CAY10683 (Santacruzamate A)

别名: Santacruzamate A; CAY10683; santacruzamate A; 1477949-42-0; Santacruzamate A (CAY10683); CAY10683 (SantacruzaMate A); ethyl N-[4-oxo-4-(2-phenylethylamino)butyl]carbamate; Ethyl (4-oxo-4-(phenethylamino)butyl)carbamate; CHEMBL3086767; CAY-10683; CAY 10683
目录号: V2867 纯度: ≥98%
Santacruzamate A(也称为 CAY10683)是一种有效的选择性 HDAC(组蛋白脱乙酰酶)抑制剂,对 HDAC2 的 IC50 为 119 pM,其选择性是其他 HDAC 的 3600 倍以上。
CAY10683 (Santacruzamate A) CAS号: 1477949-42-0
产品类别: HDAC
产品仅用于科学研究,不针对患者销售
规格 价格 库存 数量
10 mM * 1 mL in DMSO
1mg
5mg
10mg
25mg
50mg
100mg
250mg
500mg
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纯度/质量控制文件

纯度: ≥98%

产品描述
Santacruzamate A(也称为 CAY10683)是一种有效的选择性 HDAC(组蛋白脱乙酰酶)抑制剂,对 HDAC2 的 IC50 为 119 pM,其选择性是其他 HDAC 的 3600 倍以上。 Santacruzamate A 是从蓝细菌中分离出来的,与辛二酰苯胺异羟肟酸 [SAHA,商品名 Vorinostat] 具有一些共同的结构特征,辛二酰苯胺异羟肟酸是一种临床批准的组蛋白脱乙酰酶 (HDAC) 抑制剂,用于治疗难治性皮肤 T 细胞淋巴瘤。 Santacruzamate A 是 HDAC2(一种 I 类 HDAC)的皮摩尔水平选择性抑制剂,对 HDAC4 或 HDAC6(两种 II 类 HDAC)的抑制相对较小。
生物活性&实验参考方法
靶点
HDAC2 ( IC50 = 119 pM ); HDAC6 ( IC50 = 434 nM )
体外研究 (In Vitro)
体外活性:Santacruzamate A 抑制 HCT116 结肠癌细胞和 HuT-78 皮肤 T 细胞淋巴瘤细胞的生长,GI50 值分别为 29.4 μM 和 1.4 μM。然而,Santacruzamate A 对人真皮成纤维细胞具有低毒性 (GI50 >100 μM)。激酶测定:市售的人类重组酶和荧光 HDAC 测定试剂盒已用于测量三种 HDAC 同工酶(HDAC2、HDAC4、HDAC6)的抑制百分比和 IC50 值。简而言之,将抑制剂依次添加到黑色平底96孔微量滴定板中,并将反应混合物在37°C下孵育30分钟。将有效的 HDAC 抑制剂曲古抑菌素 A(包含在测定试剂盒中)添加到双功能 HDAC 测定显影剂中,最终反应浓度为 1 μM,以停止脱乙酰化并启动荧光团的释放。将反应混合物进一步在室温下孵育15分钟。使用 360 nm 的激发波长和 460 nm 的检测波长在 Spectra Max Gemini XPS 上测量荧光。细胞测定:HuT-78 细胞在补充有 20% FBS、1% 青霉素/链霉素和 1% L-谷氨酰胺的 Iscove 改良 Dulbecco 培养基中孵育。使用补充有 10% FBS、1% 青霉素/链霉素和 1% 非必需氨基酸的 McCoy's 5A 培养基培养 HCT-116 细胞。将细胞以每孔 5000 个细胞接种在 96 孔板中。处理前,将板在 37°C、5% CO2 下孵育 24 小时。使用SAHA作为阳性对照,将抑制剂处理在孔中孵育72或96小时。使用标准 MTS-PMS 测定法测定抗增殖活性。
体内研究 (In Vivo)
为了进一步探索PRMT5和HDAC2在CRC侵袭和转移中的作用,研究人员用inPRMT5与inHDAC2(CAY10683(Santacruzamate A))处理SW620细胞。两种治疗方法都减少了CRC细胞的肝转移,并完全抑制了SW620细胞在裸鼠体内的远处转移(图6E)。总之,我们的数据提供了令人信服的证据,表明ZEB2与TWIST1相互作用,招募PRMT5和NuRD复合物形成一种新的复合物,并在表观遗传学上抑制E-cadherin转录,从而诱导结直肠癌的EMT过程和转移(图7)。[2]
Santacruzamate A(也称为 CAY10683)是一种有效的选择性 HDAC(组蛋白脱乙酰酶)抑制剂,对 HDAC2 的 IC50 为 119 pM,其选择性是其他 HDAC 的 3600 倍以上。 Santacruzamate A 是从蓝细菌中分离出来的,与辛二酰苯胺异羟肟酸 [SAHA,商品名 Vorinostat] 具有一些共同的结构特征,辛二酰苯胺异羟肟酸是一种临床批准的组蛋白脱乙酰酶 (HDAC) 抑制剂,用于治疗难治性皮肤 T 细胞淋巴瘤。 Santacruzamate A 是 HDAC2(一种 I 类 HDAC)的皮摩尔水平选择性抑制剂,对 HDAC4 或 HDAC6(两种 II 类 HDAC)的抑制相对较小。
酶活实验
使用荧光 HDAC 检测试剂盒和市售的人重组酶测量了三种 HDAC 同工酶(HDAC2、HDAC4 和 HDAC6)的抑制百分比和 IC50 值。简而言之,将抑制剂充满黑底平底的96孔微量滴定板,然后将反应混合物在37℃下孵育30分钟。为了启动荧光团的释放并停止脱乙酰化,该检测试剂盒包含曲古抑菌素 A(一种有效的 HDAC 抑制剂),将其添加到双功能 HDAC 检测显影剂中,最终反应浓度为 1 μM。将反应混合物在室温下再孵育 15 分钟。 Spectra Max Gemini XPS 用于测量荧光。其激发波长为360 nm,检测波长为460 nm。
细胞实验
HuT-78 细胞在 Dulbecco 改良的 Iscove 培养基中培养,该培养基用 1% L-谷氨酰胺、1% 青霉素/链霉素和 20% FBS 增强。使用补充有10%FBS、1%青霉素/链霉素和1%非必需氨基酸的McCoy's 5A培养基来培养HCT-116细胞。 96 孔板每孔接种 5000 个细胞。处理前将板在 37°C、5% CO2 下孵育 24 小时。使用 SAHA 作为阳性对照,抑制剂处理在孔中孵育 72 或 96 小时。使用典型的 MTS-PMS 测定来测量抗增殖活性。
动物实验
Liver Metastasis Model[2]
Female BALB/c nude mice (4–5 weeks old) were used in this experiment. Mice were injected into the tail veil with cells (2 × 10~6 cells for shRNA, 8 mice/group). After 35 days, the mice were sacrificed. Liver metastatic nodules were examined macroscopically or detected in paraffin, sectioned, and stained with H&E.
As for the survival assay, mice were injected into the tail veil with cells (2 × 106 cells for shRNA, 10 mice/group).
As for the treating assay, mice were injected with SW620 (2 × 106 cells/mouse) injected into the tail veil (8 mice/group). After one week, CAY10683 (Santacruzamate A) (3 mg/kg) was given intravenously (i.v.) once every three days. GSK3326595 (100 mg/kg, twice daily) was given i.v. once every ten days. After 35 days, the mice were sacrificed. Then, nodules were paraffin-embedded, sectioned, and stained with H&E.
参考文献

