Gentamicin C1a

别名: Gentamycin C1A; Gentamycin C12; Gentamicin Cla; AV4A72IATD; CHEBI:27784; (2R,3R,4R,5R)-2-[(1S,2S,3R,4S,6R)-4,6-diamino-3-[(2R,3R,6S)-3-amino-6-(aminomethyl)oxan-2-yl]oxy-2-hydroxycyclohexyl]oxy-5-methyl-4-(methylamino)oxane-3,5-diol; 庆大霉素C1A溶液;硫酸庆大霉素C1a标准品;庆大霉素;庆大霉素 C1a
目录号: V34769 纯度: ≥98%
庆大霉素C1a是半合成抗生素依替米星的前体,具有抗菌作用。
Gentamicin C1a CAS号: 26098-04-4
产品类别: Bacterial
产品仅用于科学研究,不针对患者销售
规格 价格 库存 数量
5mg
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产品描述
庆大霉素C1a是半合成抗生素依替米星的前体,具有抗菌作用。庆大霉素 C1a 是庆大霉素复合物的主要成分。
生物活性&实验参考方法
靶点
Antibiotic/antibacterial
体外研究 (In Vitro)
庆大霉素 C1a 的 IC50 值为 1 mg/mL,抑制大肠杆菌、铜绿假单胞菌和金黄色葡萄球菌的生长[2]。 OC-k3 细胞活力不受庆大霉素 C1a(2 mM,48 小时)的影响 [2]。
体内研究 (In Vivo)
庆大霉素C1a(4 mg/kg,静脉推注剂量,单剂量)在比格犬中的平均滞留时间为84分钟,CL值为1.81 mL/min/kg[3]。
酶活实验
庆大霉素C1a是半合成抗生素依替米星的前体,在临床上重要的庆大霉素C混合物中具有最高的抗菌活性。为了获得庆大霉素C1a高产菌株,我们灭活了紫色小单孢菌中的gacD基因。通过序列分析推测gacD编码C6'甲基转移酶,并在庆大霉素中间体X2转化为G418中发挥作用。因此,gacD的失活阻断了X2到G418的代谢途径,导致庆大霉素C1a的积累。与野生型菌株相比,所得重组菌株产生的庆大霉素C1a是野生型菌株的10倍以上。此外,野生型菌株产生4种主要生产成分C1a、C2、C2a和C1,而重组菌株仅产生2种成分C1a和C2b,使庆大霉素C1a的纯化更容易。重组菌株遗传稳定,可用于庆大霉素C1a的工业生产。[1]
细胞实验
抗菌素耐药性的蔓延和新型抗生素的短缺导致了对新型抗菌药物的迫切需求。尽管氨基糖苷类抗生素(AG)是非常有效的抗感染药物,但由于严重的副作用,主要是肾毒性和耳毒性,它们的使用在很大程度上受到限制。我们根据其对ESKAPE小组多重耐药临床分离株(庆大霉素、庆大霉素C1a、阿普霉素、巴龙霉素和新霉素)的强抗菌活性,评估了从一组较大的AGs中选择的各种AGs的耳毒性。在局部圆窗应用后,AGs对外毛细胞存活和复合动作电位的剂量依赖性影响表明庆大霉素C1a和阿普霉素的毒性最小。值得注意的是,尽管在用低浓度新霉素、庆大霉素和巴龙霉素治疗后,复合动作电位阈值和外毛细胞存活率没有变化,但内毛细胞突触带的数量和复合动作电位振幅都有所减少。在这种浓度下,庆大霉素C1a或阿普霉素没有观察到这种隐性听力损失的迹象。这些发现将内毛细胞确定为AG治疗中最脆弱的元素,表明庆大霉素C1a和阿普霉素是开发临床有用抗生素的有前景的基础[2]。
动物实验
The pharmacokinetics of gentamicin C(1), C(2), and C(1a) were studied in six beagles after administration of gentamicin at 4 mg/kg of body weight as a single intravenous bolus dose. Plasma concentrations of the gentamicin components were analyzed with a novel high-performance liquid chromatography method capable of identifying and quantifying each of the components. The pharmacokinetic analysis of the plasma concentration-versus-time data was performed using the noncompartmental approach. The results indicated significant differences in the pharmacokinetic characteristics between the gentamicin components C(1), C(1a), and C(2). The mean residence times of gentamicin C(1), C(1a), and C(2) were 81+/-13, 84+/-12, and 79+/-13 min (mean +/- standard deviation), respectively. The half-lives of the respective components were 64+/-12, 66+/-12 and 63+/-12 min. Clearance (CL) of gentamicin C(1), 4.62+/-0.71 ml min(-1) kg(-1), was significantly higher (P = 0.0156) than CL of gentamicin C(1a), 1.81+/-0.26 ml min(-1) kg(-1), and C(2), 