Cl-amidine HCl

别名: Cl amidine hydrochlorideCl amidine HClCl-amidine HCl Cl-amidine hydrochloride N-[(1S)-1-(Aminocarbonyl)-4-[(2-chloro-1-iminoethyl)amino]butyl]-benzamide hydrochloride；盐酸氯脒；肽酰精氨酸去酶（PAD）抑制剂，PAD4的IC50为5.9μM；治疗自身免疫性疾病

目录号: V9901 纯度: ≥98%

COA 产品数据产品说明书 SDS

Cl-amidine HCl 是一种口服生物活性 PAD 抑制剂（拮抗剂），对 PAD1、PAD3 和 PAD4 的 IC50 值分别为 0.8 μM、6.2 μM 和 5.9 μM。

Cl-amidine HCl CAS号: 1373232-26-8
产品类别: New1

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Nature 2024 Dec 18.

Nature 2021, 597(7874):119-125.

Cell 2020,183:1202-1218.e25.

Science Adv 2022: 8, eabm9427.

Nat Neurosci 2024, 27:1468-1474.

Nat Metab 2024, 6: 1108-1127.

Cell Stem Cell 2024, 31:106-126.e13.

Nature 597, 119–125 (2021)

Cell Stem Cell 2020,26(6):845-861.e12.

Science Trans Med 2023,15(701):eadd7872.

STTT 2023,8(1):91.

Cell Reports 2023,42(4):112313

Science Trans Med 2023, 15: eadd7872.

Cancer Cell 2021,39(4):529-547.e7.

Cancer Discov 2022,12(4):1106-1127.

Immunity 2023,56(3):620-634.e11.

Immunity 2024,57:2651-2668.e12.

J Am Chem Soc 2022,144:21831-21836.

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Science Adv 2022:8,eabm9427.

Nature 2021,597(7874):119-125.

Cell 2020,183:1202-1218.e25.

PNAS Nexus 2022,1(3):pgac063.

ACS Nano 2023,17(10):9110-9125.

Biomaterial 2023 Sep16:302:122333.

产品描述
生物活性&实验参考方法
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计算器
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产品描述

Cl-amidine HCl 是一种口服生物活性 PAD 抑制剂（拮抗剂），对 PAD1、PAD3 和 PAD4 的 IC50 值分别为 0.8 μM、6.2 μM 和 5.9 μM。 Cl-amidine HCl 导致癌症/肿瘤细胞凋亡。 Cl-amidine HCl 可诱导 miR-16 (miRNA-16, microRNA-16)，引起细胞周期停滞。 Cl-Amidine HCl 可阻断组蛋白 3 瓜氨酸化和中性粒细胞胞外陷阱形成，并提高脓毒症小鼠的存活率。

生物活性&实验参考方法

体外研究 (In Vitro)	Cl-amidine HCl 是一种基于卤代乙脒的生物可利用药物，可有效抑制所有活性 PAD 同工酶（PAD4 的 kinact/KI=13,000 M-1 min-1）[1 Cl-amidine 盐酸盐 (0, 5, 10, 15, 20, 25、50 μg/mL、24 小时）诱导 HT29 和 TK6 类淋巴母细胞。它在圆形细胞模具上显示剂量图。与Cl-脒盐酸盐产生的细胞相比，导管脒系列(HT29)相对耐药[2]。在动物模型中，盐酸可乐定改善和抑制中性粒细胞胞外托盘的形成和组蛋白 3 酸化 [4]。
体内研究 (In Vivo)	Cl-amidine（75 mg/kg，腹腔注射，每日一次）可预防和治疗小鼠 DSS 诱导的膀胱炎[2]。可乐定（5、25、75 mg/kg，每天一次，通过侧壁灌胃）的反应，组织学评分显着下降，呈剂量依赖性[2]。
细胞实验	细胞凋亡分析[2]。细胞类型：TK6类淋巴母细胞和HT29结肠癌细胞。测试浓度：0、5、10、15、20、25、50 μg/mL。孵化持续时间：24 小时。实验结果：细胞凋亡的诱导呈剂量依赖性。
动物实验	Animal/Disease Models: C57BL/6 mice (8-12 weeks old, DSS colitis mouse model) [2]. Doses: 75 mg/kg. Management: IP one time/day. Experimental Results: Inhibition of PAD activity in vivo, protein citrullination, and PAD levels in the colon. Animal/Disease Models: C57BL/6 mice (8-12 weeks old, DSS colitis mouse model) [2]. Doses: 5, 25, 75 mg/kg. Route of Administration: po (oral gavage), one time/day. Experimental Results: Resultant in Dramatically lower histological scores.
参考文献	[1]. Inhibitors and Inactivators of Protein Arginine Deiminase 4: Functional and Structural Characterization. Biochemistry. 2006 Oct 3; 45(39): 11727–11736. [2]. Suppression of colitis in mice by Cl-amidine: a novel peptidylarginine deiminase inhibitor. Am J Physiol Gastrointest Liver Physiol. 2011 Jun;300(6):G929-38. [3]. Molecular targeting of protein arginine deiminases to suppress colitis and prevent colon cancer. Oncotarget. 2015 Nov 3;6(34):36053-62. [4]. Cl-Amidine Prevents Histone 3 Citrullination and Neutrophil Extracellular Trap Formation, and Improves Survival in a Murine Sepsis Model. J Innate Immun. 2017;9(1):22-32.