[1]. J Nat Prod. 2013 Nov 22;76(11):2026-33.

[2]. Cancers (Basel). 2022 Jul 14;14(14):3426.

其他信息
Santacruzamate A is an organooxygen compound and an organonitrogen compound. It is functionally related to a gamma-amino acid.
santacruzamate A has been reported in Cyanobacterium and Symploca with data available.
*注: 文献方法仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些方法的准确性
化学信息 & 存储运输条件
分子式
C15H22N2O3
分子量
278.35
精确质量
278.163
元素分析
C, 64.73; H, 7.97; N, 10.06; O, 17.24
CAS号
1477949-42-0
相关CAS号
1477949-42-0
PubChem CID
72946782
外观&性状
White to off-white solid powder
密度
1.1±0.1 g/cm3
沸点
508.1±43.0 °C at 760 mmHg
闪点
261.1±28.2 °C
蒸汽压
0.0±1.3 mmHg at 25°C
折射率
1.515
来源
Cyanobacterium; Panamanian Marine Cyanobacterium; Symploca.
LogP
1.85
tPSA
67.43
氢键供体(HBD)数目
2
氢键受体(HBA)数目
3
可旋转键数目(RBC)
9
重原子数目
20
分子复杂度/Complexity
289
定义原子立体中心数目
0
SMILES
O=C(C([H])([H])C([H])([H])C([H])([H])N([H])C(=O)OC([H])([H])C([H])([H])[H])N([H])C([H])([H])C([H])([H])C1C([H])=C([H])C([H])=C([H])C=1[H]
InChi Key
HTOYBIILVCHURC-UHFFFAOYSA-N
InChi Code
InChI=1S/C15H22N2O3/c1-2-20-15(19)17-11-6-9-14(18)16-12-10-13-7-4-3-5-8-13/h3-5,7-8H,2,6,9-12H2,1H3,(H,16,18)(H,17,19)
化学名
ethyl N-[4-oxo-4-(2-phenylethylamino)butyl]carbamate
别名
Santacruzamate A; CAY10683; santacruzamate A; 1477949-42-0; Santacruzamate A (CAY10683); CAY10683 (SantacruzaMate A); ethyl N-[4-oxo-4-(2-phenylethylamino)butyl]carbamate; Ethyl (4-oxo-4-(phenethylamino)butyl)carbamate; CHEMBL3086767; CAY-10683; CAY 10683
HS Tariff Code
2934.99.9001
存储方式