1.82+/-0.25 ml min(-1) kg(-1). Similarly, the volume of distribution at steady state (V(ss)) of gentamicin C(1), 0.36+/-0.04 liter kg(-1), was significantly higher (P = 0.0156) than the V(ss) of gentamicin C(1a), 0.14+/-0.01 liter kg(-1), and C(2), 0.15+/-0.02 liter kg(-1). Tissue binding was considered the most likely cause for the difference. The difference may have clinical and toxicological significance.[3]
参考文献
[1]. Li D, et al. Construction of a gentamicin C1a-overproducing strain of Micromonospora purpurea by inactivation of the gacD gene. Microbiol Res. 2013 Jun 12;168(5):263-7.
[2]. Ishikawa M, et al. Lower ototoxicity and absence of hidden hearing loss point to gentamicin C1a and apramycin as promising antibiotics for clinical use. Sci Rep. 2019 Feb 20;9(1):2410.
[3]. Isoherranen N, et al. Pharmacokinetics of gentamicin C(1), C(1a), and C(2) in beagles after a single intravenous dose. Antimicrob Agents Chemother. 2000 Jun;44(6):1443-7.
其他信息
Gentamycin C1a is a gentamycin C. It is a conjugate base of a gentamycin C1a(5+).
Gentamicin C1a has been reported in Cordyceps farinosa, Serratia plymuthica, and other organisms with data available.
Gentamicin C1a is one of the major components of the gentamicin complex. Gentamicin C1a lacks methyl groups on the 2-amino-hexose ring and has a free amine at the 6' position.
*注: 文献方法仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些方法的准确性
化学信息 & 存储运输条件
分子式
C19H39N5O7
分子量
449.54
精确质量
449.285
CAS号
26098-04-4
PubChem CID
72396
外观&性状
Typically exists as White to off-white solid at room temperature
密度
1.36g/cm3
沸点
675.2ºC at 760 mmHg
熔点
102-108ºC
闪点
362.1ºC
蒸汽压
3.97E-21mmHg at 25°C
折射率
1.603
LogP
-5
tPSA
213.72
氢键供体(HBD)数目
8
氢键受体(HBA)数目
12
可旋转键数目(RBC)
6
重原子数目
31
分子复杂度/Complexity
592
定义原子立体中心数目
12
SMILES
[NH3+]CC1CCC([NH3+])C(OC2C([NH3+])CC([NH3+])C(OC3OCC(C)(O)C([NH2+]C)C3O)C2O)O1
InChi Key
VEGXETMJINRLTH-BOZYPMBZSA-N
InChi Code
InChI=1S/C19H39N5O7/c1-19(27)7-28-18(13(26)16(19)24-2)31-15-11(23)5-10(22)14(12(15)25)30-17-9(21)4-3-8(6-20)29-17/h8-18,24-27H,3-7,20-23H2,1-2H3/t8-,9+,10-,11+,12-,13+,14+,15-,16+,17+,18+,19-/m0/s1
化学名
(2R,3R,4R,5R)-2-[(1S,2S,3R,4S,6R)-4,6-diamino-3-[(2R,3R,6S)-3-amino-6-(aminomethyl)oxan-2-yl]oxy-2-hydroxycyclohexyl]oxy-5-methyl-4-(methylamino)oxane-3,5-diol
别名
Gentamycin C1A; Gentamycin C12; Gentamicin Cla; AV4A72IATD; CHEBI:27784; (2R,3R,4R,5R)-2-[(1S,2S,3R,4S,6R)-4,6-diamino-3-[(2R,3R,6S)-3-amino-6-(aminomethyl)oxan-2-yl]oxy-2-hydroxycyclohexyl]oxy-5-methyl-4-(methylamino)oxane-3,5-diol;
HS Tariff Code
2934.99.9001
存储方式

