thr202/Tyr204) 夹心 ELISA 试剂盒 (Cell Signaling Technology) 测量配体介导的 ERK 磷酸化。表达WT或突变S1P3的细胞血清饥饿4小时。在拮抗剂实验中,细胞在激动剂处理前与 1 uM SPM-242 预孵育 15 分钟,或者将 1 uM SPM-242 与激动剂预混合。然后用增加浓度的S1P或CYM-5541刺激细胞5分钟(确定所有激动剂产生最大的ERK磷酸化),并根据制造商的方案测定p44/42 MAPK的磷酸化。分析激动剂介导的p44/42 MAPK磷酸化的剂量反应曲线并使用Prism (Graphpad软件)测定EC50。 [33P]S1P放射性配体结合测定:将稳定表达WT或突变体S1P3的Jump-In TI CHO-K细胞(5×105)进行血清饥饿4小时。然后将它们在含有 20 mM Tris-HCl (pH 7.5)、100 mM NaCl、15 mM NaF、0.5 mM EDTA、1 mM Na3VO4、0.5% 无脂肪酸牛血清的结合缓冲液中于 4 °C 孵育 30 分钟白蛋白和蛋白酶抑制剂混合物 (Roche),含 0.1 nM [33P]S1P,并增加浓度的 S1P、SPM-242 或 CYM-5541。用冷结合缓冲液洗涤细胞三次。通过用 0.5% SDS 裂解细胞,然后进行液体闪烁计数来测量细胞结合的放射性。将原始数据标准化,以便在不存在竞争性配体的情况下与每个细胞系(WT或突变体)结合的[33P]S1P水平被参考为其自身细胞系的100%。细胞测定:pcDNA3.1中编码N端、三重HA标记的S1P3融合蛋白的质粒购自cDNA.org。 S1P3受体突变体是通过重叠PCR诱变产生的,并且在使用前验证了序列。 Jump-In™ TI™ CHO-K 亲代细胞、Gateway 克隆载体(pDONR 221、pJTI R4 DEST 和 pJTI R4 Int)和酶(BP clonase II 和 LR clonase)购自 Invitrogen Corp. 三重 HA 标记的 WT首先使用 BP 重组反应将突变体 S1P3 克隆到入门克隆中。将它们重新定位到适当的 pJTI R4 DEST 载体中,以产生 pJTI R4 EXP 重新定位表达载体。 Jump-In TI CHO-K 细胞用 pJTI R4 EXP S1P1 和 pJTI R4 Int 载体转染以进行重定位。扩增重靶向细胞后,使用 10 μg/mL 杀稻瘟菌素选择重靶向 Jump-In TI 细胞 4 周。
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酶活实验 |
WT 或表达突变 S1P3 的 Jump-In TI CHO-K 细胞处于血清饥饿状态四小时。随后,将它们在 4 °C 的结合缓冲液中孵育 30 分钟,其中含有 20 mM Tris-HCl (pH 7.5)、100 mM NaCl、15 mM NaF、0.5 mM EDTA、1 mM Na2< /sub>VO4、0.5% 不含脂肪酸的牛血清白蛋白和含有 0.1 nM [33P]S1P 以及浓度不断增加的 S1P、SPM 的蛋白酶抑制剂混合物-242,或CYM-5541。使用冷结合缓冲液洗涤细胞3次。液体闪烁计数是用 0.5% SDS 裂解细胞后用于测量细胞结合放射性的方法。为了将在没有竞争性配体的情况下与每个细胞系(WT 或突变体)结合的 [33P]S1P 水平参考为其自身细胞系的 100%,对原始数据进行标准化[1]。
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细胞实验 |
编码三重 HA 标签的 N 端 S1P3 融合蛋白的 pcDNA3.1 质粒获自 cDNA.org。使用重叠PCR诱变来创建S1P3受体突变体,并在使用前检查序列。 Gateway 克隆载体(pDONR 221、pJTI R4 DEST 和 pJTI R4 Int)、酶(BP clonase II 和 LR clonase)和 Jump-InTM TI™ CHO-K 亲代细胞购自 Invitrogen Corp。 BP 重组反应为首先用于将三重 HA 标记的 WT 和突变体 S1P3 克隆到入门克隆中。为了创建 pJTI R4 EXP 重定向表达载体,将它们重定向到合适的 pJTI R4 DEST 载体中。为了进行重靶向,将 pJTI R4 EXP S1P1 和 pJTI R4 Int 载体转染至 Jump-In TI CHO-K 细胞中。细胞扩增后,使用 10 μg/mL 杀稻瘟菌素选择重新靶向的 Jump-In TI 细胞,持续 4 周。
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动物实验 |
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参考文献 |
分子式 |
C19H28N2O2
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分子量 |
316.45
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精确质量 |
316.215
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元素分析 |
C, 72.12; H, 8.92; N, 8.85; O, 10.11
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CAS号 |
945128-26-7