*注: 文献方法仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些方法的准确性

化学信息 & 存储运输条件

分子式	C14H20CL2N4O2
分子量	347.24
精确质量	346.096
CAS号	1373232-26-8
相关CAS号	D-Cl-amidine hydrochloride;Cl-amidine;913723-61-2;Cl-amidine TFA;1043444-18-3;D-Cl-amidine;1404060-15-6
PubChem CID	74889978
外观&性状	White to light yellow solid powder
tPSA	111
氢键供体(HBD)数目	4
氢键受体(HBA)数目	3
可旋转键数目(RBC)	8
重原子数目	22
分子复杂度/Complexity	381
定义原子立体中心数目	1
SMILES	C1=CC=C(C=C1)C(=O)N[C@@H](CCCN=C(CCl)N)C(=O)N.Cl
InChi Key	OPFMEGSAOZAJIV-MERQFXBCSA-N
InChi Code	InChI=1S/C14H19ClN4O2.ClH/c15-9-12(16)18-8-4-7-11(13(17)20)19-14(21)10-5-2-1-3-6-10;/h1-3,5-6,11H,4,7-9H2,(H2,16,18)(H2,17,20)(H,19,21);1H/t11-;/m0./s1
化学名	N-[(1S)-1-(Aminocarbonyl)-4-[(2-chloro-1-iminoethyl)amino]butyl]-benzamide Hydrochloride
别名	Cl amidine hydrochlorideCl amidine HClCl-amidine HCl Cl-amidine hydrochloride
HS Tariff Code	2934.99.9001
存储方式	Powder -20°C 3 years 4°C 2 years In solvent -80°C 6 months -20°C 1 month 注意：请将本产品存放在密封且受保护的环境中（例如氮气保护），避免吸湿/受潮。
运输条件	Room temperature (This product is stable at ambient temperature for a few days during ordinary shipping and time spent in Customs)

