CYM-5541 (ML249)

别名: ML249; ML 249; ML-249; CYM-5541; CYM 5541; CYM5541 N,N-Dicyclohexyl-5-cyclopropyl-1,2-oxazole-3-carboxamide
目录号: V3237 纯度: ≥98%
CYM-5541(也称为 ML249)是 S1P3(1-磷酸鞘氨醇)受体的有效、选择性、完全变构激动剂,EC50 范围为 72 至 132 nM。
CYM-5541 (ML249) CAS号: 945128-26-7
产品类别: LPL Receptor
产品仅用于科学研究,不针对患者销售
规格 价格 库存 数量
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纯度/质量控制文件

纯度: ≥98%

产品描述
CYM-5541(也称为 ML249)是 S1P3(1-磷酸鞘氨醇)受体的有效、选择性、完全变构激动剂,EC50 范围为 72 至 132 nM。 S1P 是一种溶血磷脂信号分子,通过激活 S1P 的 G 蛋白偶联受体(即 S1P(1) 至 S1P(5))来调节重要的生物功能,包括淋巴细胞运输和血管发育。 CYM-5541 用于识别变构位点,其中 Phe263 因其亲和力和功效而成为关键的看门残基。该配体缺乏极性部分,并且新型变构疏水口袋允许 CYM-5541 在高度相似的 S1P 受体家族中具有 S1P(3) 选择性。
生物活性&实验参考方法
靶点
S1P3 ( EC50: between 72 and 132 nM )
体外研究 (In Vitro)
体外活性:CYM-5541(也称为 ML249)是 S1P3(1-磷酸鞘氨醇)受体的有效、选择性变构激动剂,EC50 范围为 72 至 132 nM。 S1P 是一种溶血磷脂信号分子,通过激活 S1P 的 G 蛋白偶联受体(即 S1P(1) 至 S1P(5))来调节重要的生物功能,包括淋巴细胞运输和血管发育。 CYM-5541 用于识别变构位点,其中 Phe263 因其亲和力和功效而成为关键的看门残基。该配体缺乏极性部分,并且新型变构疏水口袋允许 CYM-5541 在高度相似的 S1P 受体家族中具有 S1P(3) 选择性。激酶测定:p44/42 MAPK 磷酸化的 ELISA:使用 PathScan Phospho-p44/42 MAPK (Thr202/Tyr204) 夹心 ELISA 试剂盒 (Cell Signaling Technology) 测量配体介导的 ERK 磷酸化。表达WT或突变S1P3的细胞血清饥饿4小时。在拮抗剂实验中,细胞在激动剂处理前与 1 uM SPM-242 预孵育 15 分钟,或者将 1 uM SPM-242 与激动剂预混合。然后用增加浓度的S1P或CYM-5541刺激细胞5分钟(确定所有激动剂产生最大的ERK磷酸化),并根据制造商的方案测定p44/42 MAPK的磷酸化。分析激动剂介导的p44/42 MAPK磷酸化的剂量反应曲线并使用Prism (Graphpad软件)测定EC50。 [33P]S1P放射性配体结合测定:将稳定表达WT或突变体S1P3的Jump-In TI CHO-K细胞(5×105)进行血清饥饿4小时。然后将它们在含有 20 mM Tris-HCl (pH 7.5)、100 mM NaCl、15 mM NaF、0.5 mM EDTA、1 mM Na3VO4、0.5% 无脂肪酸牛血清的结合缓冲液中于 4 °C 孵育 30 分钟白蛋白和蛋白酶抑制剂混合物 (Roche),含 0.1 nM [33P]S1P,并增加浓度的 S1P、SPM-242 或 CYM-5541。用冷结合缓冲液洗涤细胞三次。通过用 0.5% SDS 裂解细胞,然后进行液体闪烁计数来测量细胞结合的放射性。将原始数据标准化,以便在不存在竞争性配体的情况下与每个细胞系(WT或突变体)结合的[33P]S1P水平被参考为其自身细胞系的100%。细胞测定:pcDNA3.1中编码N端、三重HA标记的S1P3融合蛋白的质粒购自cDNA.org。 S1P3受体突变体是通过重叠PCR诱变产生的,并且在使用前验证了序列。 Jump-In™ TI™ CHO-K 亲代细胞、Gateway 克隆载体(pDONR 221、pJTI R4 DEST 和 pJTI R4 Int)和酶(BP clonase II 和 LR clonase)购自 Invitrogen Corp. 三重 HA 标记的 WT首先使用 BP 重组反应将突变体 S1P3 克隆到入门克隆中。将它们重新定位到适当的 pJTI R4 DEST 载体中,以产生 pJTI R4 EXP 重新定位表达载体。 Jump-In TI CHO-K 细胞用 pJTI R4 EXP S1P1 和 pJTI R4 Int 载体转染以进行重定位。扩增重靶向细胞后,使用 10 μg/mL 杀稻瘟菌素选择重靶向 Jump-In TI 细胞 4 周。
酶活实验
WT 或表达突变 S1P3 的 Jump-In TI CHO-K 细胞处于血清饥饿状态四小时。随后,将它们在 4 °C 的结合缓冲液中孵育 30 分钟,其中含有 20 mM Tris-HCl (pH 7.5)、100 mM NaCl、15 mM NaF、0.5 mM EDTA、1 mM Na2< /sub>VO4、0.5% 不含脂肪酸的牛血清白蛋白和含有 0.1 nM [33P]S1P 以及浓度不断增加的 S1P、SPM 的蛋白酶抑制剂混合物-242,或CYM-5541。使用冷结合缓冲液洗涤细胞3次。液体闪烁计数是用 0.5% SDS 裂解细胞后用于测量细胞结合放射性的方法。为了将在没有竞争性配体的情况下与每个细胞系(WT 或突变体)结合的 [33P]S1P 水平参考为其自身细胞系的 100%,对原始数据进行标准化[1]。
细胞实验
编码三重 HA 标签的 N 端 S1P3 融合蛋白的 pcDNA3.1 质粒获自 cDNA.org。使用重叠PCR诱变来创建S1P3受体突变体,并在使用前检查序列。 Gateway 克隆载体(pDONR 221、pJTI R4 DEST 和 pJTI R4 Int)、酶(BP clonase II 和 LR clonase)和 Jump-InTM TI™ CHO-K 亲代细胞购自 Invitrogen Corp。 BP 重组反应为首先用于将三重 HA 标记的 WT 和突变体 S1P3 克隆到入门克隆中。为了创建 pJTI R4 EXP 重定向表达载体,将它们重定向到合适的 pJTI R4 DEST 载体中。为了进行重靶向,将 pJTI R4 EXP S1P1 和 pJTI R4 Int 载体转染至 Jump-In TI CHO-K 细胞中。细胞扩增后,使用 10 μg/mL 杀稻瘟菌素选择重新靶向的 Jump-In TI 细胞,持续 4 周。
动物实验