Powder      -20°C    3 years

                     4°C     2 years

In solvent   -80°C    6 months

                  -20°C    1 month

运输条件
Room temperature (This product is stable at ambient temperature for a few days during ordinary shipping and time spent in Customs)
溶解度数据
溶解度 (体外实验)
DMSO: ~55 mg/mL
Water: <1 mg/mL
Ethanol: ~55 mg/mL
溶解度 (体内实验)
配方 1 中的溶解度: ≥ 2.5 mg/mL (8.98 mM) (饱和度未知) in 10% DMSO + 40% PEG300 + 5% Tween80 + 45% Saline (这些助溶剂从左到右依次添加,逐一添加), 澄清溶液。
例如,若需制备1 mL的工作液,可将100 μL 25.0 mg/mL澄清DMSO储备液加入到400 μL PEG300中,混匀;然后向上述溶液中加入50 μL Tween-80,混匀;加入450 μL生理盐水定容至1 mL。
*生理盐水的制备:将 0.9 g 氯化钠溶解在 100 mL ddH₂O中,得到澄清溶液。

配方 2 中的溶解度: ≥ 2.5 mg/mL (8.98 mM) (饱和度未知) in 10% DMSO + 90% (20% SBE-β-CD in Saline) (这些助溶剂从左到右依次添加,逐一添加), 澄清溶液。
例如,若需制备1 mL的工作液,可将 100 μL 25.0 mg/mL澄清DMSO储备液加入900 μL 20% SBE-β-CD生理盐水溶液中,混匀。
*20% SBE-β-CD 生理盐水溶液的制备(4°C,1 周):将 2 g SBE-β-CD 溶解于 10 mL 生理盐水中,得到澄清溶液。

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配方 3 中的溶解度: ≥ 2.5 mg/mL (8.98 mM) (饱和度未知) in 10% DMSO + 90% Corn Oil (这些助溶剂从左到右依次添加,逐一添加), 澄清溶液。
例如,若需制备1 mL的工作液,可将 100 μL 25.0 mg/mL 澄清 DMSO 储备液添加到 900 μL 玉米油中并混合均匀。


配方 4 中的溶解度: 5%DMSO+ 30%PEG300+ 5%Tween 80Click to Order+ 60%ddH2O: 10.0mg/ml (35.93mM)

请根据您的实验动物和给药方式选择适当的溶解配方/方案:
1、请先配制澄清的储备液(如:用DMSO配置50 或 100 mg/mL母液(储备液));
2、取适量母液,按从左到右的顺序依次添加助溶剂,澄清后再加入下一助溶剂。以 下列配方为例说明 (注意此配方只用于说明,并不一定代表此产品 的实际溶解配方):
10% DMSO → 40% PEG300 → 5% Tween-80 → 45% ddH2O (或 saline);
假设最终工作液的体积为 1 mL, 浓度为5 mg/mL: 取 100 μL 50 mg/mL 的澄清 DMSO 储备液加到 400 μL PEG300 中,混合均匀/澄清;向上述体系中加入50 μL Tween-80,混合均匀/澄清;然后继续加入450 μL ddH2O (或 saline)定容至 1 mL;

3、溶剂前显示的百分比是指该溶剂在最终溶液/工作液中的体积所占比例;
4、 如产品在配制过程中出现沉淀/析出,可通过加热(≤50℃)或超声的方式助溶;
5、为保证最佳实验结果,工作液请现配现用!
6、如不确定怎么将母液配置成体内动物实验的工作液,请查看说明书或联系我们;
7、 以上所有助溶剂都可在 Invivochem.cn网站购买。
制备储备液 1 mg 5 mg 10 mg
1 mM 3.5926 mL 17.9630 mL 35.9260 mL
5 mM 0.7185 mL 3.5926 mL 7.1852 mL
10 mM 0.3593 mL 1.7963 mL 3.5926 mL

