1-NM-PP1

别名: 1NM PP1; 1NM-PP1; 1NMPP1l PP1 analog II 4-氨基-1-叔丁基-3-(1’-萘甲基)吡唑[3,4-d]嘧啶; 4-氨基-1-叔丁基-3-(1-萘甲基)吡唑并[3,4-d]嘧啶; 4-氨基1-叔丁基-3-(1'-萘甲基)吡唑并[3,4-D]嘧啶
目录号: V3628 纯度: ≥98%
1-NM-PP1 是 PP1 的 C3 修饰类似物,是一种新型、有效且细胞可渗透的蛋白激酶 D (PKD) 抑制剂,IC50 为 0.398 μM。1-NM-PP1 已显示出对已被证实的蛋白激酶的选择性抑制作用。 v-Src、c-Fyn、c-Abl、CDK2 突变,IC50 值为 28 μM、1.0 μM、3.4 μM、29 μM、24 μM、4.3 nM、3.2 nM、120 nM、5 nM 和 8 nM,分别为 CAMKII、v-Src-as1、c-Fyn-as1、cAbl-as2、CDK2-as1 和 CAMKII-as1。
1-NM-PP1 CAS号: 221244-14-0
产品类别: Src
产品仅用于科学研究,不针对患者销售
规格 价格 库存 数量
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纯度/质量控制文件

纯度: ≥98%

产品描述
1-NM-PP1 是 PP1 的 C3 修饰类似物,是一种新型、有效的细胞渗透性蛋白激酶 D (PKD) 抑制剂,IC50 为 0.398 μM。 1-NM-PP1 对突变的蛋白激酶具有选择性抑制作用,IC50 值为 28 μM、1.0 μM、3.4 μM、29 μM、24 μM、4.3 nM、3.2 nM、120 nM、5 nM 和 8 v-Src、c-Fyn、c-Abl、CDK2、CAMKII、v-Src-as1、c-Fyn-as1、cAbl-as2、CDK2-as1 和 CAMKII-as1 分别为 nM。 1-NM-PP1 在低纳摩尔浓度下抑制五种靶激酶中的每一种,与最容易抑制的野生型激酶相比,靶特异性范围为 85 倍至 400 倍。此外,体外研究还表明,Cdc28-as1对1-NM-PP1高度敏感,ATP动力学Km值为35 μM和322 μM,Kcat值为132 min-1和21.3 min-1, Cdc28/Clb2 和 Cdc28-as1/Clb2 的 Kcat/Km 值分别为 3.7 和 0.066,IC50 值分别为 22 μM 和 0.002 μM
生物活性&实验参考方法
靶点
VEGFR1 (IC50 = 4.3 nM); c-Fyn-as1 (IC50 = 3.2 nM); v-Src (IC50 = 28 μM); c-Fyn (IC50 = 1 μM); c-Abl (IC50 = 3.4 μM); CDK2 (IC50 = 29 μM); CAMKII (IC50 = 24 μM); cAbl-as2 (IC50 = 120 nM); CDK2-as1 (IC50 = 5 nM); CAMKII-as1 (IC50 = 8 nM)
体外研究 (In Vitro)
来自 Cdk7as/as 或 Cdk7+/+ 细胞的 Cdk7 进行免疫沉淀,并针对人 Cdk2 和含有 Pol II CTD 的融合蛋白 (GST- CTD)。任一底物的 IC50 约为 50 nM,1-NM-PP1 (1-NMPP1) 会抑制从突变细胞中回收的 Cdk7,但不能从野生型细胞中回收。当 Cdk7as/as 替代野生型 Cdk7 时,HCT116 细胞的生长对 1-NM-PP1 变得敏感。在没有 1-NM-PP1 的情况下,野生型和 Cdk7as/as 细胞的群体倍增时间分别约为 17.9 和 20.2 小时,在异步培养中具有相似的细胞周期分布,这表明 F91G 突变对 Cdk7 功能本身的损害很小。纯合 Cdk7as/as 细胞对 1-NM-PP1 表现出敏感性,1-NM-PP1 暴露 96 小时后进行的细胞活力 (MTT) 测定表明,IC50 约为 100 nM 。另一方面,野生型 HCT116 细胞对 10 μM 1-NM-PP1 具有抗性。当添加 10 μM 1-NM-PP1 时,突变细胞的 G1/S 进程被延缓,但野生型细胞则不然。当 1-NM-PP1 与血清同时添加到 Cdk7as/as 细胞中时,它会阻止细胞在接下来的 15 小时内进入 S 期。一部分 Cdk7as/as 细胞从血清饥饿中释放出来,直接放入含有 1-NM-PP1 的培养基中,24 小时后显示出进展到 S 期的证据,而一部分细胞则停留在G1。添加血清后 3 或 6 小时添加 1-NM-PP1,这会导致进入 S 期延迟约 7 或约 3 小时[3]。
酶活实验
进行免疫复合物激酶测定、免疫印迹和免疫沉淀。将用于再生 ATP 的系统与 500 ng 纯化的细胞周期蛋白 B1(氨基末端标记有六组氨酸和 Myc 表位)一起添加到有丝分裂或 G2 细胞的提取物(200 μg 总蛋白)中。使用 2 μM 1-NM-PP1 或 DMSO 进行预孵育。当需要时,将 400 ng 纯化的 Csk1 或 600 ng 野生型或类似物敏感的 T 环磷酸化 Cdk7/cyclin H/Mat1 复合物添加到孵育中。该过程包括让 Myc-cyclin B 和相关蛋白质在室温下静置 90 分钟。然后,使用抗 Myc 和抗 Cdk1 抗体对免疫复合物进行免疫沉淀,并评估其组蛋白 H1 激酶活性 [3]。
细胞实验
在无血清培养基中孵育 48 小时后,野生型或 Cdk7as/as HCT116 细胞同步化并释放到含有 10% 胎牛血清的培养基中。使用流式细胞术分析细胞周期分布,并进行胸苷或诺考达唑同步。 MTT 测定用于确定细胞活力[3]。
参考文献