参考文献

[1]. Novel selective allosteric and bitopic ligands for the S1P(3) receptor. ACS Chem Biol. 2012 Dec 21;7(12):1975-83.

*注: 文献方法仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些方法的准确性
化学信息 & 存储运输条件
分子式
C19H28N2O2
分子量
316.45
精确质量
316.215
元素分析
C, 72.12; H, 8.92; N, 8.85; O, 10.11
CAS号
945128-26-7
相关CAS号
945128-26-7
PubChem CID
17253208
外观&性状
White to off-white solid powder
密度
1.1±0.1 g/cm3
沸点
503.1±38.0 °C at 760 mmHg
闪点
258.1±26.8 °C
蒸汽压
0.0±1.3 mmHg at 25°C
折射率
1.559
LogP
3.47
tPSA
46.34
氢键供体(HBD)数目
0
氢键受体(HBA)数目
3
可旋转键数目(RBC)
4
重原子数目
23
分子复杂度/Complexity
394
定义原子立体中心数目
0
SMILES
O=C(N(C1CCCCC1)C1CCCCC1)C1C=C(C2CC2)ON=1
InChi Key
NDKGACIWVAOUQH-UHFFFAOYSA-N
InChi Code
InChI=1S/C19H28N2O2/c22-19(17-13-18(23-20-17)14-11-12-14)21(15-7-3-1-4-8-15)16-9-5-2-6-10-16/h13-16H,1-12H2
化学名
N,N-dicyclohexyl-5-cyclopropyl-1,2-oxazole-3-carboxamide
别名
ML249; ML 249; ML-249; CYM-5541; CYM 5541; CYM5541
HS Tariff Code
2934.99.9001
存储方式