1、根据实验需要选择合适的溶剂配制储备液 (母液):对于大多数产品,InvivoChem推荐用DMSO配置母液 (比如:5、10、20mM或者10、20、50 mg/mL浓度),个别水溶性高的产品可直接溶于水。产品在DMSO 、水或其他溶剂中的具体溶解度详见上”溶解度 (体外)”部分;

2、如果您找不到您想要的溶解度信息,或者很难将产品溶解在溶液中,请联系我们;

3、建议使用下列计算器进行相关计算(摩尔浓度计算器、稀释计算器、分子量计算器、重组计算器等);

4、母液配好之后,将其分装到常规用量,并储存在-20°C或-80°C,尽量减少反复冻融循环。

计算器

摩尔浓度计算器可计算特定溶液所需的质量、体积/浓度,具体如下:

  • 计算制备已知体积和浓度的溶液所需的化合物的质量
  • 计算将已知质量的化合物溶解到所需浓度所需的溶液体积
  • 计算特定体积中已知质量的化合物产生的溶液的浓度
使用摩尔浓度计算器计算摩尔浓度的示例如下所示:
假如化合物的分子量为350.26 g/mol,在5mL DMSO中制备10mM储备液所需的化合物的质量是多少?
  • 在分子量(MW)框中输入350.26
  • 在“浓度”框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在“体积”框中输入5,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案17.513 mg出现在“质量”框中。以类似的方式,您可以计算体积和浓度。

稀释计算器可计算如何稀释已知浓度的储备液。例如,可以输入C1、C2和V2来计算V1,具体如下:

制备25毫升25μM溶液需要多少体积的10 mM储备溶液?
使用方程式C1V1=C2V2,其中C1=10mM,C2=25μM,V2=25 ml,V1未知:
  • 在C1框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在C2框中输入25,然后选择正确的单位(μM)
  • 在V2框中输入25,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案62.5μL(0.1 ml)出现在V1框中
g/mol

分子量计算器可计算化合物的分子量 (摩尔质量)和元素组成,具体如下:

注:化学分子式大小写敏感:C12H18N3O4  c12h18n3o4
计算化合物摩尔质量(分子量)的说明:
  • 要计算化合物的分子量 (摩尔质量),请输入化学/分子式,然后单击“计算”按钮。
分子质量、分子量、摩尔质量和摩尔量的定义:
  • 分子质量(或分子量)是一种物质的一个分子的质量,用统一的原子质量单位(u)表示。(1u等于碳-12中一个原子质量的1/12)
  • 摩尔质量(摩尔重量)是一摩尔物质的质量,以g/mol表示。
/

配液计算器可计算将特定质量的产品配成特定浓度所需的溶剂体积 (配液体积)

  • 输入试剂的质量、所需的配液浓度以及正确的单位
  • 单击“计算”按钮
  • 答案显示在体积框中
动物体内实验配方计算器(澄清溶液)
第一步:请输入基本实验信息(考虑到实验过程中的损耗,建议多配一只动物的药量)
第二步:请输入动物体内配方组成(配方适用于不溶/难溶于水的化合物),不同的产品和批次配方组成不同,如对配方有疑问,可先联系我们提供正确的体内实验配方。此外,请注意这只是一个配方计算器,而不是特定产品的确切配方。
+
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计算结果:

工作液浓度 mg/mL;

DMSO母液配制方法 mg 药物溶于 μL DMSO溶液(母液浓度 mg/mL)。如该浓度超过该批次药物DMSO溶解度,请首先与我们联系。

体内配方配制方法μL DMSO母液,加入 μL PEG300,混匀澄清后加入μL Tween 80,混匀澄清后加入 μL ddH2O,混匀澄清。

(1) 请确保溶液澄清之后,再加入下一种溶剂 (助溶剂) 。可利用涡旋、超声或水浴加热等方法助溶;
            (2) 一定要按顺序加入溶剂 (助溶剂) 。

生物数据图片
  • CAY10683 (Santacruzamate A)


    Molecular-phylogenetic inference of the SCA-producing strain PAC-19-FEB-10-1 (GenBank acc. nr. JX458089.1, highlighted with an arrow).2013 Nov 22;76(11):2026-33.

  • CAY10683 (Santacruzamate A)


    SAHA (2) binds to HDAC enzymes such that the phenyl cap sits above the enzyme pocket into which the aliphatic chain inserts, positioning the hydroxamic acid adjacent to the enzymatic zinc at the distal end of the pocket.2013 Nov 22;76(11):2026-33.

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