溶解度数据

溶解度 (体外实验)	DMSO : ~50 mg/mL (~143.99 mM) H2O : ~50 mg/mL (~143.99 mM)
溶解度 (体内实验)	配方 1 中的溶解度: ≥ 1.25 mg/mL (3.60 mM) (饱和度未知) in 10% DMSO + 40% PEG300 + 5% Tween80 + 45% Saline (这些助溶剂从左到右依次添加，逐一添加), 澄清溶液。例如，若需制备1 mL的工作液，可将100 μL 12.5 mg/mL澄清的DMSO储备液加入到400 μL PEG300中，混匀；再向上述溶液中加入50 μL Tween-80，混匀；然后加入450 μL生理盐水定容至1 mL。生理盐水的制备：将 0.9 g 氯化钠溶解在 100 mL ddH₂O中，得到澄清溶液。配方 2 中的溶解度:* ≥ 1.25 mg/mL (3.60 mM) (饱和度未知) in 10% DMSO + 90% (20% SBE-β-CD in Saline) (这些助溶剂从左到右依次添加，逐一添加), 澄清溶液。例如，若需制备1 mL的工作液，可将 100 μL 12.5 mg/mL澄清DMSO储备液加入900 μL 20% SBE-β-CD生理盐水溶液中，混匀。 20% SBE-β-CD 生理盐水溶液的制备（4°C，1 周）：将 2 g SBE-β-CD 溶解于 10 mL 生理盐水中，得到澄清溶液。 View More* 配方 3 中的溶解度: ≥ 1.25 mg/mL (3.60 mM) (饱和度未知) in 10% DMSO + 90% Corn Oil (这些助溶剂从左到右依次添加，逐一添加), 澄清溶液。例如，若需制备1 mL的工作液，可将 100 μL 12.5 mg/mL 澄清 DMSO 储备液加入到 900 μL 玉米油中并混合均匀。配方 4 中的溶解度: 5.5 mg/mL (15.84 mM) in PBS (这些助溶剂从左到右依次添加，逐一添加), 澄清溶液; 超声助溶. 请根据您的实验动物和给药方式选择适当的溶解配方/方案： 1、请先配制澄清的储备液(如：用DMSO配置50 或 100 mg/mL母液(储备液)); 2、取适量母液，按从左到右的顺序依次添加助溶剂，澄清后再加入下一助溶剂。以下列配方为例说明 (注意此配方只用于说明，并不一定代表此产品的实际溶解配方): 10% DMSO → 40% PEG300 → 5% Tween-80 → 45% ddH2O (或 saline); 假设最终工作液的体积为 1 mL, 浓度为5 mg/mL: 取 100 μL 50 mg/mL 的澄清 DMSO 储备液加到 400 μL PEG300 中，混合均匀/澄清；向上述体系中加入50 μL Tween-80，混合均匀/澄清；然后继续加入450 μL ddH2O (或 saline)定容至 1 mL； 3、溶剂前显示的百分比是指该溶剂在最终溶液/工作液中的体积所占比例; 4、如产品在配制过程中出现沉淀/析出，可通过加热(≤50℃)或超声的方式助溶; 5、为保证最佳实验结果，工作液请现配现用！ 6、如不确定怎么将母液配置成体内动物实验的工作液，请查看说明书或联系我们; 7、以上所有助溶剂都可在 Invivochem.cn网站购买。

溶解度 (体外实验)

DMSO : ~50 mg/mL (~143.99 mM)
H2O : ~50 mg/mL (~143.99 mM)

溶解度 (体内实验)

配方 1 中的溶解度: ≥ 1.25 mg/mL (3.60 mM) (饱和度未知) in 10% DMSO + 40% PEG300 + 5% Tween80 + 45% Saline (这些助溶剂从左到右依次添加，逐一添加), 澄清溶液。
例如，若需制备1 mL的工作液，可将100 μL 12.5 mg/mL澄清的DMSO储备液加入到400 μL PEG300中，混匀；再向上述溶液中加入50 μL Tween-80，混匀；然后加入450 μL生理盐水定容至1 mL。
*生理盐水的制备：将 0.9 g 氯化钠溶解在 100 mL ddH₂O中，得到澄清溶液。

配方 2 中的溶解度: ≥ 1.25 mg/mL (3.60 mM) (饱和度未知) in 10% DMSO + 90% (20% SBE-β-CD in Saline) (这些助溶剂从左到右依次添加，逐一添加), 澄清溶液。
例如，若需制备1 mL的工作液，可将 100 μL 12.5 mg/mL澄清DMSO储备液加入900 μL 20% SBE-β-CD生理盐水溶液中，混匀。
*20% SBE-β-CD 生理盐水溶液的制备（4°C，1 周）：将 2 g SBE-β-CD 溶解于 10 mL 生理盐水中，得到澄清溶液。

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配方 3 中的溶解度: ≥ 1.25 mg/mL (3.60 mM) (饱和度未知) in 10% DMSO + 90% Corn Oil (这些助溶剂从左到右依次添加，逐一添加), 澄清溶液。
例如，若需制备1 mL的工作液，可将 100 μL 12.5 mg/mL 澄清 DMSO 储备液加入到 900 μL 玉米油中并混合均匀。

配方 4 中的溶解度: 5.5 mg/mL (15.84 mM) in PBS (这些助溶剂从左到右依次添加，逐一添加), 澄清溶液; 超声助溶.