Powder      -20°C    3 years

                     4°C     2 years

In solvent   -80°C    6 months

                  -20°C    1 month

运输条件
Room temperature (This product is stable at ambient temperature for a few days during ordinary shipping and time spent in Customs)
溶解度数据
溶解度 (体外实验)
DMSO: 25~32 mg/mL (79.0~101.1 mM)
Water: N/A
Ethanol: ~63 mg/mL
溶解度 (体内实验)
配方 1 中的溶解度: ≥ 2.5 mg/mL (7.90 mM) (饱和度未知) in 10% DMSO + 40% PEG300 + 5% Tween80 + 45% Saline (这些助溶剂从左到右依次添加,逐一添加), 澄清溶液。
例如,若需制备1 mL的工作液,可将100 μL 25.0 mg/mL澄清DMSO储备液加入到400 μL PEG300中,混匀;然后向上述溶液中加入50 μL Tween-80,混匀;加入450 μL生理盐水定容至1 mL。
*生理盐水的制备:将 0.9 g 氯化钠溶解在 100 mL ddH₂O中,得到澄清溶液。

配方 2 中的溶解度: ≥ 2.5 mg/mL (7.90 mM) (饱和度未知) in 10% DMSO + 90% (20% SBE-β-CD in Saline) (这些助溶剂从左到右依次添加,逐一添加), 澄清溶液。
例如,若需制备1 mL的工作液,可将 100 μL 25.0 mg/mL澄清DMSO储备液加入900 μL 20% SBE-β-CD生理盐水溶液中,混匀。
*20% SBE-β-CD 生理盐水溶液的制备(4°C,1 周):将 2 g SBE-β-CD 溶解于 10 mL 生理盐水中,得到澄清溶液。

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配方 3 中的溶解度: ≥ 2.5 mg/mL (7.90 mM) (饱和度未知) in 10% DMSO + 90% Corn Oil (这些助溶剂从左到右依次添加,逐一添加), 澄清溶液。
例如,若需制备1 mL的工作液,可将 100 μL 25.0 mg/mL 澄清 DMSO 储备液加入到 900 μL 玉米油中并混合均匀。


请根据您的实验动物和给药方式选择适当的溶解配方/方案:
1、请先配制澄清的储备液(如:用DMSO配置50 或 100 mg/mL母液(储备液));
2、取适量母液,按从左到右的顺序依次添加助溶剂,澄清后再加入下一助溶剂。以 下列配方为例说明 (注意此配方只用于说明,并不一定代表此产品 的实际溶解配方):
10% DMSO → 40% PEG300 → 5% Tween-80 → 45% ddH2O (或 saline);
假设最终工作液的体积为 1 mL, 浓度为5 mg/mL: 取 100 μL 50 mg/mL 的澄清 DMSO 储备液加到 400 μL PEG300 中,混合均匀/澄清;向上述体系中加入50 μL Tween-80,混合均匀/澄清;然后继续加入450 μL ddH2O (或 saline)定容至 1 mL;

3、溶剂前显示的百分比是指该溶剂在最终溶液/工作液中的体积所占比例;
4、 如产品在配制过程中出现沉淀/析出,可通过加热(≤50℃)或超声的方式助溶;
5、为保证最佳实验结果,工作液请现配现用!
6、如不确定怎么将母液配置成体内动物实验的工作液,请查看说明书或联系我们;
7、 以上所有助溶剂都可在 Invivochem.cn网站购买。
制备储备液 1 mg 5 mg 10 mg
1 mM 3.1601 mL 15.8003 mL 31.6006 mL
5 mM 0.6320 mL 3.1601 mL 6.3201 mL
10 mM 0.3160 mL 1.5800 mL 3.1601 mL

1、根据实验需要选择合适的溶剂配制储备液 (母液):对于大多数产品,InvivoChem推荐用DMSO配置母液 (比如:5、10、20mM或者10、20、50 mg/mL浓度),个别水溶性高的产品可直接溶于水。产品在DMSO 、水或其他溶剂中的具体溶解度详见上”溶解度 (体外)”部分;

2、如果您找不到您想要的溶解度信息,或者很难将产品溶解在溶液中,请联系我们;

3、建议使用下列计算器进行相关计算(摩尔浓度计算器、稀释计算器、分子量计算器、重组计算器等);