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相关CAS号 |
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PubChem CID |
17253208
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外观&性状 |
White to off-white solid powder
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密度 |
1.1±0.1 g/cm3
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沸点 |
503.1±38.0 °C at 760 mmHg
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闪点 |
258.1±26.8 °C
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蒸汽压 |
0.0±1.3 mmHg at 25°C
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折射率 |
1.559
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LogP |
3.47
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tPSA |
46.34
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氢键供体(HBD)数目 |
0
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氢键受体(HBA)数目 |
3
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可旋转键数目(RBC) |
4
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重原子数目 |
23
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分子复杂度/Complexity |
394
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定义原子立体中心数目 |
0
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SMILES |
O=C(N(C1CCCCC1)C1CCCCC1)C1C=C(C2CC2)ON=1
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InChi Key |
NDKGACIWVAOUQH-UHFFFAOYSA-N
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InChi Code |
InChI=1S/C19H28N2O2/c22-19(17-13-18(23-20-17)14-11-12-14)21(15-7-3-1-4-8-15)16-9-5-2-6-10-16/h13-16H,1-12H2
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化学名 |
N,N-dicyclohexyl-5-cyclopropyl-1,2-oxazole-3-carboxamide
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别名 |
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HS Tariff Code |
2934.99.9001
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存储方式 |
Powder -20°C 3 years 4°C 2 years In solvent -80°C 6 months -20°C 1 month |
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运输条件 |
Room temperature (This product is stable at ambient temperature for a few days during ordinary shipping and time spent in Customs)
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溶解度 (体外实验) |
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溶解度 (体内实验) |
配方 1 中的溶解度: ≥ 2.5 mg/mL (7.90 mM) (饱和度未知) in 10% DMSO + 40% PEG300 + 5% Tween80 + 45% Saline (这些助溶剂从左到右依次添加,逐一添加), 澄清溶液。
