Apcin A

别名: Apcin-A; Apcin A; 1683617-62-0; 3-Aminopropyl (2,2,2-trichloro-1-(pyrimidin-2-ylamino)ethyl)carbamate; starbld0000888; SCHEMBL22567019;
目录号: V2250 纯度: =100%
Apcin-A 是一种 Apcin 类似物,是后期促进复合物 (APC) 的抑制剂(阻断剂/拮抗剂)。
Apcin A CAS号: 1683617-62-0
产品类别: APC
产品仅用于科学研究,不针对患者销售
规格 价格 库存 数量
10 mM * 1 mL in DMSO
1mg
5mg
10mg
25mg
50mg
100mg
250mg
Other Sizes

Other Forms of Apcin A:

  • Apcin A 盐酸盐
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纯度/质量控制文件

纯度: =100%

产品描述
Apcin-A 是一种 Apcin 类似物,是后期促进复合物 (APC) 的抑制剂(阻断剂/拮抗剂)。 Apcin-A 与 Cdc20 强烈相互作用并抑制 Cdc20 底物的泛素化。 Apcin-A 可用于制备 PROTAC CP5V。
生物活性&实验参考方法
靶点
Anaphase-promoting complex (APC)
体外研究 (In Vitro)
CP5V(apcin-A-PEG5-VHL1)和VHL-CP5V-Cdc20复合物的结构是使用蛋白质数据库(PDB)结构作为模板生成的,其中VHL1和apcin-A片段的id分别为5T35和4N14。[1]
Cdc20小分子抑制剂apcin(APC抑制剂)和apcin-A,它们可以竞争性地占据Cdc20的D-box结合口袋,从而抑制Cdc20底物的泛素化,以及拮抗APC/C-Cdc20相互作用的小分子抑制剂TAME和proTAME。[1]
酶活实验
Apcin-A被用作Cdc20的靶向配体,VHL和CRBN结合部分VHL1和沙利度胺分别用于在Cdc20 PROTAC中募集VHL/VBC复合物和Celebron E3连接酶。一系列聚乙二醇(PEG)分子用于连接apcin-A和VHL1/沙利度胺。[1]
CP5V是基于具有中等结合亲和力的apcin-A设计的。先导优化方法可用于开发更有效的Cdc20抑制剂。Apcin和apcin-A具有相似的结合亲和力14,它们不直接与D-box结合位点周围的极性残基相互作用。apcin-P的低结合亲和力表明apcin(和apcin-A)中与Trp209相互作用的嘧啶环的芳香基团对于实现更强的亲和力14很重要。 [1]
我们决定利用 PROTAC 平台开发一种新型嵌合分子,以规避当前 Cdc20 小分子抑制剂所面临的挑战。基于 apcin-A 可以有效结合 Cdc20 且更易于修改的特点,我们使用 apcin-A 而不是 apcin 作为弹头来靶向 Cdc20。关于为 Cdc20 泛素化随后进行蛋白水解而招募的 E3 连接酶,我们考虑了 VHL/VBC (VHL-Elongin BC) 和 CRBN (Celebron),它们都具有可靠的结合部分(分别为 VHL 配体 1 或 VHL1 和沙利度胺),已应用于多种 PROTAC 分子的设计16,17,23。为了寻找最佳化学接头以最大限度地形成稳定的 Cdc20-PROTAC-VHL/VBC 三元复合物,我们设计并测试了一系列不同长度的基于 PEG 的接头,例如 PEG2、PEG3、PEG4、PEG5、PEG6、PEG7 和 PEG9。
参考文献

[1]. A novel strategy to block mitotic progression for targeted therapy. EBioMedicine. 2019 Oct 25. pii: S2352-3964(19)30677-2.