4、母液配好之后,将其分装到常规用量,并储存在-20°C或-80°C,尽量减少反复冻融循环。

计算器

摩尔浓度计算器可计算特定溶液所需的质量、体积/浓度,具体如下:

  • 计算制备已知体积和浓度的溶液所需的化合物的质量
  • 计算将已知质量的化合物溶解到所需浓度所需的溶液体积
  • 计算特定体积中已知质量的化合物产生的溶液的浓度
使用摩尔浓度计算器计算摩尔浓度的示例如下所示:
假如化合物的分子量为350.26 g/mol,在5mL DMSO中制备10mM储备液所需的化合物的质量是多少?
  • 在分子量(MW)框中输入350.26
  • 在“浓度”框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在“体积”框中输入5,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案17.513 mg出现在“质量”框中。以类似的方式,您可以计算体积和浓度。

稀释计算器可计算如何稀释已知浓度的储备液。例如,可以输入C1、C2和V2来计算V1,具体如下:

制备25毫升25μM溶液需要多少体积的10 mM储备溶液?
使用方程式C1V1=C2V2,其中C1=10mM,C2=25μM,V2=25 ml,V1未知:
  • 在C1框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在C2框中输入25,然后选择正确的单位(μM)
  • 在V2框中输入25,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案62.5μL(0.1 ml)出现在V1框中
g/mol

分子量计算器可计算化合物的分子量 (摩尔质量)和元素组成,具体如下:

注:化学分子式大小写敏感:C12H18N3O4  c12h18n3o4
计算化合物摩尔质量(分子量)的说明:
  • 要计算化合物的分子量 (摩尔质量),请输入化学/分子式,然后单击“计算”按钮。
分子质量、分子量、摩尔质量和摩尔量的定义:
  • 分子质量(或分子量)是一种物质的一个分子的质量,用统一的原子质量单位(u)表示。(1u等于碳-12中一个原子质量的1/12)
  • 摩尔质量(摩尔重量)是一摩尔物质的质量,以g/mol表示。
/

配液计算器可计算将特定质量的产品配成特定浓度所需的溶剂体积 (配液体积)

  • 输入试剂的质量、所需的配液浓度以及正确的单位
  • 单击“计算”按钮
  • 答案显示在体积框中
动物体内实验配方计算器(澄清溶液)
第一步:请输入基本实验信息(考虑到实验过程中的损耗,建议多配一只动物的药量)
第二步:请输入动物体内配方组成(配方适用于不溶/难溶于水的化合物),不同的产品和批次配方组成不同,如对配方有疑问,可先联系我们提供正确的体内实验配方。此外,请注意这只是一个配方计算器,而不是特定产品的确切配方。
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计算结果:

工作液浓度 mg/mL;

DMSO母液配制方法 mg 药物溶于 μL DMSO溶液(母液浓度 mg/mL)。如该浓度超过该批次药物DMSO溶解度,请首先与我们联系。

体内配方配制方法μL DMSO母液,加入 μL PEG300,混匀澄清后加入μL Tween 80,混匀澄清后加入 μL ddH2O,混匀澄清。

(1) 请确保溶液澄清之后,再加入下一种溶剂 (助溶剂) 。可利用涡旋、超声或水浴加热等方法助溶;
            (2) 一定要按顺序加入溶剂 (助溶剂) 。

生物数据图片
  • CYM-5541 (ML249)

    Ligand-induced ERK phosphorylation in WT S1P3Jump-In stable cell lines (Mean ± SEM; n=3), revealing CYM-5541 is a full agonist of S1P3

  • CYM-5541 (ML249)

    Radioligand binding and competition.

  • CYM-5541 (ML249)

    Receptor mutagenesis and ligand-induced ERK phosphorylation.

  • CYM-5541 (ML249)

    SPM-242, an S1P3-selective antagonist, is a bitopic antagonist.

  • CYM-5541 (ML249)

    Visualization of the receptor binding pocket by homology modeling and docking. Three dimensional plot of S1P3binding to (A) S1P, (B) CYM-5541, and (C and D) both

  • CYM-5541 (ML249)

    Visualization of the orthosteric, allosteric, and bitopic ligand interactions based upon the biochemistry, mutagenesis, homology modeling, and molecular dynamic simulations.CYM-5541 (green) and SPM-242 (cyan) overlap in the S1P3binding pocket.

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