[1]. Generation of Monospecific Nanomolar Tyrosine Kinase Inhibitors via a Chemical Genetic Approach. Journal of the American Chemical Society, 1999, 121(4):627-631.

[2]. A chemical switch for inhibitor-sensitive alleles of any protein kinase. Nature. 2000 Sep 21;407(6802):395-401.

[3]. Requirements for Cdk7 in the assembly of Cdk1/cyclin B and activation of Cdk2 revealed by chemical genetics in human cells. Mol Cell. 2007 Mar 23;25(6):839-50.

其他信息
1-NM-PP1 is a pyrazolopyrimidine. It has a role as a tyrosine kinase inhibitor.
*注: 文献方法仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些方法的准确性
化学信息 & 存储运输条件
分子式
C20H21N5
分子量
331.4142
精确质量
331.179
元素分析
C, 72.48; H, 6.39; N, 21.13
CAS号
221244-14-0
相关CAS号
221244-14-0
PubChem CID
5154691
外观&性状
white solid powder
密度
1.3±0.1 g/cm3
沸点
545.7±45.0 °C at 760 mmHg
熔点
175-176ºC
闪点
283.8±28.7 °C
蒸汽压
0.0±1.5 mmHg at 25°C
折射率
1.675
LogP
3.96
tPSA
69.62
氢键供体(HBD)数目
1
氢键受体(HBA)数目
4
可旋转键数目(RBC)
3
重原子数目
25
分子复杂度/Complexity
462
定义原子立体中心数目
0
SMILES
N1(C2C(=C(N([H])[H])N=C([H])N=2)C(C([H])([H])C2=C([H])C([H])=C([H])C3=C([H])C([H])=C([H])C([H])=C23)=N1)C(C([H])([H])[H])(C([H])([H])[H])C([H])([H])[H]
InChi Key
GDQXJQSQYMMKRA-UHFFFAOYSA-N
InChi Code
InChI=1S/C20H21N5/c1-20(2,3)25-19-17(18(21)22-12-23-19)16(24-25)11-14-9-6-8-13-7-4-5-10-15(13)14/h4-10,12H,11H2,1-3H3,(H2,21,22,23)
化学名
1-tert-butyl-3-(naphthalen-1-ylmethyl)pyrazolo[3,4-d]pyrimidin-4-amine
别名
1NM PP1; 1NM-PP1; 1NMPP1l PP1 analog II
HS Tariff Code
2934.99.9001
存储方式