请根据您的实验动物和给药方式选择适当的溶解配方/方案：
1、请先配制澄清的储备液(如：用DMSO配置50 或 100 mg/mL母液(储备液));
2、取适量母液，按从左到右的顺序依次添加助溶剂，澄清后再加入下一助溶剂。以下列配方为例说明 (注意此配方只用于说明，并不一定代表此产品的实际溶解配方):
10% DMSO → 40% PEG300 → 5% Tween-80 → 45% ddH2O (或 saline);
假设最终工作液的体积为 1 mL, 浓度为5 mg/mL: 取 100 μL 50 mg/mL 的澄清 DMSO 储备液加到 400 μL PEG300 中，混合均匀/澄清；向上述体系中加入50 μL Tween-80，混合均匀/澄清；然后继续加入450 μL ddH2O (或 saline)定容至 1 mL；
3、溶剂前显示的百分比是指该溶剂在最终溶液/工作液中的体积所占比例;
4、如产品在配制过程中出现沉淀/析出，可通过加热(≤50℃)或超声的方式助溶;
5、为保证最佳实验结果，工作液请现配现用！
6、如不确定怎么将母液配置成体内动物实验的工作液，请查看说明书或联系我们;
7、以上所有助溶剂都可在 Invivochem.cn网站购买。

制备储备液		1 mg	5 mg	10 mg
	1 mM	2.8799 mL	14.3993 mL	28.7985 mL
	5 mM	0.5760 mL	2.8799 mL	5.7597 mL
	10 mM	0.2880 mL	1.4399 mL	2.8799 mL

1、根据实验需要选择合适的溶剂配制储备液 (母液)：对于大多数产品，InvivoChem推荐用DMSO配置母液 (比如：5、10、20mM或者10、20、50 mg/mL浓度），个别水溶性高的产品可直接溶于水。产品在DMSO 、水或其他溶剂中的具体溶解度详见上”溶解度 (体外)”部分;

2、如果您找不到您想要的溶解度信息，或者很难将产品溶解在溶液中，请联系我们;

3、建议使用下列计算器进行相关计算（摩尔浓度计算器、稀释计算器、分子量计算器、重组计算器等）;

4、母液配好之后，将其分装到常规用量，并储存在-20°C或-80°C，尽量减少反复冻融循环。

计算器

质量

浓度

体积

分子量*

计算重置

摩尔浓度计算器可计算特定溶液所需的质量、体积/浓度，具体如下：

计算制备已知体积和浓度的溶液所需的化合物的质量
计算将已知质量的化合物溶解到所需浓度所需的溶液体积
计算特定体积中已知质量的化合物产生的溶液的浓度

参见示例

使用摩尔浓度计算器计算摩尔浓度的示例如下所示：
假如化合物的分子量为350.26 g/mol，在5mL DMSO中制备10mM储备液所需的化合物的质量是多少？

在分子量（MW）框中输入350.26
在“浓度”框中输入10，然后选择正确的单位（mM）
在“体积”框中输入5，然后选择正确的单位（mL）
单击“计算”按钮
答案17.513 mg出现在“质量”框中。以类似的方式，您可以计算体积和浓度。

浓度 (起始)

体积 (起始)

浓度 (终)

体积 (终)

计算重置

稀释计算器可计算如何稀释已知浓度的储备液。例如，可以输入C1、C2和V2来计算V1，具体如下：

制备25毫升25μM溶液需要多少体积的10 mM储备溶液？
使用方程式C1V1=C2V2，其中C1=10mM，C2=25μM，V2=25 ml，V1未知：

在C1框中输入10，然后选择正确的单位（mM）
在C2框中输入25，然后选择正确的单位（μM）
在V2框中输入25，然后选择正确的单位（mL）
单击“计算”按钮
答案62.5μL（0.1 ml）出现在V1框中

分子式

分子量

g/mol

计算重置

分子量计算器可计算化合物的分子量 (摩尔质量)和元素组成，具体如下：

注：化学分子式大小写敏感：C12H18N3O4 c12h18n3o4
计算化合物摩尔质量（分子量）的说明：

要计算化合物的分子量 (摩尔质量)，请输入化学/分子式，然后单击“计算”按钮。

分子质量、分子量、摩尔质量和摩尔量的定义：

分子质量（或分子量）是一种物质的一个分子的质量，用统一的原子质量单位（u）表示。（1u等于碳-12中一个原子质量的1/12）
摩尔质量（摩尔重量）是一摩尔物质的质量，以g/mol表示。