Powder      -20°C    3 years

                     4°C     2 years

In solvent   -80°C    6 months

                  -20°C    1 month

注意: 本产品在运输和储存过程中需避光。
运输条件
Room temperature (This product is stable at ambient temperature for a few days during ordinary shipping and time spent in Customs)
溶解度数据
溶解度 (体外实验)
H2O : 250 mg/mL (556.12 mM)
溶解度 (体内实验)
注意: 如下所列的是一些常用的体内动物实验溶解配方,主要用于溶解难溶或不溶于水的产品(水溶度<1 mg/mL)。 建议您先取少量样品进行尝试,如该配方可行,再根据实验需求增加样品量。

注射用配方
(IP/IV/IM/SC等)
注射用配方1: DMSO : Tween 80: Saline = 10 : 5 : 85 (如: 100 μL DMSO 50 μL Tween 80 850 μL Saline)
*生理盐水/Saline的制备:将0.9g氯化钠/NaCl溶解在100 mL ddH ₂ O中,得到澄清溶液。
注射用配方 2: DMSO : PEG300Tween 80 : Saline = 10 : 40 : 5 : 45 (如: 100 μL DMSO 400 μL PEG300 50 μL Tween 80 450 μL Saline)
注射用配方 3: DMSO : Corn oil = 10 : 90 (如: 100 μL DMSO 900 μL Corn oil)
示例: 注射用配方 3 (DMSO : Corn oil = 10 : 90) 为例说明, 如果要配制 1 mL 2.5 mg/mL的工作液, 您可以取 100 μL 25 mg/mL 澄清的 DMSO 储备液,加到 900 μL Corn oil/玉米油中, 混合均匀。
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注射用配方 4: DMSO : 20% SBE-β-CD in Saline = 10 : 90 [如:100 μL DMSO 900 μL (20% SBE-β-CD in Saline)]
*20% SBE-β-CD in Saline的制备(4°C,储存1周):将2g SBE-β-CD (磺丁基-β-环糊精) 溶解于10mL生理盐水中,得到澄清溶液。
注射用配方 5: 2-Hydroxypropyl-β-cyclodextrin : Saline = 50 : 50 (如: 500 μL 2-Hydroxypropyl-β-cyclodextrin (羟丙基环胡精) 500 μL Saline)
注射用配方 6: DMSO : PEG300 : Castor oil : Saline = 5 : 10 : 20 : 65 (如: 50 μL DMSO 100 μL PEG300 200 μL Castor oil 650 μL Saline)
注射用配方 7: Ethanol : Cremophor : Saline = 10: 10 : 80 (如: 100 μL Ethanol 100 μL Cremophor 800 μL Saline)
注射用配方 8: 溶解于Cremophor/Ethanol (50 : 50), 然后用生理盐水稀释。
注射用配方 9: EtOH : Corn oil = 10 : 90 (如: 100 μL EtOH 900 μL Corn oil)
注射用配方 10: EtOH : PEG300Tween 80 : Saline = 10 : 40 : 5 : 45 (如: 100 μL EtOH 400 μL PEG300 50 μL Tween 80 450 μL Saline)


口服配方
口服配方 1: 悬浮于0.5% CMC Na (羧甲基纤维素钠)
口服配方 2: 悬浮于0.5% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素)
示例: 口服配方 1 (悬浮于 0.5% CMC Na)为例说明, 如果要配制 100 mL 2.5 mg/mL 的工作液, 您可以先取0.5g CMC Na并将其溶解于100mL ddH2O中,得到0.5%CMC-Na澄清溶液;然后将250 mg待测化合物加到100 mL前述 0.5%CMC Na溶液中,得到悬浮液。
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口服配方 3: 溶解于 PEG400 (聚乙二醇400)
口服配方 4: 悬浮于0.2% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素)
口服配方 5: 溶解于0.25% Tween 80 and 0.5% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素)
口服配方 6: 做成粉末与食物混合


注意: 以上为较为常见方法,仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些配方的准确性。具体溶剂的选择首先应参照文献已报道溶解方法、配方或剂型,对于某些尚未有文献报道溶解方法的化合物,需通过前期实验来确定(建议先取少量样品进行尝试),包括产品的溶解情况、梯度设置、动物的耐受性等。

请根据您的实验动物和给药方式选择适当的溶解配方/方案:
1、请先配制澄清的储备液(如:用DMSO配置50 或 100 mg/mL母液(储备液));
2、取适量母液,按从左到右的顺序依次添加助溶剂,澄清后再加入下一助溶剂。以 下列配方为例说明 (注意此配方只用于说明,并不一定代表此产品 的实际溶解配方):
10% DMSO → 40% PEG300 → 5% Tween-80 → 45% ddH2O (或 saline);
假设最终工作液的体积为 1 mL, 浓度为5 mg/mL: 取 100 μL 50 mg/mL 的澄清 DMSO 储备液加到 400 μL PEG300 中,混合均匀/澄清;向上述体系中加入50 μL Tween-80,混合均匀/澄清;然后继续加入450 μL ddH2O (或 saline)定容至 1 mL;