Powder      -20°C    3 years

                     4°C     2 years

In solvent   -80°C    6 months

                  -20°C    1 month

运输条件
Room temperature (This product is stable at ambient temperature for a few days during ordinary shipping and time spent in Customs)
溶解度数据
溶解度 (体外实验)
DMSO: ~27.5 mg/mL (~82.9 mM)
溶解度 (体内实验)
配方 1 中的溶解度: ≥ 2.5 mg/mL (7.54 mM) (饱和度未知) in 10% DMSO + 40% PEG300 + 5% Tween80 + 45% Saline (这些助溶剂从左到右依次添加,逐一添加), 澄清溶液。
例如,若需制备1 mL的工作液,可将100 μL 25.0 mg/mL澄清DMSO储备液加入到400 μL PEG300中,混匀;然后向上述溶液中加入50 μL Tween-80,混匀;加入450 μL生理盐水定容至1 mL。
*生理盐水的制备:将 0.9 g 氯化钠溶解在 100 mL ddH₂O中,得到澄清溶液。

配方 2 中的溶解度: ≥ 2.5 mg/mL (7.54 mM) (饱和度未知) in 10% DMSO + 90% Corn Oil (这些助溶剂从左到右依次添加,逐一添加), 澄清溶液。
例如,若需制备1 mL的工作液,可将 100 μL 25.0 mg/mL 澄清 DMSO 储备液加入到 900 μL 玉米油中并混合均匀。

请根据您的实验动物和给药方式选择适当的溶解配方/方案:
1、请先配制澄清的储备液(如:用DMSO配置50 或 100 mg/mL母液(储备液));
2、取适量母液,按从左到右的顺序依次添加助溶剂,澄清后再加入下一助溶剂。以 下列配方为例说明 (注意此配方只用于说明,并不一定代表此产品 的实际溶解配方):
10% DMSO → 40% PEG300 → 5% Tween-80 → 45% ddH2O (或 saline);
假设最终工作液的体积为 1 mL, 浓度为5 mg/mL: 取 100 μL 50 mg/mL 的澄清 DMSO 储备液加到 400 μL PEG300 中,混合均匀/澄清;向上述体系中加入50 μL Tween-80,混合均匀/澄清;然后继续加入450 μL ddH2O (或 saline)定容至 1 mL;

3、溶剂前显示的百分比是指该溶剂在最终溶液/工作液中的体积所占比例;
4、 如产品在配制过程中出现沉淀/析出,可通过加热(≤50℃)或超声的方式助溶;
5、为保证最佳实验结果,工作液请现配现用!
6、如不确定怎么将母液配置成体内动物实验的工作液,请查看说明书或联系我们;
7、 以上所有助溶剂都可在 Invivochem.cn网站购买。
制备储备液 1 mg 5 mg 10 mg
1 mM 3.0174 mL 15.0871 mL 30.1741 mL
5 mM 0.6035 mL 3.0174 mL 6.0348 mL
10 mM 0.3017 mL 1.5087 mL 3.0174 mL

1、根据实验需要选择合适的溶剂配制储备液 (母液):对于大多数产品,InvivoChem推荐用DMSO配置母液 (比如:5、10、20mM或者10、20、50 mg/mL浓度),个别水溶性高的产品可直接溶于水。产品在DMSO 、水或其他溶剂中的具体溶解度详见上”溶解度 (体外)”部分;