其他信息
Background: Blockade of mitotic progression is an ideal approach to induce mitotic catastrophe that suppresses cancer cell expansion. Cdc20 is a critical mitotic factor governing anaphase initiation and the exit from mitosis through recruiting substrates to APC/C for degradation. Results from recent TCGA (The Cancer Genome Atlas) and pathological studies have demonstrated a pivotal oncogenic role for Cdc20-APC/C in tumor progression as well as drug resistance. Thus, deprivation of the mitotic role for Cdc20-APC/C by either inhibition of Cdc20-APC/C activity or elimination of Cdc20 protein via induced protein degradation emerges as an effective therapeutic strategy to control cancer. Methods: We designed a proteolysis targeting chimera, called CP5V, which comprises a Cdc20 ligand and VHL binding moiety bridged by a PEG5 linker that induces Cdc20 degradation. We characterized the effect of CP5V in destroying Cdc20, arresting mitosis, and inhibiting tumor progression by measuring protein degradation, 3D structure dynamics, cell cycle control, tumor cell killing and tumor inhibition using human breast cancer xenograft mouse model. Findings: Results from our study demonstrate that CP5V can specifically degrade Cdc20 by linking Cdc20 to the VHL/VBC complex for ubiquitination followed by proteasomal degradation. Induced degradation of Cdc20 by CP5V leads to significant inhibition of breast cancer cell proliferation and resensitization of Taxol-resistant cell lines. Results based on a human breast cancer xenograft mouse model show a significant role for CP5V in suppressing breast tumor progression. Interpretation: CP5V-mediated degradation of Cdc20 could be an effective therapeutic strategy for anti-mitotic therapy. [1]
*注: 文献方法仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些方法的准确性
化学信息 & 存储运输条件
分子式
C10H14CL3N5O2
分子量
342.609458446503
精确质量
341.02
元素分析
C, 35.06; H, 4.12; Cl, 31.04; N, 20.44; O, 9.34
CAS号
1683617-62-0
相关CAS号
1683535-53-6 (HCL)
PubChem CID
127243466
外观&性状
Off-white to yellow solid powder
LogP
2.2
tPSA
102
氢键供体(HBD)数目
3
氢键受体(HBA)数目
6
可旋转键数目(RBC)
7
重原子数目
20
分子复杂度/Complexity
297
定义原子立体中心数目
0
InChi Key
JQTSJVDIFMKETH-UHFFFAOYSA-N
InChi Code
InChI=1S/C10H14Cl3N5O2/c11-10(12,13)7(17-8-15-4-2-5-16-8)18-9(19)20-6-1-3-14/h2,4-5,7H,1,3,6,14H2,(H,18,19)(H,15,16,17)
化学名
3-aminopropyl N-[2,2,2-trichloro-1-(pyrimidin-2-ylamino)ethyl]carbamate
别名
Apcin-A; Apcin A; 1683617-62-0; 3-Aminopropyl (2,2,2-trichloro-1-(pyrimidin-2-ylamino)ethyl)carbamate; starbld0000888; SCHEMBL22567019;
HS Tariff Code
2934.99.9001
存储方式

Powder      -20°C    3 years

                     4°C     2 years

In solvent   -80°C    6 months

                  -20°C    1 month

运输条件
Room temperature (This product is stable at ambient temperature for a few days during ordinary shipping and time spent in Customs)
溶解度数据
溶解度 (体外实验)
DMSO: ~100 mg/mL (~291.9 mM
溶解度 (体内实验)
配方 1 中的溶解度: 2.5 mg/mL (7.30 mM) in 10% DMSO + 40% PEG300 + 5% Tween80 + 45% Saline (这些助溶剂从左到右依次添加,逐一添加), 悬浮液;超声助溶。
例如,若需制备1 mL的工作液,可将100 μL 25.0 mg/mL澄清DMSO储备液加入到400 μL PEG300中,混匀;然后向上述溶液中加入50 μL Tween-80,混匀;加入450 μL生理盐水定容至1 mL。
*生理盐水的制备:将 0.9 g 氯化钠溶解在 100 mL ddH₂O中,得到澄清溶液。

配方 2 中的溶解度: 2.5 mg/mL (7.30 mM) in 10% DMSO + 90% (20% SBE-β-CD in Saline) (这些助溶剂从左到右依次添加,逐一添加), 悬浊液; 超声助溶。
例如,若需制备1 mL的工作液,可将 100 μL 25.0 mg/mL澄清DMSO储备液加入900 μL 20% SBE-β-CD生理盐水溶液中,混匀。
*20% SBE-β-CD 生理盐水溶液的制备(4°C,1 周):将 2 g SBE-β-CD 溶解于 10 mL 生理盐水中,得到澄清溶液。

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配方 3 中的溶解度: ≥ 2.5 mg/mL (7.30 mM) (饱和度未知) in 10% DMSO + 90% Corn Oil (这些助溶剂从左到右依次添加,逐一添加), 澄清溶液。
例如,若需制备1 mL的工作液,可将 100 μL 25.0 mg/mL 澄清 DMSO 储备液加入到 900 μL 玉米油中并混合均匀。


请根据您的实验动物和给药方式选择适当的溶解配方/方案:
1、请先配制澄清的储备液(如:用DMSO配置50 或 100 mg/mL母液(储备液));
2、取适量母液,按从左到右的顺序依次添加助溶剂,澄清后再加入下一助溶剂。以 下列配方为例说明 (注意此配方只用于说明,并不一定代表此产品 的实际溶解配方):
10% DMSO → 40% PEG300 → 5% Tween-80 → 45% ddH2O (或 saline);
假设最终工作液的体积为 1 mL, 浓度为5 mg/mL: 取 100 μL 50 mg/mL 的澄清 DMSO 储备液加到 400 μL PEG300 中,混合均匀/澄清;向上述体系中加入50 μL Tween-80,混合均匀/澄清;然后继续加入450 μL ddH2O (或 saline)定容至 1 mL;