3、溶剂前显示的百分比是指该溶剂在最终溶液/工作液中的体积所占比例;
4、 如产品在配制过程中出现沉淀/析出,可通过加热(≤50℃)或超声的方式助溶;
5、为保证最佳实验结果,工作液请现配现用!
6、如不确定怎么将母液配置成体内动物实验的工作液,请查看说明书或联系我们;
7、 以上所有助溶剂都可在 Invivochem.cn网站购买。
制备储备液 1 mg 5 mg 10 mg
1 mM 2.2245 mL 11.1225 mL 22.2450 mL
5 mM 0.4449 mL 2.2245 mL 4.4490 mL
10 mM 0.2224 mL 1.1122 mL 2.2245 mL

1、根据实验需要选择合适的溶剂配制储备液 (母液):对于大多数产品,InvivoChem推荐用DMSO配置母液 (比如:5、10、20mM或者10、20、50 mg/mL浓度),个别水溶性高的产品可直接溶于水。产品在DMSO 、水或其他溶剂中的具体溶解度详见上”溶解度 (体外)”部分;

2、如果您找不到您想要的溶解度信息,或者很难将产品溶解在溶液中,请联系我们;

3、建议使用下列计算器进行相关计算(摩尔浓度计算器、稀释计算器、分子量计算器、重组计算器等);

4、母液配好之后,将其分装到常规用量,并储存在-20°C或-80°C,尽量减少反复冻融循环。

计算器

摩尔浓度计算器可计算特定溶液所需的质量、体积/浓度,具体如下:

  • 计算制备已知体积和浓度的溶液所需的化合物的质量
  • 计算将已知质量的化合物溶解到所需浓度所需的溶液体积
  • 计算特定体积中已知质量的化合物产生的溶液的浓度
使用摩尔浓度计算器计算摩尔浓度的示例如下所示:
假如化合物的分子量为350.26 g/mol,在5mL DMSO中制备10mM储备液所需的化合物的质量是多少?
  • 在分子量(MW)框中输入350.26
  • 在“浓度”框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在“体积”框中输入5,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案17.513 mg出现在“质量”框中。以类似的方式,您可以计算体积和浓度。

稀释计算器可计算如何稀释已知浓度的储备液。例如,可以输入C1、C2和V2来计算V1,具体如下:

制备25毫升25μM溶液需要多少体积的10 mM储备溶液?
使用方程式C1V1=C2V2,其中C1=10mM,C2=25μM,V2=25 ml,V1未知:
  • 在C1框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在C2框中输入25,然后选择正确的单位(μM)
  • 在V2框中输入25,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案62.5μL(0.1 ml)出现在V1框中
g/mol

分子量计算器可计算化合物的分子量 (摩尔质量)和元素组成,具体如下:

注:化学分子式大小写敏感:C12H18N3O4  c12h18n3o4
计算化合物摩尔质量(分子量)的说明:
  • 要计算化合物的分子量 (摩尔质量),请输入化学/分子式,然后单击“计算”按钮。
分子质量、分子量、摩尔质量和摩尔量的定义:
  • 分子质量(或分子量)是一种物质的一个分子的质量,用统一的原子质量单位(u)表示。(1u等于碳-12中一个原子质量的1/12)
  • 摩尔质量(摩尔重量)是一摩尔物质的质量,以g/mol表示。
/

配液计算器可计算将特定质量的产品配成特定浓度所需的溶剂体积 (配液体积)

  • 输入试剂的质量、所需的配液浓度以及正确的单位
  • 单击“计算”按钮
  • 答案显示在体积框中
动物体内实验配方计算器(澄清溶液)
第一步:请输入基本实验信息(考虑到实验过程中的损耗,建议多配一只动物的药量)
第二步:请输入动物体内配方组成(配方适用于不溶/难溶于水的化合物),不同的产品和批次配方组成不同,如对配方有疑问,可先联系我们提供正确的体内实验配方。此外,请注意这只是一个配方计算器,而不是特定产品的确切配方。
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计算结果:

工作液浓度 mg/mL;

DMSO母液配制方法 mg 药物溶于 μL DMSO溶液(母液浓度 mg/mL)。如该浓度超过该批次药物DMSO溶解度,请首先与我们联系。

体内配方配制方法μL DMSO母液,加入 μL PEG300,混匀澄清后加入μL Tween 80,混匀澄清后加入 μL ddH2O,混匀澄清。

(1) 请确保溶液澄清之后,再加入下一种溶剂 (助溶剂) 。可利用涡旋、超声或水浴加热等方法助溶;
            (2) 一定要按顺序加入溶剂 (助溶剂) 。

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