2、如果您找不到您想要的溶解度信息,或者很难将产品溶解在溶液中,请联系我们;

3、建议使用下列计算器进行相关计算(摩尔浓度计算器、稀释计算器、分子量计算器、重组计算器等);

4、母液配好之后,将其分装到常规用量,并储存在-20°C或-80°C,尽量减少反复冻融循环。

计算器

摩尔浓度计算器可计算特定溶液所需的质量、体积/浓度,具体如下:

  • 计算制备已知体积和浓度的溶液所需的化合物的质量
  • 计算将已知质量的化合物溶解到所需浓度所需的溶液体积
  • 计算特定体积中已知质量的化合物产生的溶液的浓度
使用摩尔浓度计算器计算摩尔浓度的示例如下所示:
假如化合物的分子量为350.26 g/mol,在5mL DMSO中制备10mM储备液所需的化合物的质量是多少?
  • 在分子量(MW)框中输入350.26
  • 在“浓度”框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在“体积”框中输入5,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案17.513 mg出现在“质量”框中。以类似的方式,您可以计算体积和浓度。

稀释计算器可计算如何稀释已知浓度的储备液。例如,可以输入C1、C2和V2来计算V1,具体如下:

制备25毫升25μM溶液需要多少体积的10 mM储备溶液?
使用方程式C1V1=C2V2,其中C1=10mM,C2=25μM,V2=25 ml,V1未知:
  • 在C1框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在C2框中输入25,然后选择正确的单位(μM)
  • 在V2框中输入25,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案62.5μL(0.1 ml)出现在V1框中
g/mol

分子量计算器可计算化合物的分子量 (摩尔质量)和元素组成,具体如下:

注:化学分子式大小写敏感:C12H18N3O4  c12h18n3o4
计算化合物摩尔质量(分子量)的说明:
  • 要计算化合物的分子量 (摩尔质量),请输入化学/分子式,然后单击“计算”按钮。
分子质量、分子量、摩尔质量和摩尔量的定义:
  • 分子质量(或分子量)是一种物质的一个分子的质量,用统一的原子质量单位(u)表示。(1u等于碳-12中一个原子质量的1/12)
  • 摩尔质量(摩尔重量)是一摩尔物质的质量,以g/mol表示。
/

配液计算器可计算将特定质量的产品配成特定浓度所需的溶剂体积 (配液体积)

  • 输入试剂的质量、所需的配液浓度以及正确的单位
  • 单击“计算”按钮
  • 答案显示在体积框中
动物体内实验配方计算器(澄清溶液)
第一步:请输入基本实验信息(考虑到实验过程中的损耗,建议多配一只动物的药量)
第二步:请输入动物体内配方组成(配方适用于不溶/难溶于水的化合物),不同的产品和批次配方组成不同,如对配方有疑问,可先联系我们提供正确的体内实验配方。此外,请注意这只是一个配方计算器,而不是特定产品的确切配方。
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计算结果:

工作液浓度 mg/mL;

DMSO母液配制方法 mg 药物溶于 μL DMSO溶液(母液浓度 mg/mL)。如该浓度超过该批次药物DMSO溶解度,请首先与我们联系。

体内配方配制方法μL DMSO母液,加入 μL PEG300,混匀澄清后加入μL Tween 80,混匀澄清后加入 μL ddH2O,混匀澄清。

(1) 请确保溶液澄清之后,再加入下一种溶剂 (助溶剂) 。可利用涡旋、超声或水浴加热等方法助溶;
            (2) 一定要按顺序加入溶剂 (助溶剂) 。

生物数据图片
  • Mol Cell . 2007 Mar 23;25(6):839-50.
  • Mol Cell . 2007 Mar 23;25(6):839-50.
  • Mol Cell . 2007 Mar 23;25(6):839-50.
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