3、溶剂前显示的百分比是指该溶剂在最终溶液/工作液中的体积所占比例;
4、 如产品在配制过程中出现沉淀/析出,可通过加热(≤50℃)或超声的方式助溶;
5、为保证最佳实验结果,工作液请现配现用!
6、如不确定怎么将母液配置成体内动物实验的工作液,请查看说明书或联系我们;
7、 以上所有助溶剂都可在 Invivochem.cn网站购买。
制备储备液 1 mg 5 mg 10 mg
1 mM 2.9188 mL 14.5939 mL 29.1877 mL
5 mM 0.5838 mL 2.9188 mL 5.8375 mL
10 mM 0.2919 mL 1.4594 mL 2.9188 mL

1、根据实验需要选择合适的溶剂配制储备液 (母液):对于大多数产品,InvivoChem推荐用DMSO配置母液 (比如:5、10、20mM或者10、20、50 mg/mL浓度),个别水溶性高的产品可直接溶于水。产品在DMSO 、水或其他溶剂中的具体溶解度详见上”溶解度 (体外)”部分;

2、如果您找不到您想要的溶解度信息,或者很难将产品溶解在溶液中,请联系我们;

3、建议使用下列计算器进行相关计算(摩尔浓度计算器、稀释计算器、分子量计算器、重组计算器等);

4、母液配好之后,将其分装到常规用量,并储存在-20°C或-80°C,尽量减少反复冻融循环。

计算器

摩尔浓度计算器可计算特定溶液所需的质量、体积/浓度,具体如下:

  • 计算制备已知体积和浓度的溶液所需的化合物的质量
  • 计算将已知质量的化合物溶解到所需浓度所需的溶液体积
  • 计算特定体积中已知质量的化合物产生的溶液的浓度
使用摩尔浓度计算器计算摩尔浓度的示例如下所示:
假如化合物的分子量为350.26 g/mol,在5mL DMSO中制备10mM储备液所需的化合物的质量是多少?
  • 在分子量(MW)框中输入350.26
  • 在“浓度”框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在“体积”框中输入5,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案17.513 mg出现在“质量”框中。以类似的方式,您可以计算体积和浓度。

稀释计算器可计算如何稀释已知浓度的储备液。例如,可以输入C1、C2和V2来计算V1,具体如下:

制备25毫升25μM溶液需要多少体积的10 mM储备溶液?
使用方程式C1V1=C2V2,其中C1=10mM,C2=25μM,V2=25 ml,V1未知:
  • 在C1框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在C2框中输入25,然后选择正确的单位(μM)
  • 在V2框中输入25,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案62.5μL(0.1 ml)出现在V1框中
g/mol

分子量计算器可计算化合物的分子量 (摩尔质量)和元素组成,具体如下:

注:化学分子式大小写敏感:C12H18N3O4  c12h18n3o4
计算化合物摩尔质量(分子量)的说明:
  • 要计算化合物的分子量 (摩尔质量),请输入化学/分子式,然后单击“计算”按钮。
分子质量、分子量、摩尔质量和摩尔量的定义:
  • 分子质量(或分子量)是一种物质的一个分子的质量,用统一的原子质量单位(u)表示。(1u等于碳-12中一个原子质量的1/12)
  • 摩尔质量(摩尔重量)是一摩尔物质的质量,以g/mol表示。
/

配液计算器可计算将特定质量的产品配成特定浓度所需的溶剂体积 (配液体积)

  • 输入试剂的质量、所需的配液浓度以及正确的单位
  • 单击“计算”按钮
  • 答案显示在体积框中
动物体内实验配方计算器(澄清溶液)
第一步:请输入基本实验信息(考虑到实验过程中的损耗,建议多配一只动物的药量)
第二步:请输入动物体内配方组成(配方适用于不溶/难溶于水的化合物),不同的产品和批次配方组成不同,如对配方有疑问,可先联系我们提供正确的体内实验配方。此外,请注意这只是一个配方计算器,而不是特定产品的确切配方。
+
+
+

计算结果:

工作液浓度 mg/mL;

DMSO母液配制方法 mg 药物溶于 μL DMSO溶液(母液浓度 mg/mL)。如该浓度超过该批次药物DMSO溶解度,请首先与我们联系。

体内配方配制方法μL DMSO母液,加入 μL PEG300,混匀澄清后加入μL Tween 80,混匀澄清后加入 μL ddH2O,混匀澄清。

(1) 请确保溶液澄清之后,再加入下一种溶剂 (助溶剂) 。可利用涡旋、超声或水浴加热等方法助溶;
            (2) 一定要按顺序加入溶剂 (助溶剂) 。

生物数据图片
  • EBioMedicine . 2019 Nov:49:40-54.
  • EBioMedicine . 2019 Nov:49:40-54.
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