例如,若需制备1 mL的工作液,可将100 μL 25.0 mg/mL澄清DMSO储备液加入到400 μL PEG300中,混匀;然后向上述溶液中加入50 μL Tween-80,混匀;加入450 μL生理盐水定容至1 mL。 *生理盐水的制备:将 0.9 g 氯化钠溶解在 100 mL ddH₂O中,得到澄清溶液。 配方 2 中的溶解度: ≥ 2.5 mg/mL (7.90 mM) (饱和度未知) in 10% DMSO + 90% (20% SBE-β-CD in Saline) (这些助溶剂从左到右依次添加,逐一添加), 澄清溶液。 例如,若需制备1 mL的工作液,可将 100 μL 25.0 mg/mL澄清DMSO储备液加入900 μL 20% SBE-β-CD生理盐水溶液中,混匀。 *20% SBE-β-CD 生理盐水溶液的制备(4°C,1 周):将 2 g SBE-β-CD 溶解于 10 mL 生理盐水中,得到澄清溶液。 View More
配方 3 中的溶解度: ≥ 2.5 mg/mL (7.90 mM) (饱和度未知) in 10% DMSO + 90% Corn Oil (这些助溶剂从左到右依次添加,逐一添加), 澄清溶液。 1、请先配制澄清的储备液(如:用DMSO配置50 或 100 mg/mL母液(储备液)); 2、取适量母液,按从左到右的顺序依次添加助溶剂,澄清后再加入下一助溶剂。以 下列配方为例说明 (注意此配方只用于说明,并不一定代表此产品 的实际溶解配方): 10% DMSO → 40% PEG300 → 5% Tween-80 → 45% ddH2O (或 saline); 假设最终工作液的体积为 1 mL, 浓度为5 mg/mL: 取 100 μL 50 mg/mL 的澄清 DMSO 储备液加到 400 μL PEG300 中,混合均匀/澄清;向上述体系中加入50 μL Tween-80,混合均匀/澄清;然后继续加入450 μL ddH2O (或 saline)定容至 1 mL; 3、溶剂前显示的百分比是指该溶剂在最终溶液/工作液中的体积所占比例; 4、 如产品在配制过程中出现沉淀/析出,可通过加热(≤50℃)或超声的方式助溶; 5、为保证最佳实验结果,工作液请现配现用! 6、如不确定怎么将母液配置成体内动物实验的工作液,请查看说明书或联系我们; 7、 以上所有助溶剂都可在 Invivochem.cn网站购买。 |
制备储备液 | 1 mg | 5 mg | 10 mg | |
1 mM | 3.1601 mL | 15.8003 mL | 31.6006 mL | |
5 mM | 0.6320 mL | 3.1601 mL | 6.3201 mL | |
10 mM | 0.3160 mL | 1.5800 mL | 3.1601 mL |
1、根据实验需要选择合适的溶剂配制储备液 (母液):对于大多数产品,InvivoChem推荐用DMSO配置母液 (比如:5、10、20mM或者10、20、50 mg/mL浓度),个别水溶性高的产品可直接溶于水。产品在DMSO 、水或其他溶剂中的具体溶解度详见上”溶解度 (体外)”部分;
2、如果您找不到您想要的溶解度信息,或者很难将产品溶解在溶液中,请联系我们;
3、建议使用下列计算器进行相关计算(摩尔浓度计算器、稀释计算器、分子量计算器、重组计算器等);
4、母液配好之后,将其分装到常规用量,并储存在-20°C或-80°C,尽量减少反复冻融循环。
计算结果:
工作液浓度: mg/mL;
DMSO母液配制方法: mg 药物溶于 μL DMSO溶液(母液浓度 mg/mL)。如该浓度超过该批次药物DMSO溶解度,请首先与我们联系。
体内配方配制方法:取 μL DMSO母液,加入 μL PEG300,混匀澄清后加入μL Tween 80,混匀澄清后加入 μL ddH2O,混匀澄清。
(1) 请确保溶液澄清之后,再加入下一种溶剂 (助溶剂) 。可利用涡旋、超声或水浴加热等方法助溶;
(2) 一定要按顺序加入溶剂 (助溶剂) 。
Ligand-induced ERK phosphorylation in WT S1P3Jump-In stable cell lines (Mean ± SEM; n=3), revealing CYM-5541 is a full agonist of S1P3 th> |
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Radioligand binding and competition. td> |
Receptor mutagenesis and ligand-induced ERK phosphorylation. td> |
SPM-242, an S1P3-selective antagonist, is a bitopic antagonist. th> |
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Visualization of the receptor binding pocket by homology modeling and docking. Three dimensional plot of S1P3binding to (A) S1P, (B) CYM-5541, and (C and D) both td> |
Visualization of the orthosteric, allosteric, and bitopic ligand interactions based upon the biochemistry, mutagenesis, homology modeling, and molecular dynamic simulations.CYM-5541 (green) and SPM-242 (cyan) overlap in the S1P3binding pocket. td> |