配液体积

质量

配液浓度

计算重置

配液计算器可计算将特定质量的产品配成特定浓度所需的溶剂体积 (配液体积)

输入试剂的质量、所需的配液浓度以及正确的单位
单击“计算”按钮
答案显示在体积框中

动物体内实验配方计算器（澄清溶液）

第一步：请输入基本实验信息（考虑到实验过程中的损耗，建议多配一只动物的药量）

给药剂量 mg/kg

动物平均体重 g

每只动物给药体积 μL

动物数量

第二步：请输入动物体内配方组成（配方适用于不溶/难溶于水的化合物），不同的产品和批次配方组成不同，如对配方有疑问，可先联系我们提供正确的体内实验配方。此外，请注意这只是一个配方计算器，而不是特定产品的确切配方。

% DMSO

% Tween 80

% ddH₂O

计算重置

计算结果:

工作液浓度： mg/mL；

DMSO母液配制方法： mg 药物溶于 μL DMSO溶液（母液浓度 mg/mL)。如该浓度超过该批次药物DMSO溶解度，请首先与我们联系。

体内配方配制方法：取 μL DMSO母液，加入 μL PEG300，混匀澄清后加入μL Tween 80，混匀澄清后加入 μL ddH₂O，混匀澄清。

注意： (1) 请确保溶液澄清之后，再加入下一种溶剂 (助溶剂) 。可利用涡旋、超声或水浴加热等方法助溶；
(2) 一定要按顺序加入溶剂 (助溶剂) 。

生物数据图片

Calcium and substrate dependence of Cl-amidine-induced inactivation. (A) PAD4 was preincubated with increasing concentrations of Cl-amidine in the absence and presence of calcium and then BAEE added to initiate the IC50 assay. Calcium was also added at this time to the sample preincubated in the absence of this metal ion to upregulate the activity of PAD4. (B) Substrate protection was assayed by observing the time-dependent inactivation properties of Cl-amidine (100 μM). For these studies, product formation in the presence and absence of Cl-amidine was quantified as a function of time using two different concentrations of BAEE (2 and 10 mM) as the substrate.[1].Yuan Luo, et al. Inhibitors and Inactivators of Protein Arginine Deiminase 4: Functional and Structural Characterization. Biochemistry. 2006 Oct 3; 45(39): 11727–11736.

Cl-amidine is an irreversible time- and concentration-dependent inactivator of PAD4. (A) Rapid dilution of the preformed PAD4·Cl-amidine complex, and controls containing no inhibitor, into assay buffer containing excess substrate did not show any recovery of activity. (B) Dialysis of preformed PAD4–Cl-amidine complexes for 0, 3.5, and 20 h did not show any recovery of activity. (C) Plots of product formation vs time in the absence and presence of increasing concentrations of Cl-amidine. (D) Plot of kobs vs the concentration of Cl-amidine.[1].Yuan Luo, et al. Inhibitors and Inactivators of Protein Arginine Deiminase 4: Functional and Structural Characterization. Biochemistry. 2006 Oct 3; 45(39): 11727–11736.

Cl-amidine inhibits the PAD4-mediated enhancement of the p300GBD–GRIP1 interaction in CV-1 cells. (A) Schematic depiction of the mammalian two-hybrid assay used to evaluate the efficiency of the p300GBD–GRIP1 interaction. (B) CV-1 cells were transfected with a luciferase reporter construct as well as plasmids encoding the proteins depicted in this panel. The indicated concentrations of Cl-amidine were added to the cell culture medium and the mixtures incubated for 40 h. Cell extracts were then prepared, and the luciferase activity present in these extracts was quantified. The catalytically defective PAD4 C645S mutant was also transfected into this system to demonstrate that the decrease in the strength of the p300GBD–GRIP1 interaction is not a nonspecific effect.[1].Yuan Luo, et al. Inhibitors and Inactivators of Protein Arginine Deiminase 4: Functional and Structural Characterization. Biochemistry. 2006 Oct 3; 45(39): 